用于食道癌的分子诊断测试制造技术

提供鉴别用于食道腺癌(OAC)的分子诊断测试的方法和组合物。该测试定义了新的DNA损伤修复缺陷分子亚型，并使得能够在该亚型内对患者进行分类。本发明专利技术可用于在施用任何化疗之前确定OAC患者在临床上对治疗方案有响应还是无响应。该测试可以与直接或间接影响DNA损伤或修复的不同药物，例如许多目前正在使用的标准细胞毒性化疗药物一起使用。特别地，本发明专利技术涉及预测标志物的特定组合，其中预测标志物的表达与对治疗方案的响应性或无响应性相关联。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】201480059197

【技术保护点】
预测患有食道腺癌(OAC)的个体对用DNA损伤治疗剂进行的治疗的响应性的方法，包括：a.测量由所述个体获得的测试样品中的一个或多个生物标志物的表达水平，其中所述一个或多个生物标志物选自表2B、1A、1B、2A、3和/或4；b.得到记录表达水平的测试得分；c.提供阈值得分，其包含将测试得分与响应性相关联的信息；d.以及将测试得分与阈值得分相比较；其中当测试得分超过阈值得分时预测为有响应性，和/或当测试得分未超过阈值得分时，预测为无响应性。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2013.09.09 GB 1316027.01.预测患有食道腺癌(OAC)的个体对用DNA损伤治疗剂进行的治疗的响应性的方法，包括：a.测量由所述个体获得的测试样品中的一个或多个生物标志物的表达水平，其中所述一个或多个生物标志物选自表2B、1A、1B、2A、3和/或4；b.得到记录表达水平的测试得分；c.提供阈值得分，其包含将测试得分与响应性相关联的信息；d.以及将测试得分与阈值得分相比较；其中当测试得分超过阈值得分时预测为有响应性，和/或当测试得分未超过阈值得分时，预测为无响应性。2.权利要求1的方法，其中所述一个或多个生物标志物选自由CXCL10、MX1、IDO1、IF144L、CD2、GBP5、PRAME、ITGAL、LRP4和APOL3组成的组，和/或由CDR1、FYB、TSPAN7、RAC2、KLHDC7B、GRB14、AC138128.1、KIF26A、CD274、CD109、ETV7、MFAP5、OLFM4、PI15、FOSB、FAM19A5、NLRC5、PRICKLE1、EGR1、CLDN10、ADAMTS4、SP140L、ANXA1、RSAD2、ESR1、IKZF3、OR2l1P、EGFR、NAT1、LATS2、CYP2B6、PTPRC、PPP1R1A和AL137218.1组成的组。3.权利要求2的方法，包括测量全部生物标志物的表达水平。4.权利要求1-3任一项的方法，其中使用引物和/或探针测量表达水平，所述引物和/或探针与表1A(SEQ ID NO:1-24)、表1B(SEQ ID NO:25-50)和/或表3(SEQ ID NO:51-230)所示的靶序列的至少之一结合。5.权利要求1-4任一项的方法，其中OAC是早期、晚期或转移性疾病。6.权利要求1-5任一项的方法，其中DNA损伤治疗剂包含选自由DNA损伤剂、DNA修复靶向疗法、DNA损伤信号传导抑制剂、DNA损伤诱导的细胞周期停滞的抑制剂、组蛋白脱乙酰酶抑制剂、热休克蛋白抑制剂和DNA合成抑制剂组成的组的一种或多种物质。7.权利要求6的方法，其中DNA损伤治疗剂包括含铂的剂、核苷类似物例如吉西他滨或5-氟脲嘧啶或其前药例如卡培他滨、蒽环霉素例如表阿霉素或阿霉素、烷化剂例如环磷酰胺、电离辐射或辐射和化疗的组合(放化疗)的一种或多种。8.权利要求1-7任一项的方法，其中DNA损伤治疗剂包括含铂的剂。9.权利要求8的方法，其中基于铂的剂选自顺铂、卡铂和奥沙利铂。10.权利要求1-9任一项的方法，其预测对于用DNA损伤治疗剂和其它疗法一起进行的治疗的响应性。11.权利要求10的方法，其中其它疗法是有丝分裂剂。12.权利要求11的方法，其中有丝分裂抑制剂是长春花生物碱或紫杉烷。13.权利要求12的方法，其中长春花生物碱是长春瑞滨。14.权利要求12的方法，其中紫杉烷是紫杉醇或多西紫杉醇。15.权利要求1-9任一项的方法，其预测对包含DNA损伤治疗剂的组合疗法的响应性，其中所述组合疗法选自：a.顺铂/卡铂和5-氟脲嘧啶b.顺铂/卡铂和卡培他滨c.表阿霉素/阿霉素、顺...

【专利技术属性】
技术研发人员：K·基廷，L·希尔，S·德哈罗，E·奥布莱恩，T·达维森，P·哈金，R·肯尼迪，J·奥唐奈，
申请(专利权)人：阿尔玛克诊断有限公司，
类型：发明
国别省市：英国;GB