通过利用靶向反转录转座子的靶位点重复(TSD)序列的小-引物策略，无关插入元件的大小，包括SINE、LINE和SVA的INNUL标志物都可有效地用作用于人鉴定和生物祖系研究的标志物。可大幅降低用于INNUL的扩增子大小以及等位基因状态之间的差异，使得这些标志物对于分析高品质或低品质的人DNA样品有效。成功地设计了以四颜色检测的对DNA进行单管扩增的15种RE标志物和珐琅蛋白(用于性别决定)多路复合。该多路复合提供了适于法医学和亲子分析的辨别力。此外，该检测的灵敏度可使得能够对法医学样品和人类学样品进行人身份和生物祖系研究。根据全球群体中的等位基因分布，可选择INNUL用于人身份测试或用于生物祖系研究。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】【专利说明】用于使用散在遗传元件进行遗传检测的方法：多路复合的 DNA分析系统 对优先权的要求 本申请根据35 U.S.C. § 119,引用、并入且要求较早前于2012年10月15日提 交到美国专利和商标局并在当时分配了序列号61/714, 088的申请METHOD FOR GENETIC DETECTION USING INTERSPERSED GENETIC ELEMENTS:A MULTIPLEXED DNA ANALYSIS SYSTEM(用于使用散在遗传元件进行遗传检测的方法：多路复合的DNA分析系统）的所有 权益。
本专利技术总体涉及人鉴定和生物祖系测试，并且更具体地，涉及在分析用于人身份 测试或用于生物祖系研宄的人DNA样品期间提高检测灵敏度的改进。 专利技术背景 短串联重复（STR)位点是用于人身份测试的主要遗传标志物。这些标志 物是高多态性的，并且提供了高检测灵敏度，使得可分析相对较低的模板DNA量 (Ing 至 250pg) (Andersen, J. F.等，Further validation of a multiplex STR system for use in routine forensic identity testing, Forensic Science International，78(I):47-64(1996) ；Brinkmann, B.等，Mutation rate in human microsatellites: influence of the structure and length of the tandem repeat, The American Journal of Human Genetics，62 (6) :1408-1415 (1998) ;Collins，P.J.等， Developmental validation of a single-tube Amplification of the 13C0DIS STR Loci，D2S1338，D19S433, and amelogenin:The Identifller? ?CR Amplification Kit, Journal of Forensic Sciences，49 (6) :1265-1277 (2004)； LaFountain，M.J.等，TWGDAM Validation of the AmpFeSTR Profiler Plus and AmpFeSTR COfiler STR Multiplex Systems Using Capillary Electrophoresis, Journal of Forensic Sciences, 46 (5) : 1191-1198 (2001) ；Micka, K. A.等，Validation of multiplex polymorphic STR amplification sets developed for personal identification applications, Journal of Forensic Sciences，41:582-590 (1996) ；Moretti,T.等， Validation of short tandem repeats (STRs) for forensic usage:performance testing of fluorescent multiplex STR systems and analysis of authentic and simulated forensic samples, Journal of Forensic Sciences，46 (3):647 (2001))〇 包括长散在核元件（LINE)、短散在核元件（SINE)和SVA元件的可反转录 转座元件（RE)是可用于人身份测试的另一组标志物。SINE是通常小于500核苷 酸长的一类RE ;而LINE是通常大于500核苷酸长的LINE (A. F. A. Smit，The origin of interspersed repeats in the human genome, Current Opinion in Genetics Development, 6 (6) : 743-748 (1996) ；Batzer, M. A.等，Alu repeats and human genomic diversity，Nature Reviews Genetics，3 (5) :370-379 (2002) ;Batzer，M. A.等， African origin of human-specific polymorphic Alu insertions, Proceedings of the National Academy of Sciences, 91 (25) :12288 (1994) ;Feng，Q.等， Human Llretrotransposon encodes a conserved endonuclease required for re trotransposition，Cell, 87 (5) :905-916 (1996) ;Houck，C.M.等，A ubiquitous family of repeated DNA sequences in the human genome,Journal of Molecular Biology, 132 (3) :289-306 (1979) ;Kazazian，H.H.等，The impact of Llretrotransposons on the human genome, Nature Genetics, 19(1):19-24(1998)； Ostertag,E. M.等，Biology of mammalian Llretrotransposons, Annual Review of Genetics, 35 (I) : 501-538 (2001))。LINE全长元件长度为~6kb，包含聚合酶II的内部启 动子以及两个开放阅读框（ORF)，并且以多聚A尾终止。SINE包括Alu元件一一灵长类的 特异性SINE，其在人基因组中已经达到了超过一百万的拷贝数。一开始，由其散在性质和 长度（75bp至500bp)来定义SINE，但是还通过RNA聚合酶III转录来表征SINE。第三种 RE是被称为SVA(SINE/VNTR/Alu)元件的复合反转录转座子（Wang，H.等，SVA Elements:A Hominid-specific Retroposon Family, J. Mol. Biol. 354:994 - 1007(2005))。SVA 是复合 元件，根据其主要组分SINE、可变数目的串联重复（VNTR)和Alu来命名。作为VNTR区的结 果，全长SVA元件的大小可广泛变化。这些标志物具有用于身份测试、亲缘关系分析和进化 研宄的潜在应用性（参见上文引用的文献Smit ;Batzer本文档来自技高网...
【技术保护点】
用于遗传检测的方法，其包括提供待分析的样品；选择多个可反转录转座元件(RE)标志物，所选择的各RE标志物是与表示经填充基因组位点的经填充的等位基因和表示空基因组位点的空等位基因有关的INNUL标志物，各INNUL标志物包含核酸序列，所述核酸序列出现于靶物种基因组内的位置；提供与所选择的各INNUL标志物对应的引物组，各引物组由正向引物和两个反向引物组成，所述两个反向引物由对应于所述INNUL标志物的经填充位点的引物和对应于所述INNUL标志物的空位点的引物组成；将所述引物组与所述样品合并以形成反应混合物；使用所述引物组扩增所述标志物以形成扩增产物的混合物；将所述扩增产物与所述反应混合物的残余物分离；以及检测并定量各经标记的扩增产物。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：素德赫·辛哈，
申请(专利权)人：素德赫·辛哈，
类型：发明
国别省市：美国;US
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