标签、标签引物、试剂盒及其用途制造技术

技术编号:10806053 阅读:74 留言:0更新日期:2014-12-24 12:43
本发明专利技术提供了一组标签、一组标签引物、一种试剂盒及其用途。一组标签,包括SEQ ID NO:27~124所示序列的至少2个。利用本发明专利技术提供的标签、标签引物引进标签标记样本,和/或者利用本发明专利技术的试剂盒,标记区分大于等于或者远远大于标签数的样本数目,使多个样本的数据能够混合在一起处理而且最终又有办法区分开。

【技术实现步骤摘要】
标签、标签引物、试剂盒及其用途
本专利技术涉及混合数据处理技术,特别是能够将混合测序数据对应至源样本的一组标签及其相关序列。
技术介绍
Sanger测序是确定基因分型的金标准,飞行时间质谱检测能够实现定点检测基因分型,比如深圳华大基因推出的一款产品针对四个耳聋常见突变基因的20个位点进行质谱检测,这20个位点在我国耳聋人群的致病因素中占据主要作用,还有全基因组测序,三种方法都具有各自的局限性,比如Sanger和质谱法通量低、成本高,而全基因组测序则不能有效利用全部测序数据。先天性耳聋是一类常见疾病,在我国新生儿中的发病率高于1‰,其中60%以上是遗传因素导致的。因此,除了常规的医学诊断方法,通过测定相关基因的基因分型、判断是否发生基因突变,可以辅助医生诊断新生儿是否患有耳聋。根据国内研究人员针对我国人群中耳聋基因突变进行分子流行病学调查的结果,GJB2、GJB3、SLC26A4和12sRNA的突变最为常见,在人群中的突变比例高达40%,在这四个基因上的突变位点是导致遗传性耳聋发生的常见突变。
技术实现思路
本专利技术的一方面提供了一组标签,其包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少2个。本专利技术的另一方面提供了一组标签引物,其包括1对标签引物,所述标签引物的结构式为其中,X和X’均选自本专利技术一方面提供的标签中的同一个序列或者不同序列,Y选自SEQIDNO:1,SEQIDNO:3,SEQIDNO:5,SEQIDNO:7,SEQIDNO:9,SEQIDNO:11,SEQIDNO:13,SEQIDNO:15,SEQIDNO:17,SEQIDNO:19,SEQIDNO:21,SEQIDNO:23以及SEQIDNO:25所示的任一序列,Y’与Y对应,所说的对应指:当Y为SEQIDNO:1时,Y’为SEQIDNO:2,当Y为SEQIDNO:3时,Y’为SEQIDNO:4,当Y为SEQIDNO:5时,Y’为SEQIDNO:6,当Y为SEQIDNO:7时,Y’为SEQIDNO:8,当Y为SEQIDNO:9时,Y’为SEQIDNO:10,当Y为SEQIDNO:11时,Y’为SEQIDNO:12,当Y为SEQIDNO:13时,Y’为SEQIDNO:14,当Y为SEQIDNO:15时,Y’为SEQIDNO:16,当Y为SEQIDNO:17时,Y’为SEQIDNO:18,当Y为SEQIDNO:19时,Y’为SEQIDNO:20,当Y为SEQIDNO:21时,Y’为SEQIDNO:22,当Y为SEQIDNO:23时,Y’为SEQIDNO:24,当Y为SEQIDNO:25时,Y’为SEQIDNO:26。本专利技术的再一方面提供一种试剂盒,其包括本专利技术一方面提供的一组标签,和/或包括本专利技术另一方面提供的标签引物。本专利技术的又一方面提供前述试剂盒在标记混合核酸样本,和/或多个核酸样本混合测序,和/或在确定混合测序数据中的数据对应的样本源,和/或在检测耳聋相关基因突变中的用途。利用本专利技术提供的标签引物引进标签标记样本或者利用本专利技术的试剂盒,能够区分大于等于标签数的样本,比如利用一对上下游引物序列都带同一个标签的引物对标记一个样本,使该样本的核酸扩增产物带一个特定标签序列以区别其它样本,再比如利用一对上下游引物序列带不同标签的引物对来标记一个样本,使该样本的核酸扩增产物带两个标签序列,这样只要所带的两个标签的任一个与其它样本的不同就能够区分其它样本核酸,再再比如利用多对引物标记一个样本,各对引物的上下游序列都带同一个标签或不同标签,各对引物之间带一样或不同标签,使该样本核酸扩增产物带一个或多个特定排列的标签,其中任一标签或者标签位置的不同足以区分不同样本。本专利技术提供的这组标签或者标签引物,是专利技术人通过多次试验、创造性劳动,设计考虑筛查各序列本身碱基组成、各种碱基比例以及序列间关系比如标签与标签之间、标签与引物之间、引物与引物之间、标签连接到引物后不同标签引物之间等等的关系,使这些序列的全部或者任一部分都能够在同一个反应体系中使用发挥作用。本专利技术提供的标签引物中的引物,利用全部13对引物可以捕获、混合扩增我国人群中常见的耳聋相关基因,检测耳聋相关基因的突变情况,辅助临床检测诊断耳聋疾病。附图说明本专利技术的上述和/或附加的方面和优点从结合下面附图对实施方式的描述中将变得明显和容易理解,其中:图1是本专利技术的一个具体实施方式中的文库构建示意图。具体实施方式根据本专利技术的一种实施方式,提供了一组标签,其包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少2个。根据本专利技术的一个具体实施方式,提供的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少5个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所说的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少10个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少20个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少30个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少40个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少50个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少60个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少70个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少80个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的至少90个;根据本专利技术的一个具体实施方式,所使用的标签包括SEQIDNO:27~124所示序列的全部98个。序列SEQIDNO:27~124见表1。表1本专利技术的一种实施方式的这组标签,是考虑序列长度、碱基组成、碱基位置比例、与其它标签碱基的关系设计大量序列,多次试验筛选获得的,本专利技术的标签的部分或者全部可以置于同一反应体系中而又相互之间不干扰影响,而且不干扰常规体系内的其它反应物或反应,比如不影响文库构建中的各反应体系及反应,测序芯片上的固定序列等。根据本专利技术的另一种实施方式,提供了一组标签引物,其包括1对标签引物,标签引物的结构式为其中,X和X’均选自本专利技术一方面提供的标签,Y选自SEQIDNO:1,SEQIDNO:3,SEQIDNO:5,SEQIDNO:7,SEQIDNO:9,SEQIDNO:11,SEQIDNO:13,SEQIDNO:15,SEQIDNO:17,SEQIDNO:19,SEQIDNO:21,SEQIDNO:23以及SEQIDNO:25所示的任一序列,Y’与Y对应,所述对应指:当Y为SEQIDNO:1时,Y’为SEQIDNO:2,当Y为SEQIDNO:3时,Y’为SEQIDNO:4,当Y为SEQIDNO:5时,Y’为SEQIDNO:6,当Y为SEQIDNO:7时,Y’为SEQIDNO:8,当Y为SEQIDNO:9时,Y’为SEQIDNO:10,当Y为SEQIDNO:11时,Y’为SEQIDNO:12,当Y为SEQIDNO:13时,Y’为SEQIDNO:14,当Y本文档来自技高网...
标签、标签引物、试剂盒及其用途

【技术保护点】
一组标签,其包括SEQ ID NO:27~124所示序列的至少2个。

【技术特征摘要】
1.一组标签,其由SEQIDNO:27~124所示序列的全部98个序列组成。2.一组标签引物,其由13对标签引物组成,所述标签引物的结构式为其中,X和X’均选自权利要求1所述的一组标签,Y分别为SEQIDNO:1,SEQIDNO:3,SEQIDNO:5,SEQIDNO:7,SEQIDNO:9,SEQIDNO:11,SEQIDNO:13,SEQIDNO:15,SEQIDNO:17,SEQIDNO:19,SEQIDNO:21,SEQIDNO:23以及SEQIDNO:25所示的序列,Y’与Y对应,所述对应为:当Y为SEQIDNO:1时,Y’为SEQIDNO:2,当Y为SEQIDNO:3时,Y’为SEQIDNO:4,当Y为SEQIDNO:5时,Y’为SEQIDNO:6,当...

【专利技术属性】
技术研发人员:冯大飞程秀陈祖煜邹婧张俊清朱红梅易鑫
申请(专利权)人:深圳华大基因医学有限公司
类型:发明
国别省市:广东;44

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