用于通过质谱术识别微生物的方法技术

本发明专利技术涉及一种通过质谱术识别微生物的方法，包括：获取所述微生物的至少一种质谱；对于每种获取的质谱：检测在预定的质量范围内的质谱的峰值；产生包括在质量-电荷比的范围内的预定的细分的每个区间中的不多于一个峰值的峰值的列表，所述细分的区间的宽度随着所述质量-电荷比呈指数增大，以及根据先前识别的微生物和/或微生物类型的知识库分析所获得的峰值的列表。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本专利技术涉及一种通过质谱术识别微生物特别是细菌的方法。现有技术已知使用质谱来识别微生物，特别是细菌。制备微生物的样本，之后获取和预处理样本的质谱:质谱去噪(噪声消除)、(可归因于检测器)背景噪声的过滤。然后，检测预处理质谱的明显峰值，且如此得到的峰值列表被“分析”，并与从已识别的微生物或微生物族的典型峰值的列表构建的知识库的数据(血统、属、科等等)进行“比较”。虽然从理论上说这个原则看起来简单，但其实施却是棘手的。事实上，首先，包含在质谱中的信息量，特别是峰值的数量，是非常大的，这需要非常强大的计算工具来创建鲁棒性的知识库，以及实现分类、比较和判定算法。其次，存在高的测量不确定性，尤其是涉及质谱中的峰值位置。确实可以观察到，从同一质谱仪的一次测量到另一次测量，以及从一个质谱仪到另一个质谱仪，代表给定分子的峰值在所测量的质谱中不具有固定的位置，或者至少峰值不包含在一个范围内。因此，所获取的质谱的对应于给定的蛋白质分子的峰值不能通过分类算法被识别为对应于所述蛋白质分子的。最后，这种不确定性在质量-电荷比的整个范围不是恒定的，且随该比值的增大而增大。【专利技术内容】由于待分析的本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种通过质谱术识别微生物的方法，包括：获取所述微生物的至少一种质谱；对于每种所获取的质谱：检测在预定的质量范围内的所述质谱的峰值；产生包括在质量‑电荷比的范围内的预定的细分的每个区间中的不多于一个峰值的峰值的列表，所述细分的区间的宽度根据以下关系随着所述质量‑电荷比而增大：L(b)=exp(b-βα)×(exp(1α)-1)]]>α=bmin-(bmax+1)lnmmin-lnmmax]]>β=(bmax+1)×lnmmin-bmin×lnmmaxlnmmin-lnmmax]]>其中所述细分的区间参照大...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2011.12.02 EP 11306610.4;2011.12.02 US 61/566,0251.一种通过质谱术识别微生物的方法，包括: 获取所述微生物的至少一种质谱； 对于每种所获取的质谱: 检测在预定的质量范围内的所述质谱的峰值； 产生包括在质量-电荷比的范围内的预定的细分的每个区间中的不多于一个峰值的峰值的列表，所述细分的区间的宽度根据以下关系随着所述质量-电荷比而增大: 2.根据权利要求1所述的方法，其中所述质量-电荷比...

【专利技术属性】
技术研发人员：格里高利·施特鲁贝尔，莫德·阿尔萨克，丹尼斯·戴瑟利，皮埃尔吉恩·科特帕塔特，
申请(专利权)人：生物梅里埃有限公司，
类型：发明
国别省市：美国;US