本发明提供一种病毒宏基因组测序数据的分析方法及系统，涉及生物信息领域，所述方法包括：对原始测序数据进行质量过滤，得到过滤后的数据；根据过滤后的数据，通过De Bruijn图和重叠布局对序列进行组装，构建病毒宏基因组草图；将病毒宏基因组草...