通过杂交进行的随机阵列DNA分析制造技术

本发明专利技术为通过杂交进行的随机阵列DNA分析，涉及分析单分子，如核酸的方法和装置。该单分子可来自天然样品，如不经过分离或富集单组分的细胞、组织、土壤、空气和水。本发明专利技术的某些方面，方法和装置是用于通过探针杂交进行的核酸序列分析。（*该技术在2024年保护过期，可自由使用*）

【技术实现步骤摘要】
通过杂交进行的随机阵列DNA分析本专利技术专利申请是国际申请号为PCT/US2004/006022，国际申请日为2004年2月26日，进入中国国家阶段的申请号为200480010806.3，名称为“通过杂交进行的随机阵列DNA分析”的专利技术专利申请的分案申请。相关申请的相互参照本申请要求2003年2月26日提交的美国临时申请60/450，566的优先权，其题目为“通过杂交进行的随机阵列DNA分析”，代理人审理号CAL-2。相关主题公开于共有、共待审的2003年12月16日提交的美国专利申请10/738,108，题目为“通过用探针分子编制多个瞬时相互作用进行的单靶分子分析”，代理人审理号CAL-3，其要求2002年12月20日提交的美国临时申请60/435，539的优先权，该临时申请的题目为“通过用探针分子编制多个瞬时相互作用进行的单靶分子分析”，代理人审理号30311/39054。这些和所有其他专利和专利申请纳入本文作为参考。
本专利技术涉及分析分子的方法和进行这种分析的装置。方法和装置对单分子核酸进行可信赖的分析。这种单分子可来自天然样品，如不分离或富集的单个组分细胞、组织、本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种分析靶核酸的方法，所述方法包括：（a）提供所述靶核酸的随机阵列；（b）将第一寡核苷酸探针库和第二寡核苷酸探针库杂交到所述阵列；（c）将杂交到所述靶核酸上相邻位置上的所述第一库和第二库的寡核苷酸探针连接，获得连接的探针；（d）收集所述连接的探针产生的信号；（e）分析所述信号，以鉴定所述靶核酸的至少一个核苷酸；（f）重复步骤（b）到（e），以为所述靶核酸提供多轮序列信息，这样在超过一轮中鉴定出所述靶核酸的至少一个核苷酸；和（g）组装所述多轮序列信息，提供所述靶核酸的全部或部分序列。

【技术特征摘要】
2003.02.26 US 60/450,5661.一种分析靶核酸的方法，所述方法包括：(a)将来自第一组可检测标记的寡核苷酸探针的一个或多个探针杂交到连接于表面的靶核酸的随机阵列上；(b)将来自第二组可检测标记或未标记的寡核苷酸探针的一个或多个探针杂交到靶核酸的所述随机阵列上；(c)将杂交到所述靶核酸上相邻位置上的所述第一组和第二组的寡核苷酸探针连接；(d)检测步骤(c)形成的连接的探针；(e)除去杂交到所述靶核酸的探针；(f)使用不同的探针组合实施步骤(a)到(e)的连续循环；(g)鉴定与步骤(d)获得的探针重叠的探针序列；和(h)由所述重叠的探针序列组装靶核酸的序列数据。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述第一组探针和第二组探针中的至少一组含有通式为NxByNz的简并探针的混合物，其中，N代表4种碱基中的任意一种，它因各组探针而改变，B代表4种碱基中的任意一种，但在各组中对于各探针而言相同的，x、y和z是整数。3.如权利要求2所述的方法，其特征在于，x和z独立是0到5的整数，y是4到20的整数。4.如权利要求1－3中任一项所述的方法，其特征在于，第一组中的探针被荧光标记物可检测地标记。5.如权利要求3所述的方法，其特征在于，第二组中的探针未被标记。6.如权利要求1－3中任一项所述的方法，其特征在于，一组探针被FRET供体标记，而另一组探针被FRET受体标记。7.如权利要求1－3中任一项所述的方法，其特征在于，在各循环中使用多种颜色的标记物...

【专利技术属性】
技术研发人员：R·T·德拉曼尼克，
申请(专利权)人：凯利达基因组股份有限公司，
类型：发明
国别省市：