花色苷抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法技术

本发明专利技术涉及花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法，所述方法以已知活性的花色苷抗氧化剂为研究对象，利用三维定量构效关系技术，建立花色苷抗氧化剂三维定量构效关系模型，采用分子力场法和分子相似性系数分析法分析、分子构象优化、参数优化等技术建立准确的构效关系模型。所构建模型能够快速预测未知活性化合物的活性值，并且能够合理阐释花色苷抗氧化活性大小与其结构特征的关系。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及一种花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法及应用，具体涉及利用已知活性的花色苷物质为研究对象，构建抗氧化活性三维定量构效关系的方法，并且利用构建的模型进行未知化合物活性的预测和构效关系的合理阐释。
技术介绍
自由基是生物体生命活动中产生的一种中间产物。机体在正常情况下，自由基的产生和消除处于动态平衡中，但是若体内自由基产生过多或是没有及时清除，过多的自由基就会对机体有破坏作用，导致人体正常细胞和组织的损坏，从而引起很多疾病，如心血管疾病、衰老、肿瘤、老年痴呆症等。鉴于过量的自由基对机体的损伤，所以必须有一些能够减轻或消除自由基危害的物质，起到抗氧化性，那这类物质就是抗氧化剂。抗氧化剂从广义上讲是指一切能够直接清除自由基，或是抑制启动自由基链式反应，终止自由基反应，或是可提高内源性抗氧化物质水平的化合物。抗氧化剂按其来源一般分为两类，一类是合成抗氧化剂，一类是天然抗氧化剂。目前常见的合成抗氧化剂有BHT(2，6-二叔丁基对甲酚)、BHA (丁香羟基茴香醚)、TBHQ (叔丁基对苯二酚)。合成抗氧化剂的抗氧化性很强，但是随着人们认识和研究的深入，这些物质对本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法，包括以下步骤：（1）测定花色苷物质的抗氧化活性大小，并将其随机分组为测试集和训练集，生物活性指标采用抗氧化活性的负对数表示；（2）使用软件分析获得训练集和测试集中的化合物的三维空间结构，经构象优化获得优化的三维空间结构模型；（3）以步骤（2）中优化得到的三维空间结构模型的公共刚性骨架为基础，以训练集中抗氧化活性最大的分子为模板进行分子叠合；（4）用小分子探针搜寻叠合后化合物周围的力场信息计算力场值；（5）对步骤（4）获得的力场信息与训练集中的化合物的生物活性值进行偏最小二乘法回归，获得花色苷物质抗氧化活性三维定量构效关系模型。

【技术特征摘要】
1.一种花色苷抗氧化剂抗氧化活性三维定量构效关系模型的构建方法，包括以下步骤: (1)测定花色苷物质的抗氧化活性大小，并将其随机分组为测试集和训练集，生物活性指标采用抗氧化活性的负对数表示； (2)使用软件分析获得训练集和测试集中的化合物的三维空间结构，经构象优化获得优化的三维空间结构模型； (3)以步骤(2冲优化得到的三维空间结构模型的公共刚性骨架为基础，以训练集中抗氧化活性最大的分子为模板进行分子叠合； (4)用小分子探针搜寻叠合后化合物周围的力场信息计算力场值； (5)对步骤(4)获得的力场信息与训练集中的化合物的生物活性值进行偏最小二乘法回归，获得花色苷物质抗氧化活性三维定量构效关系模型。2.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(2)中使用软件分析获得化合物的三维空间结构，所述软件是指SYBYL-X1.2软件。3.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(2)中的构象优化是使用Tripos力场进行优化,添加Gasteiger-Hiickel电荷，能量收敛限为0.005kcal/mol,最大迭代次数为1000次。4.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(3)中所采用的叠合方法为Align Database 方法。5.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(4)中所采用的小分子探针为Sp3杂化的碳原子。6.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(4)中所计算的力场值为CoMFA或CoMSIA力场值。7.按权利要求1所述的构建方法，其特征在于，所述步骤(5)中对力场信息与训练集中的化...

【专利技术属性】
技术研发人员：敬璞，李平凡，钱柄俊，隋中泉，赵淑娟，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：