本发明专利技术公开了一种公共动物双歧杆菌益生菌密码子数据库管理方法，该管理方法包括以下步骤：接收指令，调用公共动物双歧杆菌数据库管理系统；选择动物双歧杆菌；通过密码子分析软件CodonW和文本编辑器选择编译序列；获取18035个编码序列的所有密码子资料。本发明专利技术克服现有技术的不足，发明专利技术了公共动物双歧杆菌密码子数据库管理系统。通过数据库技术和网络，借助密码子分析软件CodonW获取不同动物双歧杆菌的密码子资料，实现对七种动物双歧杆菌的密码子资料进行存档，方便相关工作者查询使用。
【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于数据库管理
，尤其涉及一种公共动物双歧杆菌益生菌密码子数据库管理方法。
技术介绍
构成蛋白质的氨基酸及编码密码子的种类是多样的，密码子存在简并性，例如亮氨酸由六种密码子编码，编码同种氨基酸的密码子被称为同义密码子，同义密码子的使用时非随机的，存在偏好性。截至目前，真核生物、原核生物乃至病毒都发现密码子的偏好性，密码子偏好性产生的原因被认为主要包括两个，即突变压力和翻译选择。动物双歧杆菌添加进乳制品中能够有助于肠道健康，在医药上已有广泛用途，截至目前，少有数据库涵盖了详细的双歧杆菌的密码子资料，在双歧杆菌的生理学，细胞学、遗传学、分子进化、分子生物学乃至实际生产操作中有时都需要查询双歧杆菌的密码子资料。然而，截止目前尚无一个 公共可用的完整的双歧杆菌密码子数据库出现，给相关工作者带来了极大的不便。
技术实现思路
本方案为了克服现有技术的不足，专利技术了公共动物双歧杆菌密码子数据库管理系统。通过数据库技术和网络，借助密码子分析软件CodonW获取不同动物双歧杆菌的密码子资料，实现对七种动物双歧杆菌的密码子资料进行存档，方便相关工作者查询使用。本专利技术实施例是这样实现的，一种公共动物双歧杆菌益生菌密码子数据库管理方法，其特征在于，该管理方法包括以下步骤双击运行公共动物双歧杆菌数据库管理系统；选择动物双歧杆菌；通过密码子分析软件CodonW和文本编辑器选择编译序列；获取18035个编码序列的所有密码子资料；。进一步，公共动物双歧杆菌数据库管理系统建立了七个表格，涵盖了七种全长基因组可用的动物双歧杆菌，所有七个表格是经过多次试验设计的信息内容全面的表格，将编码序列的密码子资料均包含其中，通过整合，形成了数据库，数据库具有基于windows 7系统下的可视化操作界面，用户能够通过选择不同的对象来进入到相应的界面，每个对象严格地链接到对应的表单或表格。进一步，七种动物分别为IactisADO11, Iactis BB-12, Iactis BLCl, IactisCNCM 1-2494，Iactis DSM 10140，Iactis V9, Iactis B1-04。进一步，编码序列必须包含至少50个密码子，密码子资料之间存在一定关联，具体为密码子第三位的腺嘌呤含量(A3s)，密码子第三位的胸腺嘧啶含量(T3s)，密码子第三位的鸟嘌呤含量(G3s)，密码子第三位的胞嘧啶含量(C3s)，密码子第三位GC含量(GC3s)，密码子有效数量(Ne)，氨基酸长度(Laa)和基因坐标(Axis)的关联系数。进一步，共有18035个编码序列。本专利技术提供一种能够利用互联网下载的公共动物双歧杆菌密码子数据库管理系统，是一种高效、方便、全面、合理、体贴的界面友好的数据库管理系统。通过运行电脑中所建立的动物双歧杆菌数据库管理系统，该数据库是表单交互式界面，用户能够通过选择一个编码序列来查询查询相应的密码子资料，数据库包含七种动物双歧杆菌的密码子资料，分别存储在设计经过多次试验的七个表格中间。首先选择所需查询的动物双歧杆菌种类，其次再通过CodonW和文本编辑器选择编译序列，获取18035个编码序列的所有密码子资料，每个编码序列的所有密码子资料必须齐全，密码子第三位的胸腺嘧啶含量、密码子第三位的胞嘧啶含量、密码子第三位的腺嘌呤含量、密码子第三位的鸟嘌呤含量，密码子适应性索引、密码子偏好性索引、最优密码子频度、密码子有效数量、密码子第三位GC含量、同义密码子频度、氨基酸长度、蛋白质的亲水性和芳香性信息必须包括；通过以上操作用户能够查询所需的信息并在计算机上进行管理操作。附图说明图I是本专利技术提供的公共动物双歧杆菌密码子数据库管理方法的流程图。 具体实施例方式为了使本专利技术的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合附图及实施例，对本专利技术进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本专利技术，并不用于限定本专利技术。图I显示出了本专利技术提供的公共动物双歧杆菌密码子数据库管理系统，该系统包括在步骤SlOl中，接收指令，调用公共动物双歧杆菌数据库管理系统；所需的硬件为微型计算机；Pentium(R)Dua I-Core CPU、2. OOGB内存；所需的软件为 Microsoft windows 7 旗舰版、Microsoft Visual FoxPro 9· O 中文版、Microsoftoffice 2007ο在步骤S102中，选择动物双歧杆菌；公共动物双歧杆菌数据库管理系统建立了七个表格，涵盖了七种全长基因组可用的动物双歧杆菌，所有七个表格是经过多次试验设计的信息内容全面的表格，将编码序列的密码子资料均包含其中，通过整合，形成了数据库，数据库具有基于windows 7系统下的可视化操作界面，用户能够通过选择不同的对象来进入到相应的界面，每个对象严格地链接到对应的表单或表格。七种动物分别为:Iactis ADOlI，Iactis BB-12，Iactis BLCl，Iactis CNCM 1-2494，Iactis DSM 10140，Iactis V9, Iactis B1-04，如下表 I 所示。在步骤S103中，通过密码子分析软件CodonW和文本编辑器选择编译序列；一共有18035个编码序列。在步骤S104中，获取18035个编码序列的所有密码子资料；编码序列必须包含至少50个密码子，密码子资料之间存在一定关联，具体为密码子第三位的腺嘌呤含量(A3s)，密码子第三位的胸腺嘧啶含量(T3s)，密码子第三位的鸟嘌呤含量(G3s)，密码子第三位的胞嘧啶含量(C3s)，密码子第三位GC含量(GC3s)，密码子有效数量(Ne)，氨基酸长度(Laa)和基因坐标(Axis)的关联系数运行电脑中所建立的动物双歧杆菌数据库管理系统，该数据库是表单交互式界面，用户能够通过选择一个编码序列来查询查询相应的密码子资料，数据库包含七种动物双歧杆菌的密码子资料，分别存储在设计经过多次试验的七个表格中间。首先选择所需查询的动物双歧杆菌种类，其次再通过CodonW和文本编辑器选择编译序列，获取18035个编码序列的所有密码子资料，每个编码序列的所有密码子资料必须齐全，密码子第三位的胸腺嘧啶含量、密码子第三位的胞嘧啶含量、密码子第三位的腺嘌呤含量、密码子第三位的鸟嘌呤含量，密码子适应性索引、密码子偏好性索引、最优密码子频度、密码子有效数量、密码子第三位GC含量、同义密码子频度、氨基酸长度、蛋白质的亲水性和芳香性信息必须包括；通过以上操作用户能够查询所需的信息并在计算机上进行管理操作。本专利技术提供一种能够利用互联网下载的公共动物双歧杆菌密码子数据库管理系统，是一种高效、方便、全面、合理、体贴的界面友好的数据库管理系统。通过运行电脑中所建立的动物双歧杆菌数据库管理系统，该数据库是表单交互式界面，用户能够通过选择一个编码序列来查询查询相应的密码子资料，数据库包含七种动物双歧杆菌的密码子资料，分别存储在设计经过多次试验的七个表格中间。首先选择所需查询的动物双歧杆菌种类，其次再通过CodonW和文本编辑器选择编译序列，获取18035个编码序列的所有密码子资·料，每个编码序列的所有密码子资料必须齐全，密码子第三位的胸腺嘧啶含量、密码子第三位的胞嘧啶含量、密码子第本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种公共动物双歧杆菌益生菌密码子数据库管理方法，其特征在于，该管理方法包括以下步骤：接收指令，调用公共动物双歧杆菌数据库管理系统；选择动物双歧杆菌；通过密码子分析软件CodonW和文本编辑器选择编译序列；获取18035个编码序列的所有密码子资料。
【技术特征摘要】
1.一种公共动物双歧杆菌益生菌密码子数据库管理方法，其特征在于，该管理方法包括以下步骤 接收指令，调用公共动物双歧杆菌数据库管理系统； 选择动物双歧杆菌； 通过密码子分析软件CodonW和文本编辑器选择编译序列； 获取18035个编码序列的所有密码子资料。2.如权利要求I所述的管理方法，其特征在于，公共动物双歧杆菌数据库管理系统建立了七个表格，涵盖了七种全长基因组可用的动物双歧杆菌，所有七个表格是经过多次试验设计的信息内容全面的表格，将编码序列的密码子资料均包含其中，通过整合，形成了数据库，数据库具有基于wi ndows 7系统下的可视化操作界面，用户能够通过选择不同的对象来进入到相应的界面，每个对象严格地链接到对应的表单或表格。3.如权利要求2所述...
【专利技术属性】
技术研发人员：罗超，贺建华，陈明，
申请(专利权)人：湖南农业大学东方科技学院，
类型：发明
国别省市：
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