用作毛细管凝胶电泳筛分介质的准互穿聚合物网络和其制备方法以及用途技术

技术编号:6863807 阅读:310 留言:0更新日期:2012-04-11 18:40
本发明专利技术涉及用于毛细管凝胶电泳的筛分介质,以及制备和使用该筛分介质的方法。更具体地,本发明专利技术提供一种用作毛细管凝胶电泳筛分介质的准互穿聚合物网络,以及该准互穿聚合物网络的制备方法及用途。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及用于毛细管凝胶电泳的筛分介质,以及制备和使用该筛分介质的方法。更具体地,本专利技术提供一种用作毛细管凝胶电泳筛分介质的准互穿聚合物网络,以及该准互穿聚合物网络的制备方法及用途。
技术介绍
毛细管电泳是一种快速高效分离手段。带电物质在电场的作用下,从毛细管的一端移动到另一端。毛细管凝胶电泳是分离大分子物质最有效方法之一,如生物大分子蛋白质,多肽, RNA和DNA等。毛细管凝胶电泳通常使用石英毛细管,内径范围在50微米至200微米,长度从IOcm到100cm。为保护被分析物不被吸附,同时消除毛细管的电渗流,毛细管内壁通常涂有一保护层。最常用的涂层是聚丙烯酰胺涂层。毛细管凝胶电泳分离介质性质决定大分子物质的分离度。例如,聚丙烯酰胺凝胶对DNA片段的分离效果较好。高分子量聚丙烯酰胺是目前所有聚合物中DNA分离度最好的介质。可以分离DNA 片段达1200碱基数。但聚丙烯酰胺不具有自涂敷能力。必须在毛细管内壁上加涂层,消除毛细管内壁对DNA的吸附和电渗流,才能有效的分离DNA片段。利用聚丙烯酰胺作为筛分介质的主要优点是重复性好,分离能力强,化学性质稳定。但是聚丙烯酰胺也有很多不足之处。例如它没有自涂敷能力,使用的毛细管必须有涂层保护。另外,由高分子量聚丙烯酰胺制备的凝胶粘度较高,需要高压才能将凝胶灌入毛细管中。聚(N,N_二甲基丙烯酰胺)也有很强的分离DNA片段的能力,并且使用聚(N,N_二甲基丙烯酰胺)时毛细管内壁不需要涂涂层保护。聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)对DNA片段的分离效果略低于聚丙烯酰胺。但是聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)凝胶具有很强的自涂敷能力,可消除DNA的吸附和降低电渗流。聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)凝胶的粘度远远低于聚丙烯酰胺凝胶。若把这两种聚合物有机地结合起来,就可得到理想的DNA分离介质。但由于聚丙烯酰胺和聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)两者的极性不同,这两种聚合物通过简单的机械混合不能得到均勻混合体,而会呈现出微观两相不互溶现象。Barbier V等,Electrophoresis 2002,23 :1441-1449,公开了有机地把这两种性质不同的聚合物结合到一起。以聚丙烯酰胺为主链,以聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)为支链合成梳形聚合物。这种梳形聚合物能够有效地抑制电渗流,不需要在毛细管内壁加任何涂层,就能有效的分离DNA片段。但是此合成方法比较复杂。理想的筛分介质需要很强的亲水性、适度的粘度,还要具有自涂敷功能。目前合成的均聚物无法同时满足上述条件。无规共聚物是把两种或者两种以上的聚合物有机结合到一起的常用办法。共聚物同时具备了两种聚合物的特征。因此,把有筛分能力的聚合物和有自涂敷功能的聚合物合成为共聚物,就可成为满足以上条件的一种新型的毛细管电泳分离筛分介质,尤其是用于DNA的分离。当丙烯酰胺和二甲基丙烯酰胺共聚形成无规共聚物时,就同时对DNA具有良好的分离能力和具有毛细管内壁自涂敷能力。Song L 等,Electrophoresis, 2001, 22 :729_736,公开了利用聚丙烯酰胺优秀的筛分能力和聚(N, N- 二甲基丙烯酰胺)良好的自涂敷功能,通过自由基聚合方法,把丙烯酰胺和N,N- 二甲基丙烯酰胺以不同比率3 1、2 1和1 1合成得到无规共聚物。可以在没有额外保护层的条件下分离DNA片段。但当两者比例大小不同时,无规共聚物对DNA片段分离效果也不尽相同。实验发现,对于丙烯酰胺和N,N- 二甲基丙烯酰胺的共聚物而言,当丙烯酰胺的含量较高时,该共聚物对DNA的分离效果较好。但当该共聚物中的N,N-二甲基丙烯酰胺含量减少到一定程度时,N,N-二甲基丙烯酰胺的比例太低,无规共聚物的自涂敷功能会受到影响,分离效果也随之降低。无规共聚物的形成过程中N,N- 二甲基丙烯酰胺被随机分布到丙烯酰胺聚合链上。这种随机性分布会造成每次合成的共聚物不完全相同。造成不同批次合成的共聚物在毛细管自涂敷能力方面有所不同,从而影响DNA片段分离效果的重复性。互穿网络结构是把两种或者两种以上的聚合物有机结合到一起的常用办法。例如,Song L 等,Electrophoresis,2001,22 :3688-3698 公开了由 LPA (线性聚丙烯酰胺)和 PVP(聚乙烯基吡咯烷酮)形成的准互穿网络结构对dsDNA进行分离,把DMA(N,N-二甲基丙烯酰胺)溶解在PVP溶液内,于氮气保护下自由基引发聚合,得到LPA与PVP互穿的网络结构,就可用于dsDNA的分离。“互穿聚合物网络 anterpenetrating Polymer Networks,IPN) ”定义为两种或更多种聚合物以网络形式结合,其中至少一种聚合物是在另外一种聚合物直接存在下进行合成或交联的。若构成IPN的两种聚合物组分都是交联的,则称为“全互穿聚合物网络”,即, “全-IPN” (Full-IPN);若仅有一种聚合物交联,另一种聚合物是线型的,则称为“半互穿聚合物网络”,即,“半-IPN” (Semi-IPN)。“准互穿聚合物网络”的英文是Quasi-IPN。准互穿聚合物网络的两种(或更多种)聚合物都是线型的,相互构成准互穿网络式结构。如在制备过程中没有添加交联试剂(cross-linking agent),则为准互穿聚合物网络。如在制备过程中添加交联试剂,则为互穿聚合物网络。相同分子量下,准互穿聚合物网络的流动性比线性分子的流动性小,全、半互穿聚合物网络的流动性比准互穿聚合物网络的流动性差。形成互穿网络结构的两种或两种以上的交联聚合物相互贯穿而形成聚合物网络。 交联可以是物理交联也可以是化学交联,但相互贯穿的聚合物之间没有共价键交联作用。 聚合物形成的交联网络能够减少宏观相分离,因此形成的网络结构比聚合物共混方法形成的网络更为稳定。当两种聚合物通过互穿网络结构形成交联聚合物,其稳定性取决于两种聚合物的相容性和分子间的相互吸引力。当两种聚合物的极性相差较大时,相容性降低,互穿网络结构的稳定性就会降低。
技术实现思路
为解决现有技术中存在的缺陷,本专利技术提供一种具有稳定性高、分辨率高、测序效果好,使用寿命长的作为毛细管凝胶电泳筛分介质的聚合物链的准互穿聚合物网络。本专利技术的专利技术人出乎意料地发现在合成丙烯酰胺和N,N- 二甲基丙烯酰胺的无规共聚物时,适当地加入分子量大小不同的线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺),使所述无规共聚物和聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)形成准互穿聚合物网络结构,从而保证整体凝胶的互溶性、稳定性和重现性;同时,所述准互穿聚合物网络结构用作毛细管凝胶电泳筛分介质时能够实现高的分辨率和优异的测序效果。根据本专利技术的一个方面,本专利技术提供一种聚合物链的准互穿聚合物网络,所述聚合物链包括(a)长链线性聚(N,N- 二甲基丙烯酰胺)链,其粘均分子量在800kDa 1200kDa 的范围;(b)短链线性聚(N,N- 二甲基丙烯酰胺)链,其粘均分子量在20kDa 60kDa的范围;和(c)丙烯酰胺和N,N- 二甲基丙烯酰胺的无规共聚物链,所述无规共聚物在所述长链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)(a)和所述短链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)(b)的存在下通过将丙烯酰胺单体和N,N- 二甲基丙烯酰胺单体进行氧化还原自由基聚本文档来自技高网
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【技术保护点】
1.一种聚合物链的准互穿聚合物网络,所述聚合物链包括:(a)长链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)链,其粘均分子量在800kDa~1200kDa的范围,优选1000kDa;(b)短链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)链,其粘均分子量在20kDa~60kDa的范围,优选36kDa;和(c)丙烯酰胺和N,N-二甲基丙烯酰胺的无规共聚物链,所述无规共聚物在所述长链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)链(a)和所述短链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)链(b)的存在下通过将丙烯酰胺单体和N,N-二甲基丙烯酰胺单体进行氧化还原自由基聚合制备,所述无规共聚物的分子量大小在1MDa~10MDa的范围,优选为6MDa;其中,所述长链、短链线性聚(N,N-二甲基丙烯酰胺)和所述丙烯酰胺和N,N-二甲基丙烯酰胺的无规共聚物链彼此缠结、互穿,形成聚合物链的准互穿聚合物网络,并且其中,所述聚合物链的准互穿聚合物网络无化学交联。

【技术特征摘要】

【专利技术属性】
技术研发人员:李丰任媛媛李黎李海峰佟景丽
申请(专利权)人:北京六合华大基因科技股份有限公司深圳华大基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:11

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