判断罹患疾病的装置制造方法及图纸

判断罹患疾病的装置本发明专利技术公开了判断罹患疾病的装置，其包括：●测定装置，其用于测定从疑似罹患作为判断对象的疾病的受试者得到的活体样品中属于基因群的至少１种基因的转录产物表达量，所述基因群用于判断与所述疾病相关的至少２种疾病；及●控制器，其用于进行下列操作，所述操作包括：■将从测定装置得到的表达量基于多个健康者中相应基因的转录产物表达量进行标准化，从而取得显示偏差的值，■取得所述疾病判断用基因群各自中属于所述基因群的基因的显示偏差的值的平均值，及■使用所述平均值判断所述受试者是否罹患作为判断对象的疾病。本发明专利技术还公开了控制系统。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及用于判断受试者是否罹患作为判断对象的疾病的装置。更具体而言， 本专利技术涉及可基于从受试者采取的活体样品中有的特定基因的转录产物表达量的测定来 判断该受试者是否罹患作为判断对象的疾病的装置。
技术介绍
大量的基因或它们的转录产物的表达量的网络的解析由于可发现关联于某特定 疾病而表达量变化的基因，期待着可利用于该罹患疾病判断的可能性。因此，至今大量进行 着对于基于这样的网络的解析的数据，判断受试者是否罹患某特定疾病的方法的研究。但是，基因或其转录产物的表达量的网络的解析中，由于也大量检测假阳性的基 因，或者测定系统所致的误差，基因表达的再现性的不良等，存在提取显示真正显著的表达 量的变化的基因困难的问题。而为了解决这样的问题，至今研究及开发着对于解析数据的各种统计方法。例如，特开2005-323573号公报公开了通过多变量解析获自DNA微阵列的基因的 表达量数据，判断不同的2条件间的基因表达是否显著不同的方法。此外，美国专利申请公开No. 2009/0297494公开了基于与细胞内谷胱甘肽水平的 调节相关的基因的表达水平来诊断精神障碍的方法。
技术实现思路
本专利技术的范围仅由权利要求确定，不以任何方式受到此
技术实现思路
部分的影响。因 此，本专利技术提供以下技术方案。(1)判断罹患疾病的装置，其包括 测定装置，其用于测定从疑似罹患作为判断对象的疾病的受试者得到的活体样 品中属于基因群的至少1种基因的转录产物表达量，所述基因群用于判断与所述疾病相关 的至少2种疾病；及 控制器，其用于进行下列操作，所述操作包括■将从测定装置得到的表达量基于多个健康者中相应基因的转录产物表达量进 行标准化，从而取得显示偏差的值，■取得所述疾病判断用基因群各自中属于所述基因群的基因的显示偏差的值的 平均值，及■使用所述平均值判断所述受试者是否罹患作为判断对象的疾病。(2)⑴的判断罹患疾病的装置，其中所述疾病判断用基因群如下鉴定(a)测定从罹患作为判断对象的疾病的多个患者各自及多个健康者各自得到的活 体样品中的基因的转录产物表达量，(b)通过将对于所述多个患者各自的基因的转录产物表达量基于所述多个健康者 中相应基因的转录产物表达量进行标准化来取得对于所述多个患者各自的显示偏差的值，通过标准化对于所述多个健康者各自的基因的转录产物表达量来取得对于所述多个健康 者各自的显示偏差的值，(c)将所述测定了表达量的基因用基于基因所编码的分子功能的分类系统分类为 至少2种基因群，对于所述多个患者各自及所述多个健康者各自，取得所述基因群各自中 属于基因群的基因的显示偏差的值的平均值作为所述基因群的平均值，(d)取得对于所述多个患者的各基因群的平均值与对于所述多个健康者的相应各 基因群的平均值之间的显著性概率，及(e)将所述显著性概率为0. 05以下的基因群鉴定为与作为判断对象的疾病相关 联的疾病判断用基因群。(3) (2)的判断罹患疾病的装置，其中所述基于基因所编码的分子功能的分类系 统是Gene Ontology、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、MetaCyc、 GenMAPP、BioCarta、KeyMolnet 或 OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)。(4) (1)的判断罹患疾病的装置，其中所述作为判断对象的疾病选自克罗恩病、 亨廷顿病或子宫内膜症。(5) (1)的判断罹患疾病的装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是克罗恩病， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种G蛋白关联基因群、血液凝固关 联基因群、氧化应激关联基因群、吞噬作用关联基因群或脂肪氧化关联基因群。(6) (1)的判断罹患疾病的装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是亨廷顿病， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种微管关联基因群，线粒体关联 基因群或前列腺素关联基因群。(7) (1)的罹患判断装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是子宫内膜症， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种细胞因子合成通路关联基因 群，细胞因子介导的信号关联基因群或免疫球蛋白介导的免疫应答关联基因群。(8) (1)的罹患判断装置，其中测定装置在基因的转录产物表达量的测定中测定至 少3种疾病判断用基因群各自中属于基因群的至少1种基因的表达量。(9) (5)的判断罹患疾病的装置，其中， 所述G蛋白关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GNG3，GNG7， GNAl5，GNB5, GNAS，GNG5, GNGl 1，GNBl 及 GNG4， 所述血液凝固关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GP1BA， GPIBB, ITGB3, GP9 及 F13A1, 所述氧化应激关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GPX1， PTGS1，CLU 及 PDLIMl， 所述吞噬作用关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因FCER1G， CLEC7A, VAMP7 及 FCGR1A， 所述脂肪氧化关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因AC0X1， ADIP0R2, ADIP0R1及 AL0X12。(10) (6)的判断罹患疾病的装置，其中， 所述微管关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因DYNC1LI1， DYNLLl，DYNLTl，及 DYNLT3， 所述线粒体关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因ATP5F1， ATP5J, ATP5L, ATP5C1, ATP50, C0X6A1, C0X7A2, CYCS, MRPL18, MRPS35, NDUFA4, NDUFA9, NDUFBl，NDUFB3, NDUFB5, NDUFCl，NDUFS4, TIMM17A, TIMM8B, T0MM20, T0MM7, UQCRH, UQCR 及 UQCRQ，眷所述前列腺素关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因PTGER2， PTGER4 及 PTGES3。(11) (7)的判断罹患疾病的装置，其中，眷所述细胞因子合成通路关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因 CEBPE 及 CD28，眷所述细胞因子介导的信号关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因 EREG, STAT3, STAT5A, STAT5B, SOCSl，S0CS5, RELA, CEBPA, DU0X2, DUOXl，STAT4, ZNF675, IL2RB, IRAK3, KIT, LRP8, TNFRSF1A, PLP2, TNFRSF1B, TGM2, CCR1，CCR2，PF4, CX3CL1, ILlRl， CSF2RB, CLCFl 及 NUP85， 所述免疫球蛋白介导的免疫应答关联基因群的基因选自以下列基因符号表示 的基因IGHG3，IGHM, CD74, FCER1G, BCL10, PRKCD, CD27, MYD88 及 TLR8。(12) (1)的判断罹患疾病的装置，其中所述活体样品是血液。(13)⑴ (12)中任一项的判断罹患疾病的装置，其中所述判断通过将从疑似罹 患作为判断对象的疾病的受试者取得的平均值代入基于属于所述基因群的基因的显示偏 差的值的平均值本文档来自技高网...

【技术保护点】
判断罹患疾病的装置，其包括：●测定装置，其用于测定活体样品中属于基因群的至少１种基因的转录产物表达量，■所述活体样品获自疑似罹患作为判断对象的疾病的受试者，■所述基因群用于判断与所述疾病相关的至少２种疾病；及●控制器，其用于进行下列操作，所述操作包括：■将从测定装置得到的表达量基于多个健康者中相应基因的转录产物表达量进行标准化，从而取得显示偏差的值，■取得所述疾病判断用基因群各自中属于所述基因群的基因的显示偏差的值的平均值，及■使用所述平均值判断所述受试者是否罹患作为判断对象的疾病。

【技术特征摘要】
JP 2009-10-30 2009-2510171.判断罹患疾病的装置，其包括 测定装置，其用于测定活体样品中属于基因群的至少1种基因的转录产物表达量， ■所述活体样品获自疑似罹患作为判断对象的疾病的受试者， ■所述基因群用于判断与所述疾病相关的至少2种疾病；及 控制器，其用于进行下列操作，所述操作包括■将从测定装置得到的表达量基于多个健康者中相应基因的转录产物表达量进行标 准化，从而取得显示偏差的值，■取得所述疾病判断用基因群各自中属于所述基因群的基因的显示偏差的值的平均 值，及■使用所述平均值判断所述受试者是否罹患作为判断对象的疾病。2.权利要求1的判断罹患疾病的装置，其中所述疾病判断用基因群如下鉴定(a)测定活体样品中的基因的转录产物表达量，所述活体样品获自 ■罹患作为判断对象的疾病的多个患者各自、及■多个健康者各自，(b)■取得所述多个患者各自的显示偏差的值，其通过将所述多个患者各自的基因的 转录产物表达量基于所述多个健康者中相应基因的转录产物表达量进行标准化来取得，■取得所述多个健康者各自的显示偏差的值，其通过标准化所述多个健康者各自的基 因的转录产物表达量来取得，(c)■将所述测定了表达量的基因用分类系统分类为至少2种基因群，所述分类系统 基于基因所编码的分子功能，■对于所述多个患者各自及对于所述多个健康者各自，取得所述基因群各自中属于基 因群的基因的显示偏差的值的平均值作为所述基因群的平均值，(d)取得所述多个患者的各基因群的平均值与所述多个健康者的相应各基因群的平均 值之间的显著性概率，及(e)将所述显著性概率为0.05以下的基因群鉴定为与作为判断对象的疾病相关联的 疾病判断用基因群。3.权利要求2的判断罹患疾病的装置，其中所述基于基因所编码的分子功能的分类 系统是Gene Ontology、KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、MetaCyc、 GenMAPP、BioCarta、KeyMolnet 或 OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)。4.权利要求1的判断罹患疾病的装置，其中所述作为判断对象的疾病选自克罗恩病、 亨廷顿病或子宫内膜症。5.权利要求1的判断罹患疾病的装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是克罗恩病， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种G蛋白关联基因群、血液凝固关联基 因群、氧化应激关联基因群、吞噬作用关联基因群或脂肪氧化关联基因群。6.权利要求1的判断罹患疾病的装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是亨廷顿病， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种微管关联基因群，线粒体关联基因 群或前列腺素关联基因群。7.权利要求1的罹患判断装置，其中， 所述作为判断对象的疾病是子宫内膜症， 所述疾病判断用基因群是选自下列的至少2种细胞因子合成通路关联基因群，细 胞因子介导的信号关联基因群或免疫球蛋白介导的免疫应答关联基因群。8.权利要求1的罹患判断装置，其中测定装置在基因的转录产物表达量的测定中测定 至少3种疾病判断用基因群各自中属于基因群的至少1种基因的表达量。9.权利要求5的判断罹患疾病的装置，其中，眷所述G蛋白关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GNG3，GNG7, GNA15, GNB5, GNAS，GNG5, GNGl 1，GNBl 及 GNG4，眷所述血液凝固关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GP1BA，GP1BB， ITGB3, GP9 及 F13A1，眷所述氧化应激关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因GPX1，PTGSl，CLU 及 PDLIMl， 所述吞噬作用关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因FCER1G，CLEC7A， VAMP7 及 FCGR1A，眷所述脂肪氧化关联基因群的基因选自以下列基因符号表示的基因AC0X1，ADIP0R2， ADIP0R1及 AL0X12。10.权利要求6的判断罹患疾病的装置，其中...

【专利技术属性】
技术研发人员：吉田雄一郎，小林雅树，大友泰裕，
申请(专利权)人：希森美康株式会社，
类型：发明
国别省市：JP[日本]