一种与大口黑鲈耐盐性状相关的SNP标记及其应用制造技术

本发明专利技术属于分子生物技术领域，公开了一种与大口黑鲈耐盐性状相关的SNP标记及其应用。本发明专利技术通过对大口黑鲈极度盐度耐受和敏感个体的耐盐性能进行关联分析，从而得到与大口黑鲈耐盐能力强弱相关的SNP分子标记。该SNP分子标记如SEQ ID NO:1序列所示，SNP位点位于第501位，存在3种基因型TT、TG和GG。其中，GG基因型大口黑鲈在盐度胁迫下的存活时间显著高于TG和TT基因型。通过检测该SNP分子标记的基因型，能准确挑选出耐盐能力强的大口黑鲈亲本，能够有效用于大口黑鲈分子标记辅助育种。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于分子生物，具体涉及一种与大口黑鲈耐盐性状相关的snp标记及其应用。

技术介绍

1、我国蕴含丰富的盐碱水土资源且逐年上升，据不完全统计，全国约有6.9亿亩的盐碱水域和14.9亿亩的盐碱土地，这些盐碱水土资源遍及19个省、市和自治区。然而，由于治理难度大且类型复杂，盐碱水域多数处于闲置状态，具有巨大的开发利用潜力。大口黑鲈(micropterus salmoides)是一种广受欢迎的淡水经济鱼类，可在1‰～15‰盐水内存活，耐盐碱性状优良，具有极大的盐碱、滩涂等地区养殖和推广潜力，是咸淡水养殖的重要候选物种。然而，适合盐碱水养殖的良种匮乏，将大口黑鲈推广到盐碱水养殖，不仅有利于拓展水产养殖空间，增加水产品有效供给，还将利于修复盐碱化耕地，提升耕地质量和面积。目前，大口黑鲈在宁夏、天津、内蒙古和甘肃等地部分盐碱水域养殖成功，但对其耐盐遗传基础尚不清楚。

2、全基因组关联研究(gwas)是识别与复杂性状(如耐盐性状)相关的基因组区域的有力工具，通过将表型变异与特定的遗传位点联系起来，提供了对这些性状的遗传结构的见解。目前常用的分子标记包括本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.与大口黑鲈耐盐性能相关的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记的序列如SEQ ID NO:1所示，SNP位点位于SEQ ID NO:1所示序列自5’端起第501位，其多态性为T/G。

2.根据权利要求1所述的SNP分子标记，其特征在于，当SNP位点的基因型为GG，则为耐盐能力强的大口黑鲈，当SNP位点的基因型为TT，则为耐盐能力弱的大口黑鲈。

3.检测权利要求1或2所述的SNP分子标记的物质在筛选耐盐大口黑鲈或制备筛选耐盐大口黑鲈的产品中的应用；

4.用于扩增权利要求1或2所述的SNP分子标记的引物组；

5.一种试剂盒，包括权利...

【技术特征摘要】

1.与大口黑鲈耐盐性能相关的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记的序列如seq id no:1所示，snp位点位于seq id no:1所示序列自5’端起第501位，其多态性为t/g。

2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其特征在于，当snp位点的基因型为gg，则为耐盐能力强的大口黑鲈，当snp位点的基因型为tt，则为耐盐能力弱的大口黑鲈。

3.检测权利要求1或2所述的snp分子标记的物质在筛选耐盐大口黑鲈或制备筛选耐盐大口黑鲈的产品中的应用；

4.用于扩增权利要求1或2所述的snp分子标记的引物组；

5.一种试剂盒，包括权利要求4所述的引物组。

6.权利要求1或2所述的snp分子标记、权利要求4所述的引物组和/或权利要求5所述的试剂盒在(1)～(5...

【专利技术属性】
技术研发人员：宋红梅，田静，李胜杰，朱涛，刘阳，雷彩霞，杜金星，
申请(专利权)人：中国水产科学研究院珠江水产研究所，
类型：发明
国别省市：