【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物信息，具体地说，本专利技术属于生物信息学领域中二代测序数据分析的应用方向，公开了一种基于多引物设计的整合位点分析方法，旨在针对重组腺相关病毒(raav)载体开展整合位点的精准检测与分析。
技术介绍
1、重组腺相关病毒(raav)是整合分析常用的载体之一。腺相关病毒(aav)是一种非包膜病毒，经过设计编辑后的重组腺相关病毒(raav)可以作为载体向靶细胞递送序列，且有着结构简单、安全性高以及免疫原性低的特点，由此，raav成为了基因治疗领域最为广泛运用的载体之一。
2、整合位点分析(isa)是指在载体整合进入宿主基因组后，针对整合位点的位置检出与功能注释的分析，包括临床前和临床基因治疗。isa可以预测载体整合到靶细胞基因组中后是否会引发不良反应，是评估基因治疗载体生物安全性的关键。
3、相较于其他类型的载体如慢病毒载体等，aav载体在整合进入宿主基因组时，并不会将病毒序列完整插入，而是仅有部分序列会整合入宿主基因组，通常会丢失载体两端itr(inverse tandem repeats)的部分，在...
【技术保护点】
1.一种基于多引物设计的整合位点分析方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.如权利要求1所述的基于多引物设计的整合位点分析方法，其特征在于，所述多引物测序数据去冗余生信算法包括以下步骤：
3.如权利要求1所述的整合位点分析方法，其特征在于，所述引物设计包括以下步骤：
4.如权利要求3所述的整合位点分析方法，其特征在于，所述引物的核苷酸序列如SEQID No.1、SEQ ID No.2和SEQ ID No.3所示。
5.如权利要求1-3任一项所述的整合位点分析方法，其特征在于，所述测序数据去冗余处理包括以下步骤：
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