基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法技术方案

技术编号:44668814 阅读:33 留言:0更新日期:2025-03-19 20:24
本发明专利技术属于生物信息领域,具体涉及基于S‑EPTS/LM‑PCR的检测CRISPR‑Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,所述方法是在GUIDE‑seq方法的基础上,使用S‑EPTS/LM‑PCR替换PCR。本发明专利技术具有如下有益效果:1)通过引入S‑EPTS‑PCR技术,优化了PCR扩增条件,显著提高了对低频脱靶事件的检测能力,达到了增强检测灵敏度的效果;2)通过开发先进的生物信息学算法,实现了对多个靶点脱靶事件的准确区分和归因,达到了深入理解脱靶机制的效果;3)针通过综合分析工具的开发,提供了编辑框大小、可视化展示以及脱靶位点是否在癌相关基因上等详细信息,达到了显著提升临床应用价值的效果。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物信息领域,具体涉及e-guideseq:基于s-epts/lm-pcr的检测crispr-cas9基因编辑系统脱靶效应的方法。


技术介绍

1、在当前基因编辑疗法与细胞疗法迅速发展的背景下,crispr-cas9系统以其高效、简便的特点成为研究和临床应用的宠儿,crispr-cas9系统能够对生物体基因组的特定位点进行精确修饰,为遗传性疾病的治疗开辟了全新的前景。然而,随着其在基因治疗中的应用日益广泛,crispr-cas9系统的脱靶效应(即非目标位点的意外编辑)成为了一个不容忽视的问题。脱靶效应可能导致非预期的基因突变,进而影响细胞功能甚至引发疾病,因此,系统性地评估基因编辑系统中的脱靶效应,是确保其在临床应用中实现安全性和有效性的核心步骤,也是提升其成功率的关键保障。

2、guide-seq(genome-wide,unbiased identification of dsbs enabled bysequencing)是一种广泛使用的crispr-cas脱靶位点检测技术,它通过在基因编辑过程中引入特定的标记,利用这些标记来本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法是基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法。

2.基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法是在GUIDE-seq方法的基础上,使用S-EPTS/LM-PCR替换PCR。

3.基于S-EPTS/LM-PCR的检测CRISPR-Cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,...

【技术特征摘要】

1.基于s-epts/lm-pcr的检测crispr-cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法是基于s-epts/lm-pcr的检测crispr-cas9基因编辑系统脱靶效应的方法。

2.基于s-epts/lm-pcr的检测crispr-cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法是在guide-seq方法的基础上,使用s-epts/lm-pcr替换pcr。

3.基于s-epts/lm-pcr的检测crispr-cas9基因编辑系统脱靶效应的方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在...

【专利技术属性】
技术研发人员:倪帅朱凤娇阚科佳王玉珏李瑞黄梓熙姜运平高三明侯宇宸王威何峰吴宁
申请(专利权)人:上海唯可生物科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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