使用DNA甲基化标志物对晚期腺瘤和/或结直肠癌进行分层和早期检测的方法技术

本发明专利技术特别提供了使用DNA甲基化标志物以对晚期腺瘤和/或结直肠癌进行检测、诊断、预测、监测、筛查、分期和/或提供生存预后的方法和系统。例如，本文描述了使得能够从人类生物样品中对晚期腺瘤(AA)和/或结直肠癌(CRC)患者进行高精度的分类和预后评估的DNA甲基化标志物。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本专利技术一般涉及用于对晚期腺瘤和/或结直肠癌进行检测、诊断、预测、监测、筛查、分期和/或提供生存预后的方法和系统。

技术介绍

1、疾病检测是预防疾病进展、诊断和治疗的重要部分。例如，结直肠癌(crc)的早期检测已表现出通过对crc的早期治疗改善crc患者的结果。然而，尽管现有工具可用于筛查和诊断crc及其他癌症，但每年仍有数百万个体死于诸如crc等疾病，这些疾病可通过早期干预和检测来治疗。现有的疾病筛查和诊断工具有所不足。

2、脱氧核糖核酸(dna)甲基化(dname)在各种物种中是一种重要的表观遗传学标志物。脊椎动物中的dna甲基化的特征在于向胞嘧啶的c5位添加甲基或羟甲基，其主要发生在cg二核苷酸的情况下。甲基化状态的dna改变是crc和其他人类癌症中癌症相关基因(包括抑癌基因)的失活机制。图1示出与正常细胞相比，在肿瘤细胞中dna甲基化如何改变基因激活的简化实例。

3、dna甲基化影响包括例如细胞分化在内的多种细胞过程。因此，甲基化失调可导致疾病，包括癌症。dna甲基化的改变积累(例如高甲基化或低甲基化)可产生癌细胞，特别是本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种检测标志物的高甲基化以识别人类受试者的病症的方法，所述方法包括：

2.如权利要求1所述的方法，其中，所述样品是选自由组织样品、血液样品、粪便样品和血液制品样品组成的组中的成员。

3.如权利要求1所述的方法，其中，所述样品包含来自所述人类受试者的血液或血浆中的DNA。

4.如权利要求1所述的方法，其中，所述DNA是所述人类受试者的无细胞DNA(cfDNA)。

5.如权利要求1所述的方法，其中，所述方法包括使用下一代测序(NGS)确定所述一个或多个标志物各自的甲基化状态。

6.如权利要求1所述的方法，其中，所述方法包括：使用...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种检测标志物的高甲基化以识别人类受试者的病症的方法，所述方法包括：

2.如权利要求1所述的方法，其中，所述样品是选自由组织样品、血液样品、粪便样品和血液制品样品组成的组中的成员。

3.如权利要求1所述的方法，其中，所述样品包含来自所述人类受试者的血液或血浆中的dna。

4.如权利要求1所述的方法，其中，所述dna是所述人类受试者的无细胞dna(cfdna)。

5.如权利要求1所述的方法，其中，所述方法包括使用下一代测序(ngs)确定所述一个或多个标志物各自的甲基化状态。

6.如权利要求1所述的方法，其中，所述方法包括：使用一个或多个富集目标区域的捕获诱饵来捕获一个或多个相应的甲基化基因座。

7.如权利要求1所述的方法，其中，每个甲基化基因座的长度等于或小于302bp。

8.一种检测标志物的甲基化状态的方法，所述方法包括：

9.如权利要求8所述的方法，其中，所述多个dna片段(总共)包含至少1ng的dna。

10.如权利要求8所述的方法，其中，所述多个dna片段基本上由各自的长度为10bp至800bp的dna片段组成。

11.如权利要求8所述的方法，其中，所述多个dna片段基本上由各自的长度为1000bp至200000bp的dna片段组成。

12.如权利要求8所述的方法，其中，所述多个序列读段各自为至少50bp。

13.如权利要求1所述的方法，其中，所述一个或多个标志物中的至少一个是包含seqid no.3或seq id no.14的至少一部分的甲基化基因座。

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【专利技术属性】
技术研发人员：P·C·诺格尔，J·C·希加雷达·阿尔马拉斯，F·马蒂亚·曼库索，K·克鲁斯马，A·雷克纳·贝尔梅霍，M·切西科拉，P·佩雷斯·马丁内斯，P·A·卡米诺·法亚切，P·科纳普，V·E·扎耶克，S·扎沃德尼克，C·诺拉·科洛默，F·特林卡多·阿隆索，
申请(专利权)人：通用诊断股份公司，
类型：发明
国别省市：