一种CYP2D6基因分型检测的引物及方法技术

技术编号:43564232 阅读:16 留言:0更新日期:2024-12-06 17:35
本发明专利技术涉及一种CYP2D6基因分型检测的引物及方法,使用特异性引物PCR扩增获得CYP2D6基因片段;获取的目的PCR产物构建三代测序文库;对所建立的文库进行磁珠纯化;对完成纯化后的文库进行混库;取混合文库,上机测序;解决了传统测序方法准确度不高且测序长度不长的短板,不用通过组装即可得到完整的CYP2D6基因序列或者缺失、重组的序列,并且有效提高分辨率和准确度;可完全检测新的等位基因,区分单倍型、精准分型,让各类分型无所遁形;同时本方案检测通量大,多个样本同时检测,实验流程可实现自动化,大大减少人力物力财力。

【技术实现步骤摘要】

本申请涉及基因分型检测,尤其涉及一种cyp2d6基因分型检测的引物及方法。


技术介绍

1、cyp2d6(cytochromep4502d6)是一种由cyp2d6基因编码的酶,肝脏中该酶的含量仅占p450肝脏蛋白总量的2~9%,但却参与20~30%左右常用药物的代谢,包括抗抑郁药、抗心律失常药、抗精神病药和镇痛药等。不同个体间cyp2d6酶活性有很大差异,主要受cyp2d6基因转录编码的影响,导致其功能发生较大差异。cyp2d6基因具有高度的多态性,包括单核苷酸多态(snps)、插入/缺失(indels)、拷贝数变异(cnv)、结构变异(sv),以及与邻近的同源cyp2d7假基因融合,目前在药物基因变异pharmvar数据库中收录了300多个cyp2d6等位基因,不同等位基因变异引起酶活性以及酶数量的差异,其编码蛋白的酶活性表现为缺失、降低、正常或是增加等几种类型,进而影响用药疗效。检测cyp2d6基因的单核苷酸多态性、寡核苷酸插入和缺失能够检测cyp2d6酶活性的缺失和降低,检测cyp2d6基因的拷贝数增加和基因缺失可检测cyp2d6酶活性增高和降低。通过本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种CYP2D6基因分型的检测引物,其特征在于,包括:CYP2D6基因的特异性扩增引物序列如下:

2.一种CYP2D6基因分型检测的方法,其特征在于,包括:

3.根据权利要求2所述的一种CYP2D6基因分型检测的方法,其特征在于,对CYP2D6基因进行PCR扩增的方法包括:

4.根据权利要求2所述的一种CYP2D6基因分型检测的方法,其特征在于,构建文库的方法包括:

5.根据权利要求4所述的一种CYP2D6基因分型检测的方法,其特征在于,对所建立的文库进行纯化的方法包括:

【技术特征摘要】

1.一种cyp2d6基因分型的检测引物,其特征在于,包括:cyp2d6基因的特异性扩增引物序列如下:

2.一种cyp2d6基因分型检测的方法,其特征在于,包括:

3.根据权利要求2所述的一种cyp2d6基因分型检测的方法,其特征在于,对cy...

【专利技术属性】
技术研发人员:王博陈超琼张悦王硕杨龙
申请(专利权)人:西安浩瑞基因技术有限公司
类型:发明
国别省市:

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