【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、基因表达的错误调控是许多疾病的根本原因(例如，在哺乳动物中，例如人)。许多疾病和病症与多个相关基因有关。需要新的工具、系统和方法来改变(例如，减少)多个相关基因的表达。
技术实现思路
1、本披露尤其提供了表达阻遏物或包含表达阻遏物的系统，其可用于调节(例如降低)位于cxcl基因座内的一个或多个靶基因(例如，一个或多个cxcl基因)的表达，该cxcl基因座包括顺式作用调节元件。
2、一方面，本披露提供了表达阻遏物，其包含：
3、与靶位点结合的第一靶向部分，该靶位点包含顺式作用调节元件，例如增强子(例如cxcl基因的增强子)；以及
4、第一效应子部分。
5、一方面，本披露提供了表达阻遏物，其包含：
6、与靶位点结合的第一靶向部分，其中该靶位点在cxcl基因座的顺式作用调节元件内，以及
7、任选地，第一效应子部分，
8、其中该表达阻遏物能够降低cxcl基因的表达。
9、一方面，本披露提...
【技术保护点】
1.一种表达阻遏物，其包含：
2.如权利要求1所述的表达阻遏物，其中该靶位点在基因组坐标chr4:74591400-74593000或chr4:74982639-74983600(基于hg19人基因组参考组装)内。
3.一种表达阻遏物，其包含：
4.如权利要求1-3中任一项所述的表达阻遏物，其中该靶位点选自：
5.如权利要求1-4所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分在选自以下的靶位点上游或下游500、300、200、100或50个核苷酸内结合：
6.一种表达阻遏物，其包含：
7.一种表达阻遏物，其
...
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种表达阻遏物，其包含：
2.如权利要求1所述的表达阻遏物，其中该靶位点在基因组坐标chr4:74591400-74593000或chr4:74982639-74983600(基于hg19人基因组参考组装)内。
3.一种表达阻遏物，其包含：
4.如权利要求1-3中任一项所述的表达阻遏物，其中该靶位点选自：
5.如权利要求1-4所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分在选自以下的靶位点上游或下游500、300、200、100或50个核苷酸内结合：
6.一种表达阻遏物，其包含：
7.一种表达阻遏物，其包含：
8.一种表达阻遏物，其包含：
9.一种表达阻遏物，其包含：
10.如权利要求1-4中任一项所述的表达阻遏物，其中该靶序列包含根据seq id no:134的序列。
11.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分包含本文所述的效应子，例如，krab、mq1、dnmt1、dnmt3a1、dnmt3a2、dnmt3b1、dnmt3b2、dnmt3b3、dnmt3b4、dnmt3b5、dnmt3b6、dnmt3l、ezh2、hdac8、mecp2、hp1、rbbp4、rest、fog1、suz12、setdb1、setdb2、ehmt2(即g9a)、ehmt1(即glp)、suv39h1、hdac1、hdac2、hdac3、hdac4、hdac5、hdac6、hdac7、hdac8、hdac9、hdac10、hdac11、sirt1、sirt2、sirt3、sirt4、sirt5、sirt6、sirt7、sirt8、sirt9、ezh1、suv39h2、setd8、suv420h1、suv420h2或dnmt3，或其任一个的功能变体或片段。
12.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分通过接头连接到该靶向部分。
13.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分在该靶向部分的c末端。
14.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分在该靶向部分的n末端。
15.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分由核苷酸序列编码，该核苷酸序列选自seq id no:10、14、16、18、66、68中任一个，或与其具有至少80％、85％、90％、95％、99％或100％同一性或与其差异不多于20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个位置的序列。
16.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分包含根据seqid no:11、12、13、15、17、19、67中任一个的氨基酸序列，或与其具有至少80％、85％、90％、95％、99％或100％同一性或与其差异不多于20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个位置的序列。
17.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分是mq1或其功能变体或片段，例如，其中该第一效应子部分包含seq id no:11或12的氨基酸序列、或与其具有至少80％、85％、90％、95％、99％或100％同一性或与其差异不多于20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个位置的序列，其中任选地该第一效应子部分在该第一靶向部分的c末端。
18.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分是krab或其功能变体或片段，例如，其中该第一效应子部分包含seq id no:13的氨基酸序列、或与其具有至少80％、85％、90％、95％、99％或100％同一性或与其差异不多于20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个位置的序列，其中任选地该第一效应子部分在该第一靶向部分的c末端。
19.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该效应子部分包含dna甲基转移酶，例如mq1或其片段或变体。
20.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该效应子部分包含转录阻遏物，例如包含krab或其片段或变体。
21.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该靶位点具有15-20、20-25、25-30或30-35个核苷酸的长度。
22.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分包含锌指结构域或tal结构域。
23.如权利要求22所述的表达阻遏物，其中该锌指结构域包含1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个锌指(并且任选地不多于11、10、9、8、7、6或5个锌指)。
24.如权利要求22或23所述的表达阻遏物，其中该锌指结构域包含1-10、1-9、1-8、1-7、1-6、1-5、1-4、1-3、1-2、2-10、2-9、2-8、2-7、2-6、2-5、2-4、2-3、3-10、3-9、3-8、3-7、3-6、3-5、3-4、4-10、4-9、4-8、4-7、4-6、4-5、5-10、5-9、5-8、5-7、5-6、6-10、6-9、6-8、6-7、7-10、7-9、7-8、8-10、8-9、或9-10个锌指。
25.如权利要求22-24中任一项所述的表达阻遏物，其中该锌指结构域包含3、7或9个锌指。
26.如权利要求1-21中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分包含crispr-cas结构域。
27.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，该表达阻遏物能够降低多个cxcl基因(例如，2个、3个、4个、5个、6个、7个或8个cxcl基因)的表达。
28.如权利要求27所述的表达阻遏物，该表达阻遏物能够降低cxcl1、cxcl2、cxcl3、cxcl4、cxcl5、cxcl6、cxcl7或il-8中的一个或多个(例如，2个、3个、4个、5个、6个、7个或8个)的表达。
29.如权利要求1-28中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一效应子部分是持久效应子部分或瞬时效应子部分。
30.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分包含锌指结构域，并且该第一效应子部分包含转录阻遏物，例如krab或其片段或变体。
31.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分包含锌指结构域，并且该第一效应子部分包含表观遗传修饰部分，例如dna甲基转移酶，例如mq1或其片段或变体。
32.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一靶向部分包含根据seqid no:114的氨基酸序列，或与其具有至少80％、85％、90％、95％或99％同一性的序列。
33.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，该表达阻遏物包含seq id no:306的氨基酸序列或与其具有至少80％、85％、90％、95％或99％同一性的序列。
34.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，该表达阻遏物包含seq id no:152-161或164-169中任一个的氨基酸序列、或与其具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％、99％同一性的序列、或与其差异不多于20个、19个、18个、17个、16个、15个、14个、13个、12个、11个、10个、9个、8个、7个、6个、5个、4个、3个、2个或1个位置的序列。
35.如前述权利要求中任一项所述的表达阻遏物，该表达阻遏物：(i)包含一个或多个核定位信号序列(nls)，或(ii)不包含nls。
36.如前述实施例中任一项所述的表达阻遏物，该表达阻遏物在n末端包含第一nls，例如，其中该第一nls具有seq id no:63或64的序列。
37.如前述实施例中任一项所述的表达阻遏物，其在c末端包含nls，例如第二nls，例如具有seq id no:63或64的序列。
38.如前述实施例中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一和该第二nls具有相同序列。
39.如实施例36-38中任一项所述的表达阻遏物，其中该第一和该第二nls具有不同序列。
40.如前述实施例中任一项所述的表达阻遏物，其中该表达阻遏物与该靶位点的结合增加该cxcl基因座中的位点处的甲基化，例如，增加该cxcl基因座的该e1顺式作用调节元件或该cxcl基因座的该e2顺式作用调节元件处的甲基化。
41.一种系统，其包含：
42.如权利要求41所述的系统，其中该第二表达阻遏物包含：
43.如权利要求42所述的系统，其中第二表达阻遏物结合该cxcl基因座的e1顺式作用调节元件、该cxcl基因座的e2顺式作用调节元件或il8启动子。
44.如权利要求42或43所述的系统，其中该第二靶位点在以下坐标内：grch37：chr4:74606162-74606184，grch37：chr4:74605723-74606223或grch37：chr4:74605223-74606223，或其5'或3'的1kb内。
45.如权利要求42-44中任一项所述的系统，其中该第二靶位点是grch37：chr4:74606162-74606184或chr4:74606039-74606056。
46.如权利要求42-45中任一项所述的系统，其中该第二靶向部分是聚簇的调节间隔短回文重复(crispr)cas结构域。
47.如权利要求42-46中任一项所述的系统，其中该第二靶向部分包含根据seq id no:268的氨基酸序列，或与其具有至少80％、85％、90％、95％或99％同一性的序列。
48.如权利要求42-47中任一项所述的系统，其中该第二表达阻遏物包含根据seq idno:307的氨基酸序列，或与其具有至少80％、85％、90％、95％或99％同一性的序列。
49.如权利要求42-48中任一项所述的系统，其中：
50.一种核酸，其编码如权利要求1-40中任一项所述的表达阻遏物。
51.一种核酸，其编码：如权利要求1-40中任一项所述的第一表达阻遏物，和第二表达阻遏物，例如，降低cxcl基因的表达的第二表达阻遏物，例如，如权利要求41-49中任一项所述的系统的表达阻遏物。
52.一种核酸系统，其包含：
53.如权利要求50-52中任一项所述的核酸或核酸系统，其包含编码该第一靶向部分的区域，其中编码该第一靶向部分的该区域包含seq id no:122-131或194-199中任一个的核苷酸序列或与其具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
54.如权利要求50-53中任一项所述的核酸或核酸系统，其包含编码该第一效应子部分的区域，其中编码该第一效应子部分的该区域包含seq id no:10、14、16、18、66、68中任一个的核苷酸序列，或与其具有至少80％、85％、90％、95％、96％、97％、98％或99％同一性的序列。
55....
【专利技术属性】
技术研发人员：L·A·阮，J·D·法雷利，J·纽曼，L·M·比奇，M·K·贾，C·奥唐奈尔，H·贝拉格扎尔，
申请(专利权)人：旗舰先锋创新V股份有限公司，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。