【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及动物育种，尤其涉及一种与鸡饲料转化率相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、耕地资源稀缺是现代农业发展和保障粮食安全所面临的长期问题。而破解这一难题的关键在于走“节粮型”畜牧业发展道路。肉鸡由于其较高的饲料转化效率不仅有助于节约粮食和有限的土地资源，还有助与降低碳排放，对生产和环保都具有积极意义。
2、饲料转化效率是衡量畜禽对饲料利用效率高低的一项重要的经济技术指标。科研和生产中通常使用剩余采食量（rfi）来衡量饲料转化效率的高低。同时，饲料转化效率作为复杂的数量性状其潜在的生物调节过程受到多种因素的影响。在遗传调控方面，随着高通量测序技术的更新换代和基因组挖掘技术的持续发展，gwas（全基因组关联研究）的方法被广泛应用于畜禽经济性状主效基因的挖掘，相关研究也定位到了多个影响鸡饲料转化效率的候选基因。但由于群体特异性的影响，相关结果在肉鸡中的运用受到限制。
技术实现思路
1、为了解决现有技术存在的问题，本专利技术提供一种与鸡饲料转化率相关的snp分子标记及其应用。
2、本专利技术通过全基因组关联分析（gwas）等方法，筛选到影响饲料转化率的3个关键snp标记（rs15450437、rs314248376或rs15702068）。
3、第一方面，本专利技术提供一种snp分子标记，包括：rs15450437、rs314248376或rs15702068中的一种或多种；
4、以grcg7b参考基因组为基础，所述rs154
5、本专利技术进一步提供一种snp分子标记，所述snp分子标记包括如seq id no.1-3任一项所示的核苷酸序列，位于如下任意一种或多种位点：
6、i）如seq id no.1所示核苷酸序列第97位；
7、ii）如seq id no.2所示核苷酸序列第85位；
8、iii）如seq id no.3所示核苷酸序列第49位。
9、第二方面，本专利技术进一步提供一种引物对，所述引物对包括如下任意一种或多种：
10、i）如seq id no.4和seq id no.5所示的核苷酸序列；
11、ii）如seq id no.6和seq id no.7所示的核苷酸序列；
12、iii）如seq id no.8和seq id no.9所示的核苷酸序列。
13、本专利技术进一步提供一种试剂盒，所述试剂盒包括所述的snp分子标记，或所述的引物对。
14、第三方面，本专利技术提供所述的snp分子标记，或所述的引物对，或所述的试剂盒在鸡的饲料转化率的检测中的应用。
15、进一步地，所述应用包括：
16、（1）提取待测鸡的基因组dna；
17、（2）以所述基因组dna为模板，采用所述引物对进行扩增；
18、（3）针对扩增产物进行检测，根据检测结果判断所述待测鸡的饲料转化率。
19、进一步地，所述根据检测结果判断所述待测鸡的饲料转化率包括：
20、待测鸡的饲料转化率由低到高对应位点rs15450437的多态性cc、tc和tt；
21、待测鸡的饲料转化率由低到高对应位点rs314248376的多态性cc、ct和tt；
22、待测鸡的饲料转化率由低到高对应位点rs15702068的多态性gg、ag和aa。
23、本专利技术进一步提供所述的snp分子标记，或所述的引物对，或所述的试剂盒在鸡的育种中的应用。
24、进一步地，所述应用包括：培育低饲料转化率的鸡品种。
25、作为一种优选具体实施方式，本专利技术提供一种选择饲料转化率较低肉种鸡品系的方法，包括：
26、（1）获得鸡样本基因组dna，进行全基因组snp分型；
27、（2）获得所有样本的3个snp标记rs15450437、rs314248376、rs15702068的基因分型数据；
28、（3）对步骤（2）中的基因分型数据进行全基因组育种值估计，选留育种值较优个体。
29、进一步地，所述鸡为肉种鸡。
30、基因组选择（gs）技术是目前畜禽育种中广泛应用的育种方法。其本质是利用全基因组范围的遗传标记对个体的每个标记的效应值进行估计，然后累加个体标记效应值从而得到基因组估计育种值（gebv），最终进行排序、选择个体。目前，vanraden提出的g矩阵计算方法应用最为广泛。但在实际应用过程中，仅有小部分snp位点对目标性状具有较大效应，多数性状受到微效多基因、多位点的调控。因此，zhang等建立了整合少数显著snp构建权重g矩阵进行gebv估计的新方法，即ga-blup，对预测准确性具有显著的改善作用。
31、本专利技术提供的snp标记与整合显著snp的gebv估计方法可以作为鸡饲料转化率性状选育的重要参考，在遗传选育中具有重要实际应用价值。分析发现，3个关键snp对饲料转化率有显著影响。有利于提高选育进展，缩短选育周期，加快自主培育品种的改良进程和肉鸡新品系的培育。
32、本专利技术具备如下有益效果：
33、本专利技术通过gwas分析研究筛选得到了3个与鸡饲料转化率相关的snp分子标记，基于这3个snp分子标记的多态性检测可以实现鸡饲料转化率的检测，具有较高准确性，有利于加速鸡饲料转化率性状的遗传改良。本专利技术提供的snp分子标记可以应用于鸡的育种中，培育不同饲料转化率的鸡品种，这在动物育种领域具有重要意义。
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1.一种SNP分子标记，其特征在于，包括：rs15450437、rs314248376或rs15702068中的一种或多种；
2.一种SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记包括如SEQ ID NO.1-3任一项所示的核苷酸序列，位于如下任意一种或多种位点：
3.一种引物对，其特征在于，所述引物对包括如下任意一种或多种：
4.一种试剂盒，其特征在于，包括如权利要求1或2所述的SNP分子标记，或权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1或2所述的SNP分子标记，或权利要求3所述的引物对，或权利要求4所述的试剂盒在鸡的饲料转化率的检测中的应用。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述应用包括：
7.根据权利要求6所述的应用，其特征在于，所述根据检测结果判断所述待测鸡的饲料转化率包括：
8.根据权利要求6或7所述的应用，其特征在于，所述扩增的反应程序包括：
9.权利要求1或2所述的SNP分子标记，或权利要求3所述的引物对，或权利要求4所述的试剂盒在鸡的育种中的应用。
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【技术特征摘要】
1.一种snp分子标记，其特征在于，包括：rs15450437、rs314248376或rs15702068中的一种或多种；
2.一种snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记包括如seq id no.1-3任一项所示的核苷酸序列，位于如下任意一种或多种位点：
3.一种引物对，其特征在于，所述引物对包括如下任意一种或多种：
4.一种试剂盒，其特征在于，包括如权利要求1或2所述的snp分子标记，或权利要求3所述的引物对。
5.权利要求1或2所述的snp分子标记，或权利要求3所述的引物对...
【专利技术属性】
技术研发人员：赵桂苹，刘冉冉，文杰，马小春，郑麦青，安炳星，
申请(专利权)人：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：
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