【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及用于测定神经调节蛋白-1(nrg1)融合多核苷酸的液态活检测定法,特别是其用于诊断或治疗疾病(例如癌症)的用途。本专利技术还公开一种新型神经调节蛋白-1(nrg1)融合多核苷酸。
技术介绍
1、nrg1融合基因虽然罕见,但其是可操作的致癌性驱动因子且存在于实体瘤之中。在dhanasekaran等人(nature communications,2014,5:5893)、以及在jonna等人(clincancer res,2019,25(16):4966-4972)中揭示各种nrg1融合基因。除了罕见之外,nrg1融合物的另一特征是它们可能由涉及nrg1的不可预测的染色体重排事件所引起。
2、鉴定nrg1融合物的标准方法是通过对实体瘤的活检进行分子筛选,其通常涉及对皮肤物理完整性的具影响力的破坏,以及可能对内部器官的具影响力的破坏以达到研究中的肿瘤,并且可能仍然不能鉴定许多nrg1融合物的存在。因此,需要新的测定方法来测定和诊断癌症中的nrg1融合多核苷酸,特别是新型nrg1融合多核苷酸。
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...【技术保护点】
1.一种用于测定样本中是否存在NRG1融合多核苷酸的方法,所述方法包含:
2.如权利要求1所述的方法,其中在所述NRG1融合多核苷酸中,所述第二多核苷酸位于所述NRG1多核苷酸的5'端。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述NRG1多核苷酸包含EGF样结构域。
4.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述NRG1多核苷酸与所述第二多核苷酸之间的融合物为符合读框融合物。
5.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述第二多核苷酸选自PVALB多核苷酸、VAPB多核苷酸、CADM1多核苷酸、CD44多核苷酸或SLC3A
...【技术特征摘要】
1.一种用于测定样本中是否存在nrg1融合多核苷酸的方法,所述方法包含:
2.如权利要求1所述的方法,其中在所述nrg1融合多核苷酸中,所述第二多核苷酸位于所述nrg1多核苷酸的5'端。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中所述nrg1多核苷酸包含egf样结构域。
4.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述nrg1多核苷酸与所述第二多核苷酸之间的融合物为符合读框融合物。
5.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述第二多核苷酸选自pvalb多核苷酸、vapb多核苷酸、cadm1多核苷酸、cd44多核苷酸或slc3a2多核苷酸、vtcn1多核苷酸、cdh1多核苷酸、cxadr多核苷酸、gtf2e2多核苷酸、csmd1多核苷酸、ptn多核苷酸、st14多核苷酸、thbs1多核苷酸、agrn多核苷酸、app多核苷酸、wrn多核苷酸、daam1多核苷酸,asph多核苷酸、notch2多核苷酸、cd74多核苷酸、sdc4多核苷酸、slc4a4多核苷酸、zfat多核苷酸以及dscaml1多核苷酸。
6.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述nrg1多核苷酸包含:(i)seq id no:14的序列,(ii)与seq id no:14具有至少约70%序列一致性的序列,或(iii)包含(i)或(ii)的至少约20个连续核苷酸的片段。
7.如权利要求5或6所述的方法,其中
8.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述nrg1融合多核苷酸为:
9.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述nrg1融合多核苷酸包含seq id no:19、27、41、62、74、83、102、109、120、146、154、176、201、217、225、240、260、298、325、353、364、376、384、413、432、468或469的序列。
10.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中所述方法还包含从样本中分离出一种或多种的无细胞rna(cfrna)、循环性肿瘤rna(ctrna)、囊泡rna、外泌体和细胞外囊泡。
11.如前述权利要求中任一项所述的方法,其中当样本中存在nrg1融合多核苷酸时,则所述方法进一步包含扩增所述nrg1融合多核苷酸。
12.如前述权利要求中任...
【专利技术属性】
技术研发人员:埃内斯托·伊萨克·沃瑟曼,玉龙·吉尔斯·拉默特斯范布伦,
申请(专利权)人:美勒斯公司,
类型:发明
国别省市:
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