检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组和应用制造技术

本发明专利技术涉及核酸检测领域，提供一种检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组和应用。本发明专利技术提供的用于结核分枝杆菌复合群及其利福平、异烟肼和乙胺丁醇耐药性检测的方法，能够对上述突变位点和特异序列实现特异性检测，具有准确性强、灵敏度高、重复性好以及成本低、检测周期短且结果直观无需生信介入等优势。本发明专利技术更符合结核分枝杆菌耐药株发生的基因突变特征，克服了现有技术中一次性检测SNP位点较少的缺陷，具有准确性强、灵敏度高、重复性好以及成本低、检测周期短的特点，有很好的应用前景。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及核酸检测领域，具体地说，涉及一种检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组和应用。

技术介绍

1、结核病是由结核分枝杆菌复合群感染引起的一种慢性传染病，是单一传染源导致死亡最多的传染病。耐多药/利福平耐药结核病的广泛流行也给结核病的控制带来了严峻挑战。

2、耐药结核病的诊断依赖于对结核病患者感染的结核分枝杆菌复合群耐药性的诊断。目前常用的耐药性检测方法包括表型药敏方法及分子检测方法。表型药敏方法包括传统的基于罗氏培养基的比例法和绝对浓度法(约需28天)，基于液体培养基的bactecmgit960快速药敏培养法(约需14天)，近年来兴起的微孔板微量肉汤稀释法(需7-14天)，此大类方法需要预先获得结核分枝杆菌复合群纯培养物，耗时较长，检测繁琐，部分方法需要昂贵的试剂和设备。目前常用的分子检测方法如实时荧光定量pcr法(溶解曲线法、探针法)、生物芯片法、线性探针法和斑点杂交法，此类方法有的可以直接检测临床样本，但多数方法仅能检测结核分枝杆菌复合群培养物，检测时间均较短，约需3h～3天，但多数方法检测通量不足、检测的药物耐药性有限。...

【技术保护点】

1.检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组，其特征在于，包括用于检测结核分枝杆菌复合群IS6110基因、利福平耐药性基因rpoB、异烟肼耐药性基因katG、异烟肼耐药性基因fabG1和乙胺丁醇耐药性基因embB的引物对，它们的核苷酸序列分别如SEQ ID NO:1-2、SEQ ID NO:3-4、SEQ ID NO:5-6、SEQ ID NO:7-8和SEQ ID NO:9-10所示。

2.基于MassArray核酸质谱检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组合，其特征在于，包括权利要求1所述的引物组以及用于检测如下16个基因位点的单碱基延伸引物：IS6110-990G、r...

【技术特征摘要】

1.检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组，其特征在于，包括用于检测结核分枝杆菌复合群is6110基因、利福平耐药性基因rpob、异烟肼耐药性基因katg、异烟肼耐药性基因fabg1和乙胺丁醇耐药性基因embb的引物对，它们的核苷酸序列分别如seq id no:1-2、seq id no:3-4、seq id no:5-6、seq id no:7-8和seq id no:9-10所示。

2.基于massarray核酸质谱检测结核分枝杆菌复合群及其耐药性的引物组合，其特征在于，包括权利要求1所述的引物组以及用于检测如下16个基因位点的单碱基延伸引物：is6110-990g、rpob526_ac、rpob526ca_、rpob526c_c、rpob516_ac、rpob516g_c、rpob516ga_、rpob531t_g、rpob533c_g、katg315a_c、katg315_gc、fabg1 c(-15)_、embb306at_、embb306_tg、embb406_gc和embb406g_c，它们的核苷酸序列分别如seq id no:11-26所示。

3.含有权利要求1所述引物组或权利要求2所述引物组合的检测试剂或试剂盒。

【专利技术属性】
技术研发人员：李桂莲，杨林军，刘海灿，朱家强，万康林，
申请(专利权)人：中国疾病预防控制中心传染病预防控制所，
类型：发明
国别省市：