可逆终止核苷酸及其在DNA合成测序及单分子测序中的应用制造技术

本发明专利技术公开了一种可逆终止核苷酸及其在DNA合成测序及单分子测序中的应用，所述荧光标记核苷酸典型结构其中Base为U,C,A,G四个不同的碱基；R是将噻唑烷连接单元与核苷酸连接在一起的化学分子基团；Cleavable Linker为噻唑烷连接单元；R1是将噻唑烷连接单元与荧光素连接在一起的化学分子基团；Dye是荧光染料。该可逆终止核苷酸在参与DNA链延伸后，可快速发生断裂。断裂后，残留在碱基上的基团较小，有利于DNA合成测序的顺利进行。在DNA合成测序及单分子测序中，连接单元可快死断裂，反应干净彻底，几乎没有观察到副反应发生；且该类化合物合成简单方便，且可以大量合成，能够极大降低测序成本。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及基因工程，具体地，涉及一种可逆终止核苷酸及其在dna合成测序及单分子测序中的应用。

技术介绍

1、dna测序技术是现代生物学研究中重要的手段之一。人类基因组计划完成后，dna测序技术得到了迅速发展。dna测序(dna sequencing)是指分析特定dna片段的碱基序列，也就是腺嘌呤(a)、胸腺嘧啶(t)、胞嘧啶(c)与鸟嘌呤(g)的排列方式。发展精确、高通量、低成本的dna测序方法对于生物、医药科学等具有非常重要的意义。

2、合成法测序(sequencing by synthesis,sbs)是新一代dna测序技术之一。合成测序方法通过把大量待测的模板dna片段进行固定，并在固定的dna测序模板上杂交结合通用的dna引物，分别控制四种核苷酸在dna引物上的延伸。通过检测延伸反应过程或延伸核苷酸，实现高通量并行的dna序列信息的检测。

3、在合成法测序中，首先要合成dna链延伸所需要的四色荧光标记四种不同碱基的核苷酸，即可逆终止核苷酸(reversible terminator)。早期的可逆终止核苷酸，除了要求3ˊ-本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种荧光标记可逆终止核苷酸，结构式如下所示：

2.根据权利要求1所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，所述Dye选自Cy3、Cy5、Cy2、Cy3.5、TAMRA、FITC、sulfo-Cy3、sulfo-Cy2、sulfo-Cy5或sulfo-Cy3.5。

3.根据权利要求1所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，其结构式为：

4.根据权利要求3所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，其结构式为：

5.一种根据权利要求1-4中任一项所述的荧光标记可逆终止核苷酸在DNA合成测序和/或单分子测序中的用途。>

6.一种根据...

【技术特征摘要】

1.一种荧光标记可逆终止核苷酸，结构式如下所示：

2.根据权利要求1所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，所述dye选自cy3、cy5、cy2、cy3.5、tamra、fitc、sulfo-cy3、sulfo-cy2、sulfo-cy5或sulfo-cy3.5。

3.根据权利要求1所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，其结构式为：

4.根据权利要求3所述的荧光标记可逆终止核苷酸，其特征在于，其结构式为：

5.一种根据权利要求1-4中任一项所述的荧光标记可逆终止核苷酸在dna合成测序和/或单分子测序中的用途。

6.一种根据权利要求1-4中任一项所述的荧光标记可逆终止核苷酸的合成方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：

7.根据权利要求6所述的荧光标记可逆终止核苷酸的合成方法，其特征在于，所述化合物是通过包括如下步骤的方法制备而得：...

【专利技术属性】
技术研发人员：沈玉梅，王平阳，邵志峰，汤博为，吴开杰，孙嘉伟，
申请(专利权)人：上海交通大学，
类型：发明
国别省市：