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【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
技术介绍
1、已知所有理论质谱的顺序窗口获取(swath)质谱方法用于识别复杂蛋白质混合物中的组分。例如,swath方法已经应用于蛋白质组学,以根据包含数百或数千种不同蛋白质和其它生物物种的复杂生物样品中的质量来识别各个蛋白质。在串联质谱法中,作为质量过滤器实现的第一四极连续地对期望的质量范围进行采样作为质量范围内的一系列重叠片段,使得在第二四极中生成和观察到的每个产物离子可以与原始样本中的产物相关联。这种迭代扫描过程返回大量数据,并且常规而言对获取的数据的分析要求对数据进行严格的处理,以将检测到的每个产物离子与产生产物离子的前体以及相对于其在样本中的浓度的强度两者相关联。
2、重叠的前体离子峰或产物离子峰使所获取数据的分析复杂化,并且会导致前体峰的移位,或者由于实际不存在的附加前体峰而出现噪声。
技术实现思路
1、提供本
技术实现思路
是为了以简化的形式介绍一些概念的选择,这些概念将在下面的详细描述中进一步描述。本
技术实现思路
并非旨在识别所要求保护的主题的必要或基本特征。本
技术实现思路
也不旨在用于限制所要求保护的主题的范围。
2、本文公开了用于将质谱中的产物离子与前体离子相关联的方法。在某些方面,方法可以包括获得跨质量范围的样本的质谱系列,该质谱系列中的每个质谱具有由宽度(w)限定的前体传输窗口,该宽度与该质谱系列的至少两个质谱的宽度重叠步长尺寸(s),并将与产物离子对应的前体离子m/z确定为产物离子在该质谱系列的最大量中出现的m/z。
3、在其
4、本文公开的各方面还可以包括检测形成质谱系列的该系列的每个重叠窗口的一个或多个结果所得的产物离子中的每个产物离子的强度或计数,该质谱系列中的每个质谱与重叠传输窗口的系列中的一个重叠传输窗口对应,确定一个或多个结果所得的产物离子中的至少一个产物离子的前体离子m/z,其中前体离子m/z是产物离子在该质谱系列的由跨质量范围的该重叠传输窗口系列中的每个重叠传输窗口引发的最大量中出现的m/z,并且通过将产物离子的前体离子m/z应用于检测到的强度或计数来计算一个或多个结果所得的产物离子中的每个产物离子的强度。
5、本文还设想串联质谱法系统,并且可以包括(i)串联质谱仪的质量过滤器,其以步长尺寸sm/z按照重叠步长跨前体离子质量范围移动具有前体离子质荷比(m/z)宽度w的前体离子传输窗口,跨该质量范围产生重叠的传输窗口系列,其中质量过滤器在每个重叠步长处在传输窗口内传输前体离子,(ii)质谱仪的裂解设备,其裂解或传输由质量过滤器在每个重叠步长处传输的前体离子,为该系列的每个重叠窗口产生一个或多个结果所得的产物离子,(iii)质谱仪的质量分析器,其为该系列的每个重叠窗口形成质谱数据的该系列的每个重叠窗口检测一个或多个结果所得的产物离子中的每个产物离子的强度或计数,以及(iv)处理器,不是将该系列的每个重叠窗口的质谱数据存储在存储器设备中,而是通过以下方式对质量分析器在数据获取期间实时检测到的每个独特产物离子进行编码:(a)对每个独特产物离子将前体离子m/z确定为产物离子在质谱的系列的由该重叠的传输窗口系列中的每个重叠传输窗口引发的最大量中出现的m/z,以及(b)确定与独特产物离子相关联的强度。
6、前面的概述和下面的详细描述都提供了示例并且仅仅是解释性的。因而,前面的概述和下面的详细描述不应当被认为是限制性的。另外,除了本文所阐述的特征或变化之外,还可以提供特征或变化。例如,某些方面和示例可以针对详细描述中描述的各种特征组合和子组合。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种用于将质谱中的产物离子与前体离子相关联的方法,所述方法包括:
2.如权利要求1所述的方法,其中获得所述质谱系列包括:在串联质谱仪中扫描SWATH获取。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中前体传输窗口中的每一个具有在0.1Da至10Da范围内的宽度(W)。
4.如权利要求1-3中的任一项所述的方法,其中所述步长尺寸在0.1Da至10Da的范围内。
5.如权利要求1-4中的任一项所述的方法,其中所述步长尺寸(S)是恒定的。
6.如权利要求1-5中的任一项所述的方法,其中所述质谱系列包括10至1,000个质谱。
7.如权利要求1-6中的任一项所述的方法,其中确定前体离子m/z包括:通过绘制其中出现所述产物离子的所述质谱系列的量相对于前体传输窗口内的m/z来构造二元离子迹线。
8.如权利要求7所述的方法,还包括:对所述二元离子迹线中的多个重叠的前体离子m/z峰进行去卷积。
9.如权利要求8所述的方法,其中对所述多个重叠的前体离子m/z峰去卷积包括:将三角形形状指派给所述多个重叠的前体
10.如权利要求8或9所述的方法,其中多个重叠的前体m/z峰包括两个或三个峰。
11.如权利要求8-10中的任一项所述的方法,其中多个重叠的前体m/z峰中的每一个具有在0.1Da范围内的前体离子m/z。
12.如权利要求8-11中的任一项所述的方法,其中对多个重叠的前体离子m/z峰进行去卷积的处理要求小于其中通过强度迹线内的峰的去卷积来确定前体离子m/z的其它方面相同的方法的处理要求。
13.如权利要求8-12中的任一项所述的方法,其中对多个重叠的前体离子m/z峰进行去卷积所具有的分辨率大于其中通过对来自强度迹线的峰的去卷积来确定前体离子m/z的其它方面相同的方法所具有的分辨率。
14.如权利要求1-13中的任一项所述的方法,还包括:对形成所述质谱系列的每个前体传输窗口中的所述产物离子检测强度或计数。
15.如权利要求14所述的方法,还包括:从检测到的强度或计数形成累积离子强度迹线。
16.如权利要求1-15中的任一项所述的方法,其中确定与所述产物离子对应的前体离子m/z独立于产物离子强度数据。
17.如权利要求1-16中的任一项所述的方法,其中对所述质谱系列中的每一个实时地确定前体离子m/z。
18.一种用于生成质谱法数据的方法,包括:
19.如权利要求18所述的方法,其中确定所述前体离子m/z包括:对在相同m/z处检测到强度或计数的两个或更多个产物离子的所述前体离子m/z进行去卷积。
20.一种串联质谱法系统,包括:
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种用于将质谱中的产物离子与前体离子相关联的方法,所述方法包括:
2.如权利要求1所述的方法,其中获得所述质谱系列包括:在串联质谱仪中扫描swath获取。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中前体传输窗口中的每一个具有在0.1da至10da范围内的宽度(w)。
4.如权利要求1-3中的任一项所述的方法,其中所述步长尺寸在0.1da至10da的范围内。
5.如权利要求1-4中的任一项所述的方法,其中所述步长尺寸(s)是恒定的。
6.如权利要求1-5中的任一项所述的方法,其中所述质谱系列包括10至1,000个质谱。
7.如权利要求1-6中的任一项所述的方法,其中确定前体离子m/z包括:通过绘制其中出现所述产物离子的所述质谱系列的量相对于前体传输窗口内的m/z来构造二元离子迹线。
8.如权利要求7所述的方法,还包括:对所述二元离子迹线中的多个重叠的前体离子m/z峰进行去卷积。
9.如权利要求8所述的方法,其中对所述多个重叠的前体离子m/z峰去卷积包括:将三角形形状指派给所述多个重叠的前体离子m/z峰中的每一个。
10.如权利要求8或9所述的方法,其中多个重叠的前体m/z峰包括两个或三个峰。
11.如权利要求8-10中的任一项所述的方法,其中多个重叠的前体m/z峰...
【专利技术属性】
技术研发人员:G·伊沃什夫,N·布洛姆菲尔德,
申请(专利权)人:DH科技发展私人贸易有限公司,
类型:发明
国别省市:
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