【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及报价方法，具体涉及基因合成难度评价方法及系统。
技术介绍
1、通过高通量测序等技术“读”dna，让遗传信息解读和应用快速普惠大众，为“基因1.0时代”；正在酝酿的“基因2.0时代”，通过基因合成“写”dna，深度理解、设计和重构生物系统，赋能育种、能源和环境等。
2、特别是基因的下游应用研究，个人获取和制备基因的速度和质量远远不能满足现实的需求，更多的人选择把服务外包给公司。目前基因合成主要是通过寡核苷酸合成、小片段组装技术来实现，由于dna序列的复杂性，对应的生产技术以及周期不尽相同，再加上人为因素的影响，使价格的计算变得困难，影响了合作双方的交互体验，存在很大的改善空间。
3、因此，本领域亟需一种用于基因合成的自动报价方法。
技术实现思路
1、本专利技术提供了一种基因合成难度评价方法以及自动报价方法，该自动报价方法方便需求方及时获取价格详情，大大提高了需求方和供应方的沟通效率。
2、在第一方面，本专利技术提供了一种基因合成难度评价方法，所述方法包括计算待合成序列的gc难度系数、重复难度系数、发夹结构难度系数、poly难度系数、特殊基因难度系数和载体的难度系数，并根据上述难度系数评价所述待合成序列的合成难度系数。
3、在第二方面，本专利技术提供了一种基因合成难度评价系统，所述系统包括存储器和处理器，所述存储器存储有基因合成难度评价程序，所述处理器在运行所述程序时执行第一方面所述的方法的步骤。
4、在第三方面
5、在第四方面，本专利技术提供了一种基因合成自动报价方法，所述方法利用第一方面所述的方法计算的合成难度系数来计算基因合成的价格：如果合成难度系数≥999，则序列异常困难，需单独和客户沟通具体实施方案，进而定价；如果合成难度系数<999，则价格＝基础价格*合成难度系数。
6、在第五方面，本专利技术提供了一种基因合成自动报价系统，所述系统包括存储器和处理器，所述存储器存储有基因合成自动报价程序，所述处理器在运行所述程序时执行第四方面所述的方法的步骤。
7、本专利技术具有以下有益效果：
8、本专利技术提供的基因合成难度评价方法可以定量确定序列的合成难度，基因合成自动报价方法方便需求方及时获取价格详情，大大提高了需求方和供应方的沟通效率。
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1.一种基因合成难度评价方法，其特征在于，所述方法包括计算待合成序列的GC难度系数、重复难度系数、发夹结构难度系数、Poly难度系数、特殊基因难度系数和载体的难度系数，并根据上述难度系数评价所述待合成序列的合成难度系数。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，S202中的所述滑动窗口的长度为30bp。
4.根据权利要求2或3所述的方法，其特征在于，S3中的所述重复序列的长度大于等于10bp。
5.一种基因合成难度评价系统，其特征在于，所述系统包括存储器和处理器，所述存储器存储有基因合成难度评价程序，所述处理器在运行所述程序时执行权利要求1-4中任一项所述的方法的步骤。
6.一种基因合成难度比较方法，其特征在于，对于待比较的序列按照权利要求1-4中任一项所述的方法计算合成难度系数，根据所述合成难度系数比较所述序列的合成难度。
7.一种基因合成自动报价方法，其特征在于，所述方法利用权利要求1-4中任一项所述的方法计算的合成难度系数来计算基因合成
8.一种基因合成自动报价系统，其特征在于，所述系统包括存储器和处理器，所述存储器存储有基因合成自动报价程序，所述处理器在运行所述程序时执行权利要求7所述的方法的步骤。
...【技术特征摘要】
1.一种基因合成难度评价方法，其特征在于，所述方法包括计算待合成序列的gc难度系数、重复难度系数、发夹结构难度系数、poly难度系数、特殊基因难度系数和载体的难度系数，并根据上述难度系数评价所述待合成序列的合成难度系数。
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，s202中的所述滑动窗口的长度为30bp。
4.根据权利要求2或3所述的方法，其特征在于，s3中的所述重复序列的长度大于等于10bp。
5.一种基因合成难度评价系统，其特征在于，所述系统包括存储器和处理器，所述存储器存储有基因合成难度评价程序，所述处理器在运行所述程序时执行权利要求1-...
【专利技术属性】
技术研发人员：马石金，许树涛，赵春德，
申请(专利权)人：天津擎科生物技术有限公司，
类型：发明
国别省市：
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