一种基于多重SNaPshot技术检测DNA甲基化的方法及应用技术

技术编号:41094490 阅读:26 留言:0更新日期:2024-04-25 13:53
本发明专利技术属于基因检测技术领域,具体涉及一种基于多重SNaPshot技术检测DNA甲基化的方法及应用,该方法,首先提取个体DNA,根据亚硫酸氢盐‑PCR的原理,将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,然后利用针对目的基因设计的PCR引物进行PCR扩增,将PCR扩增产物纯化后进行多重SNaPshot测序,获得CpG靶位点的甲基化率。该方法与焦磷酸测序、亚硫酸氢盐克隆测序或者质谱法相比,更加简单、快速、经济,有望成为一种高效、经济的替代工具,用于年龄评估或其他需要快速量化甲基化模式的应用中。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于基因检测,具体涉及一种基于多重snapshot技术检测dna甲基化的方法及应用。


技术介绍

1、目前文献和专利中对于年龄的评估常采用的方法是焦磷酸盐测序检测甲基化。焦磷酸测序技术(pyrosequencing)作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测。公告号为cn104357561b的中国专利技术专利披露了《一种获得中国人群女性个体年龄的方法和系统》,其通过提取女性个体的dna,获得11个cpg位点的甲基化率,并对11个cpg位点与年龄进行回归分析,构建回归模型,为推断中国人群女性个体年龄提供模型。公布号为cn109593862a的中国专利技术专利披露了《一种获得中国人群男性个体年龄的方法和系统》,其通过提取男性个体的dna,获得9个cpg位点的甲基化率,并对9个cpg位点与年龄进行回归分析,构建回归模型,为推断中国人群男性个体年龄提供模型。公告号为cn110257494b的中国专利技术专利披露了《一种获得中国人群个体年龄的方法、系统及扩增检测体系》,其通过提取个体的dna,针对不同群体选择本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于多重SNaPshot技术检测DNA甲基化的方法,其特征在于,首先提取个体DNA,根据亚硫酸氢盐-PCR的原理,将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,然后利用针对目的基因设计的PCR引物进行PCR扩增,将PCR扩增产物纯化后进行多重SNaPshot测序,获得CpG靶位点的甲基化率。

2.根据权利要求1所述一种基于多重SNaPshot技术检测DNA甲基化的方法,其特征在于,CpG靶位点的甲基化率的获得方法,具体步骤包括:

3.如权利要求1所述一种基于多重SNaPshot技术检测DNA甲基化的方法的应用,其特征在于,用于年龄评估。...

【技术特征摘要】

1.一种基于多重snapshot技术检测dna甲基化的方法,其特征在于,首先提取个体dna,根据亚硫酸氢盐-pcr的原理,将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,然后利用针对目的基因设计的pcr引物进行pcr扩增,将pcr扩增产物纯化后进行多重snapshot测序,获得cpg靶位点的甲基化率。

2.根据权利要求1所述一种基于多重snapshot技术检测dna甲基化的方法,其特征在于,cpg靶位点的甲基化率的获得方法,具体步骤包括:

3.如权利要求1所述一种基于多重snapshot技术检测dna甲基化的方法的应用,其特征在于,用于年龄评估。

4.一种基于多重snapshot技术检测dna甲基化的年龄评估方法,其特征在于,首先提取个体dna,根据亚硫酸氢盐-pcr的原理,将未甲基化的胞嘧啶转化为胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,然后利用针对目的基因设计的pcr引物进行pcr扩增,将pcr扩增产物纯化后进行多重snapshot测序,获得cpg靶位点的甲基化率,然后对cpg位点的甲基化率与个体年龄进行多元线性回归分析,分别建立了训练集和测试集,通过训练集建立回归分析模型,然后用测试集对回归模型进行...

【专利技术属性】
技术研发人员:闫海婷赵钟毓任文静王洋
申请(专利权)人:杭州瑞普基因科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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