【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物遗传学领域，具体涉及分子育种，尤其涉及与不结球白菜叶片紫色基因相关的分子标记及其应用。
技术介绍
1、不结球白菜(brassica campestris ssp.chinensis)是重要的十字花科叶菜类蔬菜作物，因其种质资源丰富、生长周期短、单位面积产量高、易栽培等特点，在我国大部分地区均可以周年栽培种植，占据蔬菜市场重要份额。作为不结球白菜的主要品种类型，紫色不结球白菜富含花青素，兼具观赏和食用保健功能，在设施栽培中运用越来越广泛。花青素是目前已知最强的自由基清除剂，清除自由基的能力是维生素c的20倍，维生素e的50倍。另外，花青素也可作为天然食用色素。因此，培育和推广紫色白菜具有十分重要的实用意义。
2、然而在紫色不结球白菜的杂交选育工作过程中，由于紫色为显性，绿色为隐形，杂合的植株呈现出紫色，这就导致单纯从颜色上很难分辨出紫色纯合与紫色杂合植株。例如：孙日飞等(2006)采用大白菜和紫红色芥菜种间杂交，获得了紫色白菜新种质，但是研究表明，大白菜紫红色性状遗传不符合孟德尔遗传规律。在群体分离选种时入选的杂合的植株，在子代将继续发生颜色的分离，导致育种年限拉长和选择效率降低。本申请在基因定位区间内开发的标记能高效鉴定杂交后代群体中紫色纯合和紫色杂合子代，成功运用于紫色不结球白菜分子辅助选择，缩短育种年限，提高了选择效率，为紫色不结球白菜乃至芸薹属紫色蔬菜的品种快速改良，提供了理论和数据支撑。目前关于大白菜紫色性状控制基因及遗传规律尚没有清晰的认识。
3、五引物扩增阻遏突变系统parm
4、相较于在继代选育过程中通过育种人员的主观判断选择，采用先留后选的原则这一选育方法，随着分子生物学技术的发展，分子标记辅助选择方法(marker assistedselection，mas)被越来越多地应用于育种环节，也因此，探究不结球白菜叶片颜色的分子标记所获得的结果成为白菜的分子育种筛选过程中重要的依据。
5、公开号为cn116004901a的中国专利申请公开了一种与普通白菜叶片紫色相关的kasp分子标记及其应用，通过qtl-seq技术以及遗传图谱定位发现了位于普通白菜3号染色体上与叶片紫色相关的主效qtl位点，开发了与位点紧密连锁的分子标记，通过对颜色未知普通白菜材料的种子或者苗期叶片提取dna，结合本专利技术的kasp引物进行kasp分子标记分型试验，通过标记的分型结果就可以预测普通白菜的颜色。
6、根据现有的研究可知，白菜类作物紫色基因广泛分布在a02、a03、a07以及a09号染色体上。由于这类基因之间存在复杂的基因连锁机制，且在芸薹属蔬菜中的变种、亚种乃至不同材料间遗传机制也存在差别，属于芸薹属蔬菜的白菜类作物的紫色显色调控机制(或者说白菜类作物中花青素合成和调控的机制)复杂多样。目前，对于白菜类作物的紫色显色调控机制的相关报道较少，使得与表征显色调控机制的分子标记无法快速应用于育种环节中。
7、此外，一方面由于对本领域技术人员的理解存在差异；另一方面由于申请人做出本专利技术时研究了大量文献和专利，但篇幅所限并未详细罗列所有的细节与内容，然而这绝非本专利技术不具备这些现有技术的特征，相反本专利技术已经具备现有技术的所有特征，而且申请人保留在
技术介绍
中增加相关现有技术之权利。
技术实现思路
1、为了改善紫色不结球白菜在选种时的技术不足(白菜叶片颜色的选育)，本专利技术提出一种能高效鉴定不结球白菜紫色叶片基因型的分子标记与应用。该分子标记及分子标记扩增引物可以高效鉴定杂交后代群体中紫色纯合和紫色杂合子代，加速紫色不结球白菜的育种年限，提高选择效率，为芸薹属紫色蔬菜的品种快速改良提供理论和数据支撑。
2、为了实现上述目的，本专利技术所采用的技术方案是：
3、本申请第一方面涉及一种与白菜叶片紫色基因相关的分子标记。分子标记包含：位于3号染色体的31209409处，多态性为a或g；位于3号染色体的31304070处，多态性为g或a；位于3号染色体的31409624处，多态性为t或c；位于3号染色体的31521617处，多态性为t或a；位于3号染色体的31632032处，多态性为t或c。具体地，本申请涉及的分子标记为一种能高效鉴定不结球白菜杂交后代群体中紫色纯合和紫色杂合子代的snp位点。
4、本申请第二方面涉及与白菜叶片紫色基因相关的分子标记在如下(1)或(2)中的应用：
5、(1)培育或者辅助培育叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜叶片品种；
6、(2)鉴定或筛选叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜叶片品种。
7、本申请第三方面涉及一种培育或者辅助培育叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜的方法。该方法包含以下步骤：
8、检测待测白菜位于白菜3号染色体的31209409处的snp位点的基因型，并进行如下判断：
9、待测白菜基因组中snp位点的基因型为gg纯合型，则所述待测白菜的叶片为紫色；
10、待测白菜基因组中snp位点的基因型为aa纯合型，则所述待测白菜的叶片为绿色；
11、待测白菜基因组中snp位点的基因型为ag杂合型，则所述待测白菜的叶片为浅紫色，或检测待测白菜位于白菜3号染色体的31304070处的snp位点的基因型，并进行如下判断：
12、待测白菜基因组中snp位点的基因型为aa纯合型，则所述待测白菜的叶片为紫色；
13、待测白菜基因组中snp位点的基因型为gg纯合型，则所述待测白菜的叶片为绿色；
14、待测白菜基因组中snp位点的基因型为ga杂合型，则所述待测白菜的叶片为浅紫色，或检测待测白菜位于白菜3号染色体的31409624处的snp位点的基因型，并进行如下判断：
15、待测白菜基因组中snp位点的基因型为cc纯合型，则所述待测白菜的叶片为紫色；
16、待测白菜基因组中snp位点的基因型为tt纯合型，则所述待测白菜的叶片为绿色；
17、待测白菜基因组中snp位点的基因型为tc杂合型，则所述待测白菜的叶片为浅紫色，或检测待测白菜位于白菜3号染色体的31521617处的snp位点的基因型，并进行如下判断：
18、待测白菜基因组中snp位点的基本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与白菜叶片紫色基因相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记包含：
2.如权利要求1所述与白菜叶片紫色基因相关的分子标记在如下(1)或(2)中的应用：
3.一种用于鉴定白菜叶片颜色的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含检测权利要求1所示的分子标记的试剂。
4.一种培育或者辅助培育叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜的方法，其特征在于，检测待测白菜位于白菜3号染色体的31209409处的SNP位点的基因型，并进行如下判断：
5.一种鉴定或筛选叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜的方法，其特征在于，检测待测白菜位于白菜3号染色体的31209409处的SNP位点的基因型，并进行如下判断：
6.一种检测白菜叶片颜色的引物，其特征在于，所述引物组合包括以下(1)、(2)、(3)、(4)、(5)中的一组或多组：
7.根据权利要求6所述的检测白菜叶片颜色的引物，其特征在于，所述引物的5′端连接有荧光分子FAM或HEX。
8.包含权利要求6或7所述检测白菜叶片颜色的引物的物质在如下(1)或(2)中的应用：
...【技术特征摘要】
1.一种与白菜叶片紫色基因相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记包含：
2.如权利要求1所述与白菜叶片紫色基因相关的分子标记在如下(1)或(2)中的应用：
3.一种用于鉴定白菜叶片颜色的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包含检测权利要求1所示的分子标记的试剂。
4.一种培育或者辅助培育叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜的方法，其特征在于，检测待测白菜位于白菜3号染色体的31209409处的snp位点的基因型，并进行如下判断：
5.一种鉴定或筛选叶片颜色为紫色、浅紫色或绿色的白菜的方法，其特征在于，检测待测白菜位于白菜3号染色体的31209409处的...
【专利技术属性】
技术研发人员：宋波，黄涛，张丽，杨晓，李跃建，朱同生，徐海，陈龙正，袁希汉，
申请(专利权)人：中国农业科学院都市农业研究所，
类型：发明
国别省市：
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