一种乳腺癌诊断模型及诊断或预后评估乳腺癌的方法技术

技术编号：40937179 阅读：2 留言：0更新日期：2024-04-18 14:56

本发明专利技术提供了一种乳腺癌诊断模型，由hsa‑miR‑16‑5p、hsa‑miR‑19b‑3p、hsa‑miR‑106a‑5p的组合组成，其中，hsa‑miR‑16‑5p的基因序列如SEQ ID NO.1所示；hsa‑miR‑19b‑3p的基因序列如SEQ ID NO.2所示；hsa‑miR‑106a‑5p的基因序列如SEQ ID NO.3所示；所述的模型公式为：Y＝EXP(‑8.382‑1682.454*miR‑106a‑5p+579.027*miR‑16‑5p+2826.828*miR‑19b‑3p)/(1+EXP(‑8.382‑1682.454*miR‑106a‑5p+579.027*miR‑16‑5p+2826.828*miR‑19b‑3p))；其中，hsa‑miR‑16‑5p、hsa‑miR‑19b‑3p、hsa‑miR‑106a‑5p表示hsa‑miR‑16‑5p、hsa‑miR‑19b‑3p、hsa‑miR‑106a‑5p的表达量，Y<0.5判断为非乳腺癌，Y>0.5判断为乳腺癌。

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【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物医药领域，涉及一种生物标记物的诊断模型，具体来说是一种乳腺癌诊断模型及诊断或预后评估乳腺癌的方法。

技术介绍

1、《2020年全球癌症负担报告》显示乳腺癌已取代肺癌成为全球第一大癌，占全球每年新发病例的近12％。2020年，约有230万女性乳腺癌新增病例，即每8例确诊的癌症中就有1例是乳腺癌，这也是乳腺癌首次成为全球最常见的癌症。本世纪全球乳腺癌发病率的快速增长严重威胁女性健康。生物标志物是一类与疾病发生、发展等有关的生化指标，能反映机体病理进程及治疗手段的安全性和有效性，在疾病早期诊断及预防、治疗靶点确定及预后等方面发挥重要作用。寻找和发现有价值的生物标志物是乳腺癌转化医学研究的一个要点和难点。

2、mirna是一类长度约在20-22碱基的具有调控功能的非编码rna，主要参与基因转录后水平的调控。mirna具有成为肿瘤等疾病生物标志物的潜力，原因在于：1)mirna具有组织特异性和阶段特异性，在不同组织、不同发育阶段有特异性表达谱，具备理想的疾病标志物特征。2)与其他rna相比，mirna在新鲜或福尔马林固定组织和体液中具有较高的化学稳定性，增加了其作为生物标记物的潜力。3)mirna可由健康细胞或疾病细胞释放并进入体液(如血液、尿液或痰液等)，成熟的mirna在体液中非常稳定，并且在不同疾病、疾病不同进程中具有极高的特异性。以上均增加了其作为非侵入性生物标记物的可行性。4)mirna具有高度的进化保守性，提高了其由动物实验水平转化到临床应用阶段的成功率。5)mirna检测手段无创、检测成本低，在

3、mirna与疾病(如癌症等)的发生、发展密切相关。研究发现，大约50％已注解的mirnas在基因组上定位于与肿瘤相关的脆性位点(fragi le site)，提示mirnas在肿瘤发生发展过程中起至关重要的作用。这些mirnas所起的作用类似于癌基因和抑癌基因的功能，称之为oncogenic mirna(oncomir)。oncomir的失调与基因突变或表观变异有关，其表达情况与人类多种恶性肿瘤的发生、发展、诊断及预后密切相关。todd r golub团队对恶性结肠癌、肝癌、胰腺癌和胃癌等肿瘤进行mirna表达谱分析，成功将低分化肿瘤进行了分类。bottoni等通过mirna表达差异成功区分垂体微腺瘤和垂体巨腺瘤。血清mirna-381的低表达与胃癌淋巴转移呈正相关，在胃癌早期诊断中的敏感性和特异性均优于其他肿瘤标志物。mir-17-92基因簇在b细胞淋巴瘤、滤泡型淋巴瘤、套细胞淋巴瘤等多种肿瘤中被确定为过度表达，是癌基因簇，其通过诱导细胞增殖抑制细胞凋亡促进肿瘤发生发展。mir-15a和mir-16-1基因位于染色体区域13q14脆性位点，在大多数慢性淋巴细胞白血病中13q14位点常有缺失。let-7是mirna最早发现成员之一，高度保守。let-7在肺癌、乳腺癌和宫颈癌等多种癌症中缺失。在肺癌、非小细胞肺癌病人中，let-7表达水平越低、其预后越差、术后生存期也越短。以上研究均揭示了mirna表达水平在肿瘤诊断中的重要作用，mirna可以作为诊断肿瘤的有效生物标志物。

4、利用多个疾病特征性mirna建立诊断或预后模型，可提高诊断或预后模型的准确性及特异性。satoshi nishiwada等利用4个公共数据和胰腺导管腺癌患者标本全基因组表达谱数据，确定了与淋巴结转移相关的mirna特征，并建立了由6个mirna(mir-155-5p,mir-196b-5p,mir-365a-5p,mir-629-5p,mir-675-3p,and mir-92b-3p)组成的诊断模型，利用该模型可以诊断胰腺导管腺癌转移到淋巴结的风险程度。rui sun等通过对诊断、缓解和复发不同阶段弥散性大b细胞淋巴瘤患者血清样本进行mirna表达谱分析，确定了4个与复发及预后相关mirna，并建立由以上4个mirna(mir21、mir130b、mir155和mir28)组成的预后模型，预后模型显著预测了弥漫大b细胞淋巴瘤的临床结果，准确率优于单个mirna。jianzhou等通过筛选、验证、模型建立、模型验证等过程，建立了由7个mirna(mir-122,mir-192,mir-21,mir-223,mir-26a,mir-27a和mir-801)组成的乙型肝炎病毒相关肝癌诊断模型，此模型不仅具有诊断乙型肝炎病毒相关肝癌的高准确性，在疾病分期和区分肝癌、健康、慢性乙型肝炎、肝硬化方面同样具有高准确率。三阴性乳腺癌(tnbc)是所有乳腺癌中复发率最高、生存时间最短的一种，迫切需要一种风险评估方法来确定准确的治疗过程。hsiao-chinhong等利用公共数据集对tnbc组织特征性mirna进行了筛选，并建立了由8个mirna(mir-138-5p、mir-10b-5p、mir-486-5p、mir-455-3p、mir-107、mir-146b-5p、mir-324-5p和mir-20a-5p)组成的tnbc复发预测模型，模型auc分别达0.80、0.89和0.90。

技术实现思路

1、针对现有技术中的上述技术问题，本专利技术提供了一种乳腺癌诊断模型及诊断或预后评估乳腺癌的方法，所述的这种乳腺癌诊断模型及诊断或预后评估乳腺癌的方法要解决现有技术中对于预警、诊断乳腺癌的效果不佳的技术问题。

2、本专利技术提供了外周血循环mirna在制备预防、诊断或预后评估乳腺癌的生物标记物中的用途，所述的外周血循环mirna的基因序列如下所示；

3、hsa-mir-16-5p,hsa-mir-19b-3p,hsa-mir-106a-5p在mirbase数据库(http://www.mirbase.org/)的登录号及具体序列如下：

4、 name sequence(5’-3’) assession hsa-mir-16-5p tagcagcacgtaaatattggcg mimat0000069 seq id no.1 hsa-mir-19b-3p tgtgcaaatccatgcaaaactga 本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种乳腺癌诊断模型，其特征在于，由hsa-miR-16-5p、hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-106a-5p的组合组成，其中，

2.外周血循环miRNA组合在建立乳腺癌诊断模型中的应用，其特征在于，所述外周血循环miRNA组合由hsa-miR-16-5p、hsa-miR-19b-3p、hsa-miR-106a-5p的组合组成，其中，

3.一种诊断或预后评估乳腺癌的方法，其特征在于，包括根据以下模型公式计算Y；

【技术特征摘要】

1.一种乳腺癌诊断模型，其特征在于，由hsa-mir-16-5p、hsa-mir-19b-3p、hsa-mir-106a-5p的组合组成，其中，

2.外周血循环mirna组合在建立乳腺癌诊断模型中的应用，其特征在于，...

【专利技术属性】
技术研发人员：俞作仁，赵倩，吕金辉，钱璐，
申请(专利权)人：馥鼎上海生物医药有限公司，
类型：发明
国别省市：

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