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【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物,具体涉及一种纳米抗体、包含该纳米抗体的多肽及其应用。
技术介绍
1、腺相关病毒(adeno-associated virus,aav),属于微小病毒科依赖病毒属,具有二十面体结构,是目前发现的一类结构最简单的单链dna缺陷型病毒,需要辅助病毒(通常为腺病毒)参与复制。该病毒颗粒的直径在20~26nm之间,含有大小在4.7~6kb之间的线状单链dna基因组。aav对人类不致病,研究表明,约80%人群aav血清检测阳性。
2、重组腺相关病毒(recombinant adeno-associated virus,raav)源于非致病的野生型腺相关病毒,由于其安全性好、宿主细胞范围广(分裂和非分裂细胞)、免疫源性低,在体内表达外源基因时间长等特点,被视为最有前途的基因转移载体之一,在世界范围内的基因治疗和疫苗研究中得到广泛应用。包括体内、体外实验的基因功能研究、构建疾病模型、基因敲除、基因治疗和疫苗研究等方面。
3、由于raav的上游生产是在细胞中完成的,因此其裂解产物中有核酸、培养基残留杂质、宿主细胞蛋白质等杂质,残留的dna可以用核酸酶处理,但hcp的去除是一个复杂的过程,通常多个步骤,而这些步骤可能降低收率,延迟工艺开发,给下游纯化工艺带来极大的挑战。尤其是aav有多种不同的血清型(aav1-aav10),其具有不同的衣壳蛋白空间结构、序列和组织特异性,对不同组织和细胞具有不同的感染效率,识别与结合不同的细胞表面受体,因此,通用型的亲和层析方案很难实现。
4、传统的下游工艺需
5、为了解决这一挑战,最新的亲和层析法减少了纯化aav所需的步骤数,提高了收率并缩短了工艺时间。例如,肝素-亲和层析柱可用于纯化raav3和raav6;粘蛋白-亲和层析柱可用于纯化raav1、raav4、raav5和rvva6;抗体-亲和柱用于检测和纯化raav,如识别和结合aavxl32.1的单克隆抗体(专利文献1)、特异识别aav9衣壳蛋白的多克隆抗体(专利文献2)等。
6、然而,传统抗体制备成本高昂,抗体尺寸较大导致在载体上偶联量低等缺陷限制了其工业化应用。驼源纳米抗体具有高度特异性和稳定性,基于纳米抗体的avbsepharosetm(ge healthcaretm)填料和porostmcaptureselect aavx(thermo scientifictm)填料(非专利文献1)在柱层析过程中表现良好,使aav亲和层析柱的工业化应用成为可能。但不同筛选方式筛选出的不同序列的纳米抗体,其亲和力、稳定性、结合谱都有很大差异。
7、专利文献1:cn113583112b
8、专利文献2:cn114685651a
9、非专利文献1:orjanaterova,et.al,overcoming downstream purificationchallenges for viral vector manufacturing:enabling advancement of genetherapies in the clinic,cell gene therapy insights 2018;4(2),101-111.
技术实现思路
1、本专利技术的目的是提供具有特定结构的氨基酸序列的纳米抗体、包含该纳米抗体的多肽及其应用,以解决现有aav富集、纯化、检测等方面面临的抗体制备工艺复杂、成本高,以及抗体亲和力、稳定性、结合谱差的问题。
2、为达到以上技术目的,本申请采用的技术方案如下:
3、第一方面,本专利技术提供一种纳米抗体,所述纳米抗体氨基酸序列中的可变区包括互补决定区cdr和框架区fr,所述互补决定区cdr包括互补决定区cdr1、互补决定区cdr2和互补决定区cdr3,其中,
4、所述互补决定区cdr1为包括下述式(i):
5、ser-gly-xaa11-xaa12-phe-xaa13-xaa14-asn-xaa15, (i);
6、所述互补决定区cdr2为包括下述式(ii):
7、xaa21-thr-xaa22-xaa23-gly-xaa24-thr, (ii);
8、所述互补决定区cdr3为包括下述式(iii):
9、his-val-asp-glu-val-arg-xaa31-ser-ser-trp-thr-thr-ser-asn-leu, (iii);
10、其中,
11、xaa11独立地选自arg、ser、thr;和/或,
12、xaa12独立地选自ala、gly、his、ile、met、asn、arg、ser、thr;和/或,
13、xaa13独立地选自ile、arg、ser、thr、val;和/或,
14、xaa14独立地选自ala、ile、leu;和/或,
15、xaa15独立地选自ala、ile、leu、ser、thr、val;和/或,
16、xaa21独立地选自phe、ile、leu、val;和/或,
17、xaa22独立地选自pro、arg、ser;和/或,
18、xaa23独立地选自ala、asp、gly;和/或,
19、xaa24独立地选自asp、gly、asn、ser、thr、val;和/或,
20、xaa31独立地选自asp、glu、gln。
21、优选地,所述互补决定区cdr1中,
22、所述xaa11为arg,xaa12为ser,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为thr;或,
23、所述xaa11为ser,xaa12为arg,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为thr;或,
24、所述xaa11为arg,xaa12为his,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为thr;或,
25、所述xaa11为arg,xaa12为ala,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为thr;或,
26、所述xaa11为ser,xaa12为ile,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为ser;或,
27、所述xaa11为ser,xaa12为arg,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为ser;或,
28、所述xaa11为ser,xaa12为ile,xaa13为ser,xaa14为ile,xaa15为leu;或,
29、所述xaa11为ser,xaa12为thr,xaa13为ser,x本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种纳米抗体,其特征在于,所述纳米抗体氨基酸序列中的可变区包括互补决定区CDR和框架区FR,所述互补决定区CDR包括互补决定区CDR1、互补决定区CDR2和互补决定区CDR3,其中,
2.根据权利要求1所述的纳米抗体,其特征在于,所述互补决定区CDR1中,
3.根据权利要求1或2所述的纳米抗体,其特征在于,所述互补决定区CDR2中,
4.根据权利要求1所述的纳米抗体,其特征在于,所述框架区FR包括:框架区FR1、框架区FR2、框架区FR3和框架区FR4,框架区FR1、框架区FR2、框架区FR3和框架区FR4为同源性50%以上的氨基酸序列,优选为同源性70%以上的氨基酸序列,进一步优选为同源性95%以上的氨基酸序列;
5.根据权利要求1~4任一项所述的纳米抗体,其特征在于,所述纳米抗体的氨基酸序列包括:SEQ ID No:10、SEQ ID No:11、SEQ ID No:12、SEQ ID No:13、SEQ ID No:14、SEQID No:15、SEQ ID No:16、SEQ ID No:17、SEQ ID No:20、
6.根据权利要求1~5所述的纳米抗体,其特征在于,所述纳米抗体是人源化纳米抗体,优选地,所述人源化纳米抗体包括SEQ ID No:117、SEQ ID No:118、SEQ ID No:119、SEQ IDNo:120。
7.一种多肽,其特征在于,是通过在权利要求1~6任一项所述的纳米抗体N-端和/或C-端氨基酸改造获得。
8.根据权利要求7所述的一种多肽,其特征在于,所述纳米抗体N-端和/或C-端氨基酸改造的方式包括:
9.一种多肽,其特征在于,是通过权利要求1~6任一项所述的纳米抗体经多价合成获得。
10.根据权利要求9所述的一种多肽,其特征在于,所述多价合成包括二价、三价或四价合成;
11.一种核酸,其特征在于,所述核酸编码权利要求1~6任一项所述的纳米抗体或权利要求7~10任一项所述的多肽。
12.一种表达载体,其特征在于,包含权利要求11所述的核酸的表达框。
13.一种宿主细胞,其特征在于,含有权利要求12所述的表达载体,其不为植物或植物细胞。
14.权利要求1~6任一项所述的纳米抗体和/或权利要求7~10任一项所述的多肽在免疫检测、富集和或纯化上的应用,所述免疫检测不直接应用于疾病的诊断或治疗。
15.根据权利要求14所述的应用,其特征在于,所述纳米抗体和/或所述多肽在制备病毒吸附剂、病毒纯化试剂盒、病毒检测试剂盒上的应用;优选地,所述病毒为AAV。
16.一种病毒吸附剂,其特征在于,包括载体基质和权利要求1~6任一项所述的纳米抗体和/或权利要求7~10任一项所述的多肽。
17.一种病毒纯化试剂盒,其特征在于,包括载体基质和权利要求1~6任一项所述的纳米抗体和/或权利要求7~10任一项所述的多肽。
18.一种病毒检测试剂盒,其特征在于,包括载体基质和权利要求1~6任一项所述的纳米抗体和/或权利要求7~10任一项所述的多肽。
19.一种基于非诊断目的的AAV检测方法,其特征在于,将权利要求1~6任一项所述的纳米抗体和/或权利要求7~10任一项所述的多肽通过HRP偶联,然后采用直接酶免疫吸附测定法或者夹心酶免疫吸附测定法检测。
...【技术特征摘要】
1.一种纳米抗体,其特征在于,所述纳米抗体氨基酸序列中的可变区包括互补决定区cdr和框架区fr,所述互补决定区cdr包括互补决定区cdr1、互补决定区cdr2和互补决定区cdr3,其中,
2.根据权利要求1所述的纳米抗体,其特征在于,所述互补决定区cdr1中,
3.根据权利要求1或2所述的纳米抗体,其特征在于,所述互补决定区cdr2中,
4.根据权利要求1所述的纳米抗体,其特征在于,所述框架区fr包括:框架区fr1、框架区fr2、框架区fr3和框架区fr4,框架区fr1、框架区fr2、框架区fr3和框架区fr4为同源性50%以上的氨基酸序列,优选为同源性70%以上的氨基酸序列,进一步优选为同源性95%以上的氨基酸序列;
5.根据权利要求1~4任一项所述的纳米抗体,其特征在于,所述纳米抗体的氨基酸序列包括:seq id no:10、seq id no:11、seq id no:12、seq id no:13、seq id no:14、seqid no:15、seq id no:16、seq id no:17、seq id no:20、seq id no:24、seq id no:25、seqid no:26、seq id no:27、seq id no:32、seq id no:33、seq idno:34、seq id no:35、seqid no:36、seq id no:42、seq id no:43、seq id no:44、seq id no:45、seq id no:46、seqid no:47、seq id no:48、seq id no:49、seq idno:50、seq id no:51、seq id no:52、seqid no:53、seq id no:54、seq id no:55、seq id no:56、seq id no:57、seq id no:65、seqid no:66、seq id no:67、seq idno:68、seq id no:78、seq id no:89、seq id no:104。
6.根据权利要求1~5所述的纳米抗体,其特征在于...
【专利技术属性】
技术研发人员:王雨萌,黄春东,李妲,陈复,
申请(专利权)人:康元医疗科技大连有限公司,
类型:发明
国别省市:
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