肺癌MRD检测用捕获探针池和试剂盒制造技术

本发明专利技术提供了一种肺癌MRD检测用捕获探针池和检测试剂盒。所述捕获探针池中包含针对16个肺癌相关基因设计的呈交错分布的正链和负链捕获探针，能够覆盖全部目标基因序列，不仅可有效避免因探针间的相互杂交导致的探针利用率低、捕获效率低、背景噪音高等问题，而且可同时捕获文库中目标基因的正、负链两条链，提高了文库丰度，提高了杂交捕获效率。本发明专利技术还提供了包括上述肺癌MRD检测用捕获探针池和杂交液的肺癌MRD检测试剂盒，其具有良好的检测灵敏度和特异性，且背景低、杂交捕获时间短，可有效检出16个肺癌相关基因的各种变异类型，能够很好地实现肺癌MRD检测。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物，涉及分子生物学检测，具体是涉及一种肺癌mrd检测用捕获探针池和试剂盒。

技术介绍

1、微小残留病灶(minimal residual disease,mrd)又称为可测量残留病灶(measurable residual disease)、分子残留病灶(molecular residual disease)，指癌症患者治疗后传统影像学或实验方法检测不到的但通过液体活检可检出极少量癌细胞残存或癌细胞来源分子异常(wang y et al.,biomedical transformation,2021,2:49-59)。mrd中包括微小复发性残留灶(m-rec)、微小非复发性残留灶(mn-rec)、微小残留灶前体(mrps)、微小残留核酸(mrnas)和微小残留代谢物(mrms)(luskin mr et al.,nat revcancer,2018,18:255-263)。除了mn-rec，m-rec和mrps都是肿瘤发展隐匿阶段mrd引发远期复发的可能之一，mrnas和mrms也可能与肿瘤的复发相关。因此，mrd被认为是癌症复发/转移的主本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种肺癌MRD检测用捕获探针池，其特征在于，所述捕获探针池由针对至少一种目标基因的正链捕获探针和负链捕获探针组成，每种目标基因的捕获探针根据目标基因的正链和负链核苷酸序列依次设计、呈交错排列，能够覆盖目标基因的全部序列；所述正链捕获探针和负链捕获探针中，相邻的两个捕获探针，一个为正链捕获探针，另一个则为负链捕获探针，且所针对的目标基因序列没有重叠，所述捕获探针池中的每条捕获探针长度为80～130bp；所述目标基因选自以下16种中的至少一种：ALK、BRAF、EGFR、HER2、KRAS、MET、NRAS、MEK1、PIK3CA、RET、ROS1、TP53、NTRK1、NTRK2、NT...

【技术特征摘要】

1.一种肺癌mrd检测用捕获探针池，其特征在于，所述捕获探针池由针对至少一种目标基因的正链捕获探针和负链捕获探针组成，每种目标基因的捕获探针根据目标基因的正链和负链核苷酸序列依次设计、呈交错排列，能够覆盖目标基因的全部序列；所述正链捕获探针和负链捕获探针中，相邻的两个捕获探针，一个为正链捕获探针，另一个则为负链捕获探针，且所针对的目标基因序列没有重叠，所述捕获探针池中的每条捕获探针长度为80～130bp；所述目标基因选自以下16种中的至少一种：alk、braf、egfr、her2、kras、met、nras、mek1、pik3ca、ret、ros1、tp53、ntrk1、ntrk2、ntrk3和pd-l1。

2.根据权利要求1所述肺癌mrd检测用捕获探针池，其特征在于，所述捕获探针长度为100～110bp；和/或所述捕获探针池中捕获探针的5’端经过标记物修饰；优选地，所述标记物修饰为生物素标记。

3.根据权利要求1所述肺癌mrd检测用捕获探针池，其特征在于，所述目标基因的正链捕获探针和负链捕获探针选自以下至少一组：

4.根据权利要求3所述肺癌mrd检测用捕获探针池，其特征在于，所述捕获探针池包括如下16种基因alk、braf、egfr、her2、kras、met、nras、mek1、pik3ca、ret、ros1、tp53、ntrk1、ntrk2、ntrk3和pd-l1的捕获探针。

5.一种肺癌mrd检测试剂盒，其特征在于，所述肺癌mrd检测试剂盒包括权利要求1-4任一项所述肺癌mrd检测用捕获探针池。

6.根据权利要求5所述的肺癌mrd检测试剂盒，其特征在于，还包括有杂交...

【专利技术属性】
技术研发人员：许嘉森，吴征征，廖丁妹，周锦清，
申请(专利权)人：广州益善医学检验所有限公司，
类型：发明
国别省市：