【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医药领域，涉及基于rna修饰的rmr score模型及在前列腺癌中的应用。
技术介绍
1、最近的研究显示前列腺癌(prostate cancer，pca)已成为男性第2大常见恶性肿瘤，其对男性健康产生了严重威胁。在局限性前列腺癌阶段，临床上常通过根治性前列腺癌切除术或放射疗法进行治疗。而在pca的复发或晚期阶段常用雄激素剥夺疗法、内分泌治疗和免疫治疗等。但由于前列腺癌的异质性，目前在治疗后的监测、个性化药物选择等方仍面临着诸多挑战，当前的临床指标等难以满足现代医学中个体化治疗的需要，这往往容易导致治疗不足或过度治疗。因此，需要对前列腺癌异质性进行更深入的研究。
2、肿瘤异质性是发生展过程中的关键特征。肿瘤的异质性不仅建立在慢性或偶发性基因组不稳定性和由此产生的肿瘤细胞遗传异质性的基础上，而且还与非突变表观遗传异质性有关。非突变表观遗传异质性主要包括dna甲基化、组蛋白修饰、rna修饰、染色质重塑等，其中rna修饰是目前研究较为广泛的领域之一，然而rna修饰在前列腺癌中所发挥的角色和功能仍有待深入挖掘。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于解决现有技术中所存在的前列腺癌难以得到提前诊断、无法准确评估个体间临床疗效差异与预后的技术问题，从而提供了一种基于rna修饰的rmr score模型用于对前列腺癌进行辅助诊断和预后评估。通过对前列腺癌患者体内特定rna修饰调节因子表达水平进行检测并分析，从而对患者生化复发风险以及预后等进行有效预测，可作为一种风险评估
2、为了解决上述技术问题，本专利技术是通过如下技术方案得以实现的。
3、本专利技术第一方面提供了一种基于rna修饰的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的rmr score模型，所述rmr score按照如下公式进行计算：
4、
5、其中n代表rna修饰调节因子的数量，coefi代表rna修饰调节因子在“coxridge”中的系数，expression level of rnai代表rna修饰调节因子的表达水平。
6、应理解的是，在没有特别说明的情况下，在本专利技术上下文中，rmr score、rmr-score、rmr scr、rmr-scr、rmr评分、rmr得分、rmcoes等表述，均为同一意思的表达，即为rnamodification regu lators’co-expression score的简化表述，理解为对患者罹患前列腺癌进行辅助诊断和/或对前列腺癌患者预后进行评估的方式，进而对前列腺癌患者罹患前列腺癌的风险、生化复发风险、生存率、预后等进行合理预测。本专利技术上下文中所述的“模型”即为临床预测模型，本领域技术人员能够理解所述的“模型”为一种产品。临床上通过使用参数/半参数/非参数数学模型来评估受试者当前患有某种疾病的概率或将来发生某种结局的可能性。通过该模型，可利用已知特征来计算未知结局发生的概率。临床预测模型一般采用各种回归分析方法建模，回归分析的统计本质是寻找一种定量因果关系，可用于对疾病进行诊断和/或预后评估，从而在诊断治疗决策、患者预后管理、公共卫生资源配置等方面发挥作用。
7、作为优选地，所述rna修饰调节因子选自rpusd3、wbscr22、tr mt61a、nsun5中的一种或多种；最优选地，所述rna修饰调节因子由rpusd3、wbscr22、trmt61a、nsun5组成。
8、作为优选地，所述预后评估的指标包括生化复发发生率、生化复发发生时间、五年生存率、rmr score中的一种或多种。
9、本专利技术第二方面提供了检测生物标志物表达水平的试剂在制备用于对前列腺癌进行辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用，所述标志物由rpusd3、wbscr22、trmt61a、nsun5组成。
10、作为优选地，所述检测标志物表达水平的试剂包括用于检测标志物基因表达水平的引物对和/或检测标志物基因编码的蛋白含量的试剂。
11、作为优选地，所述检测标志物表达水平的试剂包括用于检测标志物基因表达水平的引物对和/或检测标志物基因编码的蛋白含量的试剂选自rpusd3(sc-393209，santacruz)、wbscr22 antibody(a7317，abclonal)、trmt61a(nbp2-94200，novus)、nsun5antibody(sc-376147，santa cruz)中的一种或多种。
12、应理解的是，在没有特别说明的情况下，在本专利技术上下文中，所述引物和/或引物对是指用于在pcr中合成各标志物基因cdna链的pcr引物，从而用于检测各标志物基因的表达水平。除本专利技术所列出的引物和/或引物对外，本领域技术人员完全有能力根据各标志物的基因序列采用包括但不限于分子生物学等本领域的常规方法手段进行相应引物和/或引物对的设计，并通过常规实验手段对所设计的引物和/或引物对进行筛选，只要能够实现特异性检测各标志物表达水平即可。同时，对于所述用于检测各标志物基因编码的蛋白含量的抗体试剂，本领域技术人员可以通过市售获得，也可以根据各标志物基因序列和/或蛋白结构自行设计完成。
13、作为优选地，所述预后评估的指标包括生化复发发生率、生化复发发生时间、五年生存率、rmr score中的一种或多种。
14、作为优选地，所述试剂盒还包括pcr酶、pcr缓冲液、dntps、荧光底物中的一种或多种。
15、作为优选地，所述荧光底物选自syber green或荧光标记的探针。
16、本专利技术第三方面提供了一种用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的系统，包括：
17、输入单元，用于输入待评估患者的数据；
18、分析单元，用于对待评估患者的样本中的标志物表达水平进行检测，所述标志物由rpusd3、wbscr22、trmt61a、nsun5组成；
19、评估单元，用于对分析单元分析得到的数据按照如下公式进行计算，以获得患者的rmr score值，并根据rmr score值将患者分为rmr score高得分组或rmr score低得分组，最后对患者罹患前列腺癌的风险和/或预后作出评估：
20、
21、其中n代表rna修饰调节因子的数量，coefi代表rna修饰调节因子在“coxridge”中的系数，expression level of rnai代表rna修饰调节因子的表达水平。
22、作为优选地，输入单元中所述数据包括但不限于患者的血液样本数据、肿瘤组织样本数据、癌旁组织样本数据中的一种或多种。
23、作为优选地，所述评估单元中按照如下标准对患者罹患前列腺癌的风险和/或预后进行评估：
24、(a)本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种基于RNA修饰的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的RMR Score模型，其特征在于，所述RMR Score按照如下公式进行计算：
2.根据权利要求1所述的基于RNA修饰的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的RMRScore模型，其特征在于，所述RNA修饰调节因子选自RPUSD3、WBSCR22、TRMT61A、NSUN5中的一种或多种。
3.检测生物标志物表达水平的试剂在制备用于对前列腺癌进行辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用，其特征在于，所述标志物由RPUSD3、WBSCR22、TRMT61A、NSUN5组成。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述检测标志物表达水平的试剂包括用于检测标志物基因表达水平的引物对和/或检测标志物基因编码的蛋白含量的试剂。
5.抑制RNA修饰调节因子表达水平的抑制剂在制备治疗前列腺癌的药物中的应用，其特征在于，所述RNA修饰调节因子选自RPUSD 3、WBSCR22、TRMT61A、NSUN5中的一种或多种。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述抑制剂选自基
7.一种用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的系统，其特征在于，包括：
8.根据权利要求7所述的系统，其特征在于，输入单元中所述数据包括但不限于患者的血液样本数据、肿瘤组织样本数据、癌旁组织样本数据中的一种或多种。
9.根据权利要求7所述的系统，其特征在于，所述评估单元中按照如下标准对患者罹患前列腺癌的风险和/或预后进行评估：
10.一种计算机可读的存储介质，其特征在于，其中存储有处理器可执行的指令，所述处理器可执行的指令在处理器执行时执行根据权利要求7-9任一项所述的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的系统。
...【技术特征摘要】
1.一种基于rna修饰的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的rmr score模型，其特征在于，所述rmr score按照如下公式进行计算：
2.根据权利要求1所述的基于rna修饰的用于前列腺癌辅助诊断和/或预后评估的rmrscore模型，其特征在于，所述rna修饰调节因子选自rpusd3、wbscr22、trmt61a、nsun5中的一种或多种。
3.检测生物标志物表达水平的试剂在制备用于对前列腺癌进行辅助诊断和/或预后评估的产品中的应用，其特征在于，所述标志物由rpusd3、wbscr22、trmt61a、nsun5组成。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，所述检测标志物表达水平的试剂包括用于检测标志物基因表达水平的引物对和/或检测标志物基因编码的蛋白含量的试剂。
5.抑制rna修饰调节因子表达水平的抑制剂在制备治疗前列腺癌的药...
【专利技术属性】
技术研发人员：卢剑铭，杨静静，蔡周达，邓军洪，莫珊珊，
申请(专利权)人：广州市第一人民医院广州消化疾病中心，广州医科大学附属市一人民医院，华南理工大学附属第二医院，
类型：发明
国别省市：
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