【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于水产动物分子标记，具体涉及一种与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记及其应用。
技术介绍
1、翘嘴鳜（ siniperca chuatsi）隶属鲈形目（perciformes）、真鲈科（percichthyidae）、鳜属（ siniperca），因其肉味鲜美、营养丰富，而深受广大消费者的喜爱，属名贵淡水养殖鱼类。翘嘴鳜为凶猛的肉食性鱼类，生长速度是决定其在养殖过程中生产成本和经济效益的关键因素之一。生长性状的遗传选育已成为提高动物生长性状的重要手段。生长过程受自身遗传和外部环境等多种因素影响。
2、针对鳜鱼生长性状的选育目前仍采取传统的选育方法，然而翘嘴鳜从幼鱼到性成熟需要1-2年，采用传统选择育种技术需要10年以上才能取得显著遗传进展，耗时较长。近年来，通过结合分子标记辅助选择育种，将鱼类的表型特征作为选育目标的选育方法逐渐成为主流，在优良性状的遗传选育中得到广泛应用。
3、分子标记是指能反映生物个体或种群间基因组中某种差异的特异性dna片段。单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms , snp）是指基因组内特定核苷酸位置上存在两种不同的碱基。因其位点分布丰富，具有较高的信息含量，且snp位点信息获取简单快捷，现已成为重要的分子标记。通过将snp位点与重要性状进行关联分析，获取与性状紧密关联的分子标记用于选育，是现代水产动物分子育种技术的重要手段，在水产经济动物遗传育种中发挥
技术实现思路
1、本专利技术的第一个目的在于提供一种与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记。
2、本专利技术的目的还在于提供一种检测上述snp分子标记的引物、试剂盒以及利用所述引物或试剂盒选育具有优良生长性状的翘嘴鳜的方法。
3、本专利技术的最后一个目的在于提供检测上述snp分子标记的试剂、引物、试剂盒或方法在选育具有优良生长性状的翘嘴鳜中的应用。
4、本专利技术的上述第一个目的可以通过以下技术方案来实现：一种与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记，所述snp分子标记包括snp 20:31934096、snp 14:13719188和snp 12:17111862中的一个或多个，其中所述snp 20:31934096位于翘嘴鳜20号染色体的31934096位碱基处，其突变类型为a/g；所述snp 14:13719188位于翘嘴鳜14号染色体的13719188位碱基处，其突变类型为a/c；所述snp 12:17111862位于翘嘴鳜12号染色体的17111862位碱基处，其突变类型为a/c。
5、可选地，所述snp 20:31934096中，aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长性状优于ag和gg基因型；所述snp 14:13719188中，aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长性状优于ac和cc基因型；所述snp 12:17111862中，aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长性状优于ac和cc基因型。
6、可选地，所述生长性状包括体重、体长、全长、体高和体厚。
7、因此，本专利技术提供了一种与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记，所述snp分子标记包括snp 20:31934096、snp 14:13719188和snp 12:17111862中的一个或多个，其中snp20:31934096位于翘嘴鳜20号染色体的31934096位碱基处，突变类型为a/g，包括aa基因型、ag基因型和gg基因型，且aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长形状优于ag和gg基因型；snp 14:13719188位于翘嘴鳜14号染色体的13719188位碱基处，突变类型为a/c，包括aa基因型、ac基因型和cc基因型，且aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长形状优于ac和cc基因型；snp 12:17111862位于翘嘴鳜12号染色体的17111862位碱基处，突变类型为a/c，包括aa基因型、ac基因型和cc基因型，且aa基因型为优选基因型，该基因型个体生长形状优于ac和cc基因型，其中所述生长性状包括个体的体重、体长、全长、体高和体厚等。
8、本专利技术的上述第二个目的可以通过以下技术方案来实现：一种检测上述与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记的引物，所述引物包括用于检测snp 20:31934096的上游引物snp 20:31934096-f和下游引物snp 20:31934096-r、用于检测snp 14:13719188的上游引物snp 14:13719188-f和下游引物snp 14:13719188-r以及用于检测snp 12:17111862的上游引物snp 12:17111862-f和下游引物snp 12:17111862-r中的一对或几对，其中所述上游引物snp 20:31934096-f和所述下游引物snp 20:31934096-r的序列分别如seq id no：1所示和seq id no：2所示，所述上游引物snp 14:13719188-f和下游引物snp 14:13719188-r的序列分别如seq id no：3所示和seq id no：4所示，所述上游引物snp 12:17111862-f和下游引物snp 12:17111862-r的序列分别如seq id no：5所示和seq id no：6所示。
9、具体地：
10、所述snp 20:31934096的上游引物snp 20:31934096-f的序列如下：
11、5'-tcaaagcagcaagtagtca-3'（如seq id no：1所示）；
12、所述snp 20:31934096的下游引物snp 20:31934096-r的序列如下：
13、5'-cttgagataaatgtagggt-3'（如seq id no：2所示）；
14、所述snp 14:13719188的上游引物snp 14:13719188-f的序列如下：
15、5'-atcaatggcttgtccttc-3'（如seq id no：3所示）；
16、所述snp 14:13719188的下游引物snp 14:13719188-r的序列如下：
17、5'-tcaatgtgacacccaaca-3'（如seq id no：4所示）；
18、所述snp 12:17111862的上游引物snp 12:17111862-f的序列如下：
19、5' -tacaaacactcagggaggc-3'（seq id no：5所示）；
20、所述snp 12:17111862的下游引物snp 12:17111862-r的序列如下：<本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种与翘嘴鳜生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP分子标记包括SNP20:31934096、SNP 14:13719188和SNP 12:17111862中的一个或多个，其中所述SNP 20:31934096位于翘嘴鳜20号染色体的31934096位碱基处，其突变类型为A/G；所述SNP 14:13719188位于翘嘴鳜14号染色体的13719188位碱基处，其突变类型为A/C；所述SNP 12:17111862位于翘嘴鳜12号染色体的17111862位碱基处，其突变类型为A/C。
2.根据权利要求1所述与翘嘴鳜生长性状相关的SNP分子标记，其特征在于：所述SNP20:31934096中，AA基因型个体生长性状优于AG和GG基因型；所述SNP 14:13719188中，AA基因型个体生长性状优于AC和CC基因型；所述SNP 12:17111862中，AA基因型个体生长性状优于AC和CC基因型。
3.一种检测权利要求1所述与翘嘴鳜生长性状相关的SNP分子标记的引物，其特征在于：所述引物包括用于检测SNP 20:31934096的上游引物SN
4.一种检测与翘嘴鳜生长性状相关的SNP分子标记的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒包括权利要求3中所述的引物。
5.一种选育具有优良生长性状的翘嘴鳜的方法，其特征在于包括以下步骤：
6.根据权利要求5所述选育具有优良生长性状的翘嘴鳜的方法，其特征在于：步骤（3）中所述分子标记为SNP 20:31934096时，AA基因型的个体生长性状优于AG和GG基因型；所述分子标记为SNP 14:13719188时，AA基因型的个体生长性状优于AC和CC基因型；所述分子标记为SNP 12:17111862时，AA基因型的个体生长性状优于AC和CC基因型。
7.检测权利要求1或2所述SNP分子标记的试剂在选育具有优良生长性状的翘嘴鳜中的应用。
8.权利要求3所述引物、权利要求4所述试剂盒、权利要求5或权利要求6中所述的方法在选育具有优良生长性状的翘嘴鳜中的应用。
...【技术特征摘要】
1.一种与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记，其特征在于：所述snp分子标记包括snp20:31934096、snp 14:13719188和snp 12:17111862中的一个或多个，其中所述snp 20:31934096位于翘嘴鳜20号染色体的31934096位碱基处，其突变类型为a/g；所述snp 14:13719188位于翘嘴鳜14号染色体的13719188位碱基处，其突变类型为a/c；所述snp 12:17111862位于翘嘴鳜12号染色体的17111862位碱基处，其突变类型为a/c。
2.根据权利要求1所述与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记，其特征在于：所述snp20:31934096中，aa基因型个体生长性状优于ag和gg基因型；所述snp 14:13719188中，aa基因型个体生长性状优于ac和cc基因型；所述snp 12:17111862中，aa基因型个体生长性状优于ac和cc基因型。
3.一种检测权利要求1所述与翘嘴鳜生长性状相关的snp分子标记的引物，其特征在于：所述引物包括用于检测snp 20:31934096的上游引物snp 20:31934096-f和下游引物snp 20:31934096-r、用于检测snp 14:13719188的上游引物snp 14:13719188-f和下游引物snp 14:13719188-r以及用于检测snp 12:17111862的上游引物snp 12:17111862-f和下游引物snp 12:1711186...
【专利技术属性】
技术研发人员：张晋，宋亚康，廖书嘉，刘鼎瑞，侯景芃，曾俊彦，林浩然，张勇，
申请(专利权)人：中山大学，
类型：发明
国别省市：
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