【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于植物病理学、基因组学、分子生物学、分子遗传学和水稻抗病育种，具体涉及用于水稻抗稻瘟病基因的功能标记检测，尤其涉及一种鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法。
技术介绍
1、目前，水稻是世界上非常重要的粮食作物之一。由稻瘟菌(magnap rthe grisea)引发的水稻稻瘟病是迄今为止世界上最具有杀伤力的水稻病害，全世界因水稻稻瘟病造成的水稻每年平均减少产量约10～30％，严重时达40～50％，更甚的是颗粒无收。到今天为止，这种病在生产上还不能完全得到适当的控制伴随着温室效应加剧全球气候开始变暖，水稻稻瘟病害的爆发向不可收拾的趋势发展，数据结果表明，2010年稻瘟病发病面积达6000km2，2014年是中国稻瘟病发病最严重的一年，高达58000km2；2019年发病面积达3333km2，为此有效预防水稻稻瘟病的发生，把稻瘟病造成的损失降到最低是水稻生产最重要任务之一，因此筛选抗稻瘟病的优良品种非常重要。目前关于稻瘟病抗性品种的筛选主要是进行人工接种鉴定或自然诱发鉴定，方法原始，机制不够明确，人工接种的方法进行稻瘟病抗性鉴...
【技术保护点】
1.一种鉴定Piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，鉴定Piz座位系列等位的功能标记组方法包括：选择Piz座位的等位基因外显子cds2作为分子标记开发的靶标序列；根据靶标序列在不同抗病等位基因以及感病基因间进行多序列比对，筛选用于区分Pik座位不同抗性等位基因的SNP位点；根据SNP位点序列设计KASP标记引物，开发用于Pik座位抗感基因区分以及不同抗性等位基因区分的功能标记组，利用功能标记组区分不同的抗性等位基因。
2.如权利要求1所述鉴定Piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，鉴定Piz座位系列等位的功能标记组方法包括以下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法包括：选择piz座位的等位基因外显子cds2作为分子标记开发的靶标序列；根据靶标序列在不同抗病等位基因以及感病基因间进行多序列比对，筛选用于区分pik座位不同抗性等位基因的snp位点；根据snp位点序列设计kasp标记引物，开发用于pik座位抗感基因区分以及不同抗性等位基因区分的功能标记组，利用功能标记组区分不同的抗性等位基因。
2.如权利要求1所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法包括以下步骤：
3.如权利要求2所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，步骤一中的分子标记开发靶标序列的选择包括：
4.如权利要求2所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，步骤二中的靶标序列变异分析包括：
5.如权利要求2所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，步骤三中的特征snp的kasp功能标记开发包括：
6.如权利要求5所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法，其特征在于，用于pik座位不同等位基因鉴定的功能标记组的引物序列如下：
7.如权利要求2所述鉴定piz座位系列等位的功能标记组方法...
【专利技术属性】
技术研发人员：杨秀荣，闫双勇，李月娇，孙淑琴，李广胜，
申请(专利权)人：天津市农业科学院，
类型：发明
国别省市：
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