【技术实现步骤摘要】
：本专利技术属水产养殖生物，更具体地说，涉及基因单核苷酸多态性(snp)的检测，特别涉及一种凡纳滨对虾保幼激素酸甲基转移酶(jhamt)基因一个引起生长速度差异的snp分子标记，以及四引物扩增受阻突变体系pcr检测方法检测出该snp标记基因型的检测方法，和在快速生长亲虾个体鉴定、群体选育和品系维持方面的应用。
技术介绍
1、凡纳滨对虾(litopenaeus vannamei)俗称南美白对虾，是世界第一养殖对虾品种。在我国，凡纳滨对虾年产量已达到210万吨，占全国养殖对虾总产量90％。生长速度是养殖对虾最重要的经济性状，如何鉴别出具有快长优良性状的凡纳滨对虾种质资源，培育出生长速度快的凡纳滨对虾品种，并防止在传代过程中衰退，对我国对虾种业发展至关重要的问题。
2、保幼激素酸甲基转移酶(juvenile hormone acid o-methyltransferase，jhamt)是昆虫类的保幼激素(juvenile hormone，jh)和甲壳类的甲基法尼酯(methyl farnesate，mf)合成途径中一种关键的酶，在对虾中将法尼酯(farnesate)催化为甲基法尼酯。mf是对虾生长和蜕皮的关键调控激素，jhamt的酶活性，对对虾的生长速度起非常重要的调控作用。
3、随着现代生物技术和遗传学技术在水产领域的快速转化，以性状相关功能基因为基础的分子标记技术成为水产遗传育种的关键技术之一。snp作为一种遗传标记，具有发生频率高、能稳定遗传、易进行自动化检测等优点，并且在不同物种、不同品种间snp分布都
技术实现思路
1、本专利技术的第一个目的是提供一种区分凡纳滨对虾生长速度的snp分子标记。
2、本专利技术发现凡纳滨对虾个体jhamt基因(其核苷酸序列如seq id no.1所示)在751位点的多态性。该位点从a到c的突变，会引起编码蛋白第251位氨基酸发生从赖氨酸(k)到谷氨酸(q)的错义突变。当该位点为c/c纯合时，对虾生长速度最快；该位点为a/c杂合时，对虾生长速度较快；该位点为a/a纯合时，对虾生长速度最慢。
3、因此，本专利技术提供了区分凡纳滨对虾生长速度快慢的snp分子标记，其位于凡纳滨对虾jhamt基因序列(其核苷酸序列如seq id no.1所示)的751位点处，突变类型为c/c纯合、a/c杂合和a/a纯合；
4、本专利技术的第二个目的是提供上述jhamt基因snp分子标记在制备区分凡纳滨对虾生长速度中应用。
5、该snp分子标记可以应用在凡纳滨对虾快速生长亲虾个体鉴定、群体选育和品系维持方面。
6、本专利技术的第三个目的是提供一种上述jhamt基因的snp基因型的检测引物组，其特征在于：
7、正向外侧引物jhamtf1、反向外侧引物jhamtr1；正向内侧引物jhamtf2、反向内侧引物jhamtr2；
8、所述引物jhamtf1、jhamtr1、jhamtf2、jhamtr2序列为：
9、jhamtf1：5’-cacaccatcacccgtcatcg-3’
10、jhamtr1：5’-ctccctccctctctccctct-3’
11、jhamtf2：5’-caaagcgcattccgacggaga-3’
12、jhamtr2：5’-catgaggaaggcgtcttgctg-3’
13、本专利技术的第四个目的是提供一种末端简并的jhamt基因四引物扩增受阻突变体系pcr检测方法，其包括以下步骤：
14、提取待测凡纳滨对虾的基因组dna，以基因组dna为模板利用上述组合一和/或组合二的引物进行扩增，pcr产物琼脂糖凝胶电泳分析：jhamt的snp位点c/c基因型表现为560bp和433bp两个条带，a/c基因型表现为560bp、433bp和168bp三个条带，a/a基因型表现为528bp和168bp两个条带。
15、本专利技术提供了区分生长速度快慢的snp位点，并开发了扩增该snp位点基因型的四引物，以及检测该snp基因型的检测方法，利用该方法能够简单、快速、低成本、精准的检测该位点的多态性形式，有利于快速筛选快速生长凡纳滨对虾亲虾个体、选育群体和品系。
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1.一种区分凡纳滨对虾生长速度的SNP分子标记，其特征在于，位于凡纳滨对虾JHAMT基因序列的751位点处，突变类型为C/C纯合、A/C杂合和A/A纯合，所述的凡纳滨对虾JHAMT基因，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.权利要求1所述的SNP分子标记在制备区分凡纳滨对虾生长速度中应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，是在凡纳滨对虾快速生长亲虾个体鉴定、群体选育和品系维持方面。
4.一种区分凡纳滨对虾生长速度的SNP分子标记的检测引物组，其特征在于：包括正向外侧引物JHAMTF1、反向外侧引物JHAMTR1；正向内侧引物JHAMTF2、反向内侧引物JHAMTR2；
5.一种区分凡纳滨对虾生长速度的SNP分子标记的检测方法，其包括以下步骤：提取待测凡纳滨对虾的基因组DNA，以基因组DNA为模板利用上述组合一和/或组合二的引物进行扩增，PCR产物琼脂糖凝胶电泳分析：JHAMT的SNP位点C/C基因型表现为560bp和433bp两个条带，A/C基因型表现为560bp、433bp和168bp三个条带，A/A基因型表现
...【技术特征摘要】
1.一种区分凡纳滨对虾生长速度的snp分子标记，其特征在于，位于凡纳滨对虾jhamt基因序列的751位点处，突变类型为c/c纯合、a/c杂合和a/a纯合，所述的凡纳滨对虾jhamt基因，其核苷酸序列如seq id no.1所示。
2.权利要求1所述的snp分子标记在制备区分凡纳滨对虾生长速度中应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，是在凡纳滨对虾快速生长亲虾个体鉴定、群体选育和品系维持方面。
4.一种区分凡纳滨对虾生长速度的snp分子标记的检测引物组，其特征在于：...
【专利技术属性】
技术研发人员：陈廷，任春华，江晓，胡超群，张吕平，程开敏，张鑫，罗鹏，王艳红，吴玉刚，刘丽燕，
申请(专利权)人：中国科学院南海海洋研究所，
类型：发明
国别省市：
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