【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物，具体涉及一种上饶大面白茶树的分子标记及其应用。
技术介绍
1、上饶大面白茶树(prunus salicina var.taoxingli)是茶树无性系品种之一，原产江西省上饶县上泸乡及钻山、龙元岗一带，栽培历史已有一百余年。原产江西省上饶县上沪乡洪水坑。主要分布在江西上饶等县。河南、湖南、安徽、广东等省有引种。1985年全国农作物品种审定委员会认定为国家品种，编号gs13018—1985。上饶大面白茶树植株较高大，树姿开张，分枝密度中等，叶片下垂状着生。叶长椭圆形，叶色绿，有光泽，叶面微隆起，叶齿粗，叶质厚软。芽叶肥壮，黄绿色，茸毛特多，一芽三叶百芽重73.5g。花冠直径6.5cm，花瓣6瓣，子房茸毛中等，花柱3裂。芽叶生育力强，持嫩性强。春茶萌发期在3月下旬，一芽三叶盛期在4月中旬。产量高，每667平方米可达200kg。春茶一芽二叶干样约含氨基酸3.1％、茶多酚21.1％、儿茶素总量12.3％。适制绿茶、红茶和乌龙茶。制上饶白眉、仙台大白，条索壮实，隐绿显毫，香气清鲜，味醇回甘。扦插繁殖力较强。
2、由于上饶大面白茶引种广泛，且不同茶树在种苗期，甚至成苗期表型都比较接近，难以鉴别。目前还未有用于上饶大面白茶树准确鉴定的分子标记。
技术实现思路
1、为了克服上述困难，我们采用了基于二代测序的方法获得了上饶大面白茶树的两段段at富集片段。经分析该片段与现有任何茶树的基因组均不存在高度同源,适合作为上饶大面白茶树的鉴定的参考序列。进一步利用测序数据设计了
2、一方面，本法提供一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树分子标记，其核酸序列如seq id no:1和/或seq id no:2所示。
3、另一方面，本专利技术的另一目的在于提供上述分子标记在上饶大面白茶树鉴定或辅助鉴定中的应用。
4、另一方面，本专利技术提供一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
5、1)采集待检测的茶树绿色组织作为待检测样品；
6、2)提取待检测样品的总dna；
7、3)对上述样品的总dna分别进行二代高通量测序，获得测序reads；
8、4)对测序数据进行组装，将组装的contigs与前述分子标记比对；
9、5)将能够完全覆盖分子标记且一致性最高的contigs与分子标记进行序列比对，根据比对结果判断所述样品是否为上饶大面白茶树；如能与所述分子标记序列一致，即判断待测样品的物种是上饶大面白茶树。
10、另一方面，本专利技术提供一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
11、1)采集待检测茶树绿色组织作为待检测样品；
12、2)提取待检测样品的总dna；
13、3)对上述样品的总dna分别进行二代高通量测序，获得测序reads；
14、4)利用geneious软件的默认参数将上述测序reads比对到本申请所述的dna分子标记上；
15、5)根据测序reads在dna分子标记上的覆盖情况判断所述样品是否含上饶大面白茶树；如能够完全覆盖所述分子标记，且可生成与dna分子标记完全一致的一致性序列，即判断待测样品的物种包含是上饶大面白茶树；
16、在一个实施例中，步骤4)中将多个样品测序reads混合分组。
17、在一个实施例中，如果前述步骤4)中将多个样品测序reads混合分组，则进一步包含步骤6)将含有上饶大面白茶树的样品进一步分成两组，分别混合测序reads，重复上述5)，直至鉴定出单独的样品的上饶大面白茶树。
18、在一个实施例中，步骤2)中所述高通量测序为二代测序或三代测序。
19、在一个实施例中，步骤3)中使用geneious、bowtie、tophat或hisat任一款软件进行reads比对。
20、在一个实施例中，单独使用seq id no:1或seq id no:2。
21、在一个实施例中，将seq id no:1和seq id no:2联合使用。
22、本专利技术的有益效果是：
23、第一，本专利技术第一次提供了两段上饶大面白茶树基因组at富集片段。经分析该片段与现有任何其它茶树的基因组均不存在高度同源,适合作为上饶大面白茶树鉴定的参考序列。
24、第二，本专利技术可以对混合样品，例如直接采集绿色组织进行总dna提取，通过高通量测序获得样品的dna信息，并通过与参考序列比对鉴定样品是否含有上饶大面白茶树。
25、第三，直接通过高通量测序，无需引物设计，避免引物设计困难，操作方便，灵敏度高。
26、第四，本专利技术同时提供了2段特异性标记，可单独使用或联合使用，联合使用更加准确。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.用于鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的分子标记，所述分子标记包含SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.2的至少一个序列。
2.一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
3.一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
4.如权利要求3所述的鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于，步骤4)中将多个样品测序reads混合分组，进一步包含步骤6)将含有上饶大面白茶树的样品进一步分成两组，分别混合测序reads，重复上述5)，直至鉴定出单独的样品的上饶大面白茶树。
5.如权利要求2～权利要求4任一项所述的鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于，步骤2)中所述高通量测序为二代测序或三代测序。
6.如权利要求2～权利要求4任一项所述的鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于，步骤3)中使用Geneious、Bowtie、Tophat或HISAT任一款软件极性reads比对。
7.权利要求1所述的分子标记作为参考序列在鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法
...【技术特征摘要】
1.用于鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的分子标记，所述分子标记包含seq id no.1或seq id no.2的至少一个序列。
2.一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
3.一种鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于包含以下步骤：
4.如权利要求3所述的鉴定或辅助鉴定上饶大面白茶树的方法，其特征在于，步骤4)中将多个样品测序reads混合分组，进一步包含步骤6)将含有上饶大面白茶树的样品进一步分成两组，分别混合测序reads，...
【专利技术属性】
技术研发人员：尹明华，李文婷，欧阳茜，王美暄，徐子林，张钦荣，张牧彤，黄添慧，何凡凡，乐芸，张嘉欣，
申请(专利权)人：上饶师范学院，
类型：发明
国别省市：
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