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【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】
本文的教导涉及提高扫描swath串联质谱法的分辨率。更具体而言,本文的教导涉及用于操作质谱仪以产生具有不同偏移量或移位的前体离子质量范围的多次扫描的系统和方法。来自多次扫描的测得的产物离子强度测量结果(measurement)被用作线性重构算法的输入,以提高前体离子质荷比(m/z)维度中测得的产物离子强度数据的分辨率。本文的系统和方法可以结合处理器、控制器或计算机系统(诸如图1的计算机系统)来执行。
技术介绍
1、如下所述,扫描swath是一种串联质谱方法,其中跨质量范围扫描前体离子质量选择窗口,使得相继的窗口具有大的重叠区域和小的非重叠区域。这种扫描使结果所得的产物离子成为被扫描的前体离子质量选择窗口的函数。这个附加信息对于识别负责每个产物离子的一个或多个前体离子是有用的,这在传统的swath中有时难以做到。
2、扫描swath的一个问题是,在前体离子m/z(q1)维度中提供的数据的水平受到前体离子质量过滤器(q1四极杆)的速度的限制。这降低了峰指派(peak assignment)的保真度,但更重要的是,在扫描swath的情况下,它限制了可能产生各种测得的产物离子的前体离子m/z的定义。这种前体离子m/z的算法隔离要求对质量剖面进行合理的定义并且,在许多情况下,跨前体离子质量范围仅存在有限数量的数据点。
3、因此,需要可以提高前体离子m/z维度中扫描swath测量结果的分辨率的系统和方法。
4、串联质谱法和扫描swath
5、一般而言,串联质谱法或ms/ms是用于分析化合物的众
6、串联质谱法可以提供定性和定量信息。产物离子谱可以被用于识别感兴趣的分子。一种或多种产物离子的强度可以被用于定量样本中存在的化合物的量。
7、可以使用串联质谱仪执行大量不同类型的实验方法或工作流程。这些工作流程的三大类是靶向获取、信息相关的获取(ida)或数据相关的获取(dda)和数据独立的获取(dia)。
8、在靶向获取方法中,为感兴趣的化合物预定义从前体离子到产物离子的一个或多个过渡。当样本被引入串联质谱仪时,在多个时间段或循环中的每个时间段或循环期间询问一个或多个过渡。换句话说,质谱仪选择并裂解每个过渡的前体离子,并对过渡的产物离子执行目标质量分析。因此,为每个过渡产生质谱。靶向获取方法包括但不限于多反应监视(mrm)和选择的反应监视(srm)。
9、在ida方法中,随着样本被引入串联质谱仪,用户可以指定用于执行产物离子的靶向或非靶向质量分析的准则。例如,在ida方法中,执行前体离子或质谱法(ms)调查扫描以生成前体离子峰列表。用户可以选择准则来过滤峰列表以找到峰列表上前体离子的子集。然后对前体离子的子集的每个前体离子执行ms/ms。为每个前体离子产生产物离子谱。随着样本被引入串联质谱仪,对前体离子的子集的前体离子重复执行ms/ms。
10、但是,在蛋白质组学和许多其它样本类型中,化合物的复杂性和动态范围非常大。这对传统的靶向和ida方法提出了挑战,要求非常高速的ms/ms获取来深入询问样本,以便既识别又量化范围广泛的分析物。
11、因此,开发了dia方法,串联质谱法的第三大类。这些dia方法已被用于提高从复杂样本收集数据的重现性和全面性。dia方法也可以被称为非特定裂解方法。在传统的dia方法中,串联质谱仪的动作在基于先前前体离子或产物离子扫描中获取的数据的ms/ms扫描之间没有变化。而是选择前体离子质量范围。然后前体离子质量选择窗口跨前体离子质量范围步进。前体离子质量选择窗口中的所有前体离子被裂解,并且前体离子质量选择窗口中的所有前体离子的所有产物离子都被质量分析。
12、注意的是,术语“质量”和“质荷比(m/z)”可以互换使用。本领域普通技术人员理解,质量可以通过除以电荷而转换成m/z,并且m/z可以通过乘以电荷而转换成质量。因此,术语“质量”的使用还应当包括“m/z”,并且术语“m/z”的使用还应当包括“质量”。
13、用于扫描质量范围的前体离子质量选择窗口可以非常窄,使得窗口内多个前体的可能性小。这种类型的dia方法称为例如ms/msall。在ms/msall方法中,大约1amu的前体离子质量选择窗口在整个质量范围内被扫描或步进。为每个1amu前体质量窗口产生产物离子谱。通过组合每个质量选择窗口的产物离子谱,产生整个前体离子质量范围的产物离子谱。分析或扫描整个质量范围一次所需的时间被称为一个扫描周期。但是,在每个周期期间在宽的前体离子质量范围内扫描窄的前体离子质量选择窗口对于一些仪器和实验来说是不切实际的。
14、因此,更大的前体离子质量选择窗口或具有更大宽度的选择窗口跨整个前体质量范围步进。这种类型的dia方法被称为例如swath获取。在swath获取中,在每个周期中跨前体质量范围步进的前体离子质量选择窗口的宽度可以是5-25amu,或者甚至更大。与ms/msall方法一样,每个前级离子质量选择窗口中的所有前体离子都被裂解,并且每个质量选择窗口中所有前体离子的所有产物离子都进行质量分析。但是,因为使用了更宽的前体离子质量选择窗口,所以与ms/msall方法的周期时间相比,周期时间可以显著减少。或者,对于液相色谱(lc),可以增加累积时间。一般而言,对于lc,周期时间由lc峰定义。必须跨lc峰获得足够多的点(强度作为周期时间的函数)才能确定其形状。当周期时间由lc定义时,一个周期中可以执行的实验或质谱法扫描的次数定义每次实验或扫描可以累积离子观察的时间。因此,更宽的前体离子质量选择窗口可以增加累积时间。
15、美国专利no.8,809,770描述了可以如何使用swath获取来提供关于感兴趣的化合物的前体离子的定量和定性信息。特别地,将从裂解前体离子质量选择窗口中发现的产物离子与感兴趣的化合物的已知产物离子的数据库进行比较。此外,分析从裂解前体离子质量选择窗口中发现的产物离子的离子痕量或提取的离子色谱图(xic),以提供定量和定性信息。
16、但是,例如,在使用swath获取分析的样本中识别感兴趣的化合物会是困难的。这会是困难的,因为没有随前体离子质量选择窗口提供的前体离子信息来帮助确定产生每个产物离子的前体离子,或者提供的前体离子信息来自具有低灵敏度的质谱法(ms)观察。此外,因为随前体离子质量选择窗口提供的特定前体离子信息很少或没有,所以也难以确定产物离子是否与前体离子质量选择窗口内的多个前体离子卷积或包括来自多个前体离子的贡献。
17、因此,开发了一种在swath获取中扫描前体离子质量选择窗口的方法,称为扫描swath。本质上,在扫描swath中,前体离子质量选择窗口跨质量范围进行扫描,因此连续的窗口具有大面积重叠和小面积非重叠。这种扫描使结果所得的产物离子成为被扫描的前体离子质量选择窗口的函数。进而,这种附本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种质谱分析系统,包括:
2.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括交织算法。
3.如权利要求2所述的系统,其中交织算法包括分数像素重叠值为0的可变像素重构算法。
4.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括可变像素重构算法。
5.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括移位并相加算法。
6.如权利要求5所述的系统,其中移位并相加算法包括分数像素重叠值为1的可变像素重构算法。
7.如权利要求1所述的系统,其中处理器还根据作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度来识别所述至少一个产物离子的前体离子。
8.如权利要求1所述的系统,其中处理器还将作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度存储在存储器设备中。
9.一种质谱分析方法,包括:
10.如权利要求9所述的方法,其中线性重构算法包括交织算法。
11.如权利要求9所述的方法,其中线性重构算法包括可变像素重构算法。
12.如权利要求9所述的方法,其中线性
13.如权利要求9所述的方法,还包括根据作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度来识别所述至少一个产物离子的前体离子。
14.如权利要求9所述的方法,还包括还将作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度存储在存储器设备中。
15.一种计算机程序产品,包括非暂态有形计算机可读存储介质,其内容包括具有在处理器上执行的用于质谱分析方法的指令的程序,包括:
...【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】
1.一种质谱分析系统,包括:
2.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括交织算法。
3.如权利要求2所述的系统,其中交织算法包括分数像素重叠值为0的可变像素重构算法。
4.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括可变像素重构算法。
5.如权利要求1所述的系统,其中线性重构算法包括移位并相加算法。
6.如权利要求5所述的系统,其中移位并相加算法包括分数像素重叠值为1的可变像素重构算法。
7.如权利要求1所述的系统,其中处理器还根据作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度来识别所述至少一个产物离子的前体离子。
8.如权利要求1所述的系统,其中处理器还将作为前体离子m/z的函数的所述至少一个产物离子的重构的强度...
【专利技术属性】
技术研发人员:S·A·泰特,
申请(专利权)人:DH科技发展私人贸易有限公司,
类型:发明
国别省市:
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