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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物,特别是涉及一种用于鉴定天鹅性别的rpa引物、试剂盒及应用。
技术介绍
1、天鹅别称鸿鹄,是雁形目鸭科天鹅属的一种大型水禽,雌雄体态及羽毛色泽基本一致,外观区别不十分明显,单凭肉眼观察比较难以分辨雌雄,其中,黑天鹅(学名:cygnusatratus)属于雁形目天鹅科,原产于澳大利亚塔斯马尼亚州和新西兰,属于单态性鸟类,在外观和和其他行为特点也都难以区分雌雄。
2、传统性别鉴定的方法是通过观察黑天鹅的泄殖腔形态差异进行鉴定,而此种判断方法对黑天鹅的应激较大,主观性强,还具有侵入性和危害性,严重还会导致不育或死亡。随着分子技术的发展,pcr等分子鉴定技术已为黑天鹅性别鉴定提供了工具,但是常规的pcr方法设备要求较高,耗时长,对操作人员专业素质要求高,该方法也难以普及于一般动物园或饲养场。然而在动物园的饲养、管理工作中,需要能快速准确无创对黑天鹅进行性别鉴定,才能更有利于饲养管理、繁殖与育种、遗传疾病的防治、种群结构和种群遗传分析,更有利于加强饲养管理同时降低饲养成本,提高经济效益。因此,亟需一种快速鉴别黑天鹅性别且伤害性较小的方法。
技术实现思路
1、针对上述问题,本专利技术提供一种用于天鹅性别鉴定的引物,采用该引物能够凭借少量羽毛就快速、准确、无创地鉴定天鹅性别,且全程不依赖昂贵的精密仪器,耗时短、鉴定结果准确实用。
2、为了达到上述目的,本专利技术提供了一种用于鉴定天鹅性别的rpa引物,包括:
3、上游引物:5’-agaggag
4、下游引物:5’-aaaccatccaacacagaagtacaagccaaa-3’(seq id no:8)。
5、重组酶聚合酶恒温扩增技术(recombinase polymerase amplification;rpa)是一种由重组酶、单链dna结合蛋白和链置换dna聚合酶参与的恒温扩增技术,在37℃-42℃下进行20-30分钟即可完成扩增,具有特异性强、与pcr灵敏度一致、操作简便、对仪器设备要求低等优点。目前,rpa检测技术已经广泛应用在临床中快速检测病毒、细菌和寄生虫等,然而将rpa技术应用于鉴别天鹅性别时,并非任意功能性基因片段就能实现较好的扩增、鉴定效果。本专利技术人选择黑天鹅基因组中雌雄存在差异的z与w染色体螺旋蛋白基因(chromo-helicase-dnabinding gene,chd)序列作为目的扩增片段,然而在进一步研究过程中,本专利技术人发现并非任意以chd为目的扩增片段的引物序列均能实现较好的性别鉴定,本专利技术人经过实验后,提出上述rpa引物,采用该引物能够凭借少量羽毛就快速、准确、无创地鉴定天鹅性别,且全程不依赖昂贵的精密仪器,耗时短、鉴定结果准确实用。
6、本专利技术还提供了所述的rpa引物在制备用于鉴定天鹅性别的试剂和/或试剂盒中的应用。
7、本专利技术还提供了一种用于鉴定天鹅性别的试剂盒,包括所述rpa引物。
8、在其中一个实施例中,所述试剂盒包括rpa反应体系,所述rpa反应体系包括重组酶、单链结合蛋白、dna聚合酶和所述rpa引物。
9、在其中一个实施例中,所述rpa引物的工作浓度为0.15-0.25μm。
10、所述工作浓度为上述rpa引物在使用时能够达到预期效果的浓度,可以理解的,本领域技术人员在配制含有上述rpa引物的产品时,可以配制浓度更高的母液或者储备液,待使用时再稀释,所述母液或者储备液及其浓度均在本专利技术的保护范围之内。在其中一个实施例中,所述rpa反应体系还包括:反应缓冲液、醋酸镁溶液、雌性阳性模板、雄性阳性模板。
11、本专利技术还提供了一种天鹅性别鉴定的方法,包括以下步骤:提取待测样本的dna,进行pcr扩增反应,采用所述试剂盒进行rpa反应。
12、将利用上述引物的试剂盒与rpa扩增法结合,借助雌性黑天鹅w染色体和雄性黑天鹅z染色体的序列差异得到的天鹅性别鉴定方法,简单快速、准确无创,结果判定的电泳条带清晰明亮,且比常规pcr耗时短。
13、在其中一个实施例中,所述天鹅性别鉴定的方法还包括采用所述试剂盒进行rpa反应得到rpa反应产物后,对rpa反应产物进行电泳分析。
14、在其中一个实施例中,所述电泳分析包括以下步骤:将所述rpa反应产物进行纯化,进行琼脂糖凝胶电泳检测,根据检测结果判断天鹅性别。
15、在其中一个实施例中,所述判断天鹅性别的方法包括:所述检测结果为在149bp处出现电泳条带,所述待测样本来源于雌性天鹅;所述检测结果为在240bp处出现电泳条带,所述待测样本来源于雄性天鹅。
16、在其中一个实施例中,所述rpa反应的条件为:将所述rpa反应体系混合后,在37-42℃下反应3-7min,混匀,离心,在37-42℃下反应20-30min,置于冰上终止反应。
17、在其中一个实施例中,所述pcr扩增反应的扩增引物包括第一引物组和/或第二引物组;
18、所述第一引物组包括:chd-w-f:agaggaggaaagacaaaaag(seq id no:9),chd-w-r:tttccattaaagctaatctg(seq id no:10);
19、所述第二引物组包括:chd-z-f:agaggaggaaagacaaaaag(seq id no:11),chd-z-r:cttccattggagctgatc(seq id no:12)。
20、在其中一个实施例中,所述pcr扩增反应的条件为:92-96℃预变性2.5-3.5min;92-96℃变性28-32s,53-57℃退火28-32s,70-75℃延伸28-32s,共35个循环;70-75℃再延伸4.5-5.5min。
21、在其中一个实施例中,所述天鹅包括黑天鹅,所述待测样本包括羽毛。
22、在其中一个实施例中,所述待测样本包括羽毛根部。
23、与现有技术相比,本专利技术具有以下有益效果:
24、本专利技术的一种用于天鹅性别鉴定的引物、试剂盒及应用,采用该引物能够凭借少量羽毛就快速、准确、无创地鉴定天鹅性别,且全程不依赖昂贵的精密仪器,耗时短、鉴定结果准确实用。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种用于鉴定天鹅性别的RPA引物,其特征在于,包括:
2.权利要求1所述的RPA引物在制备用于鉴定天鹅性别的试剂和/或试剂盒中的应用。
3.一种用于鉴定天鹅性别的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的RPA引物。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括RPA反应体系,所述RPA反应体系包括重组酶、单链结合蛋白、DNA聚合酶和权利要求1所述的RPA引物。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述RPA引物的工作浓度为0.15-0.25μM。
6.一种天鹅性别鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测样本的DNA,进行PCR扩增反应,采用权利要求3-5中任一项所述的试剂盒进行RPA反应。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述RPA反应的条件为:将所述RPA反应体系混合后,在37-42℃下反应3-7min,混匀,离心,在37-42℃下反应20-30min,置于冰上终止反应。
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应的扩增引物包括第一引物
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增反应的条件为:92-96℃预变性2.5-3.5min;92-96℃变性28-32s,53-57℃退火28-32s,70-75℃延伸28-32s,共35个循环;70-75℃再延伸4.5-5.5min。
10.根据权利要求6-9中任一项所述的方法,其特征在于,所述天鹅包括黑天鹅,所述待测样本包括羽毛。
...【技术特征摘要】
1.一种用于鉴定天鹅性别的rpa引物,其特征在于,包括:
2.权利要求1所述的rpa引物在制备用于鉴定天鹅性别的试剂和/或试剂盒中的应用。
3.一种用于鉴定天鹅性别的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的rpa引物。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括rpa反应体系,所述rpa反应体系包括重组酶、单链结合蛋白、dna聚合酶和权利要求1所述的rpa引物。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述rpa引物的工作浓度为0.15-0.25μm。
6.一种天鹅性别鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测样本的dna,进行pcr扩增反应,采用权利要求3-5中任一项所述的试剂盒进行rpa反应。
<...【专利技术属性】
技术研发人员:曾繁文,陈谭子芃,陈绚姣,黄康,黄勉,吴其锐,
申请(专利权)人:广州动物园,
类型:发明
国别省市:
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