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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及一种用于推测人亲缘关系等级的snp位点组合,涉及生物信息。
技术介绍
1、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)是法医学领域的第三代遗传标记,具有分布广泛,突变率低,遗传稳定性高的特点,可进行个体身份识别、亲缘关系分析、生物地理推断、体貌表型预测等,是法医个体鉴定的重要遗传标记。基于snp进行亲缘关系尤其是远距离亲缘关系推测的技术又称为法医snp系谱技术,通常采用全基因组snp芯片或全基因组重测序获得高密度snp分型数据信息,进而通过计算模型对7级以内的亲缘关系进行推测。
2、但是,从法医生物检材中获取的dna往往条件有限,普遍存在微量、降解的情况。全基因组重测序snp分析成本高、对dna样品需求大,很难适用于法医学应用;全基因组snp芯片对dna质量要求很高,法医应用场景有限。因此,需要根据全基因组snp分析结果,筛选并构建可用于推测亲缘关系的低密度snp位点组合。
技术实现思路
1、本专利技术提供一种用于推测人亲缘关系等级的snp位点组合及其在推测人亲缘关系等级中的应用,该组合为低密度snp位点组合,在满足亲缘关系等级分析需求的基础上,更适合法医样本鉴定。
2、本专利技术第一方面提供一种用于推测人亲缘关系等级的snp位点组合,包括9000个snp位点,所述9000个snp位点的信息如表2所示。
3、本专利技术第二方面提供一种用于检测上述snp位点组合的引物、探针或基因芯片。
...【技术保护点】
1.用于推测人亲缘关系等级的SNP位点组合,其特征在于,包括9000个SNP位点,所述9000个SNP位点的信息具体如下:
2.用于检测权利要求1所述SNP位点组合的引物、探针或基因芯片。
3.权利要求1所述的SNP位点组合在如下任一方面中的应用:
4.权利要求2所述的引物、探针或基因芯片在如下任一方面中的应用:
5.一种推测亲缘关系等级的方法,其特征在于,根据权利要求1所述的SNP位点组合进行亲缘关系等级的推测。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,包括如下步骤:
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述亲缘关系等级的定义为:
8.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,采集待判定亲缘关系的第一个体和第二个体的生物样本,根据所述生物样本获取第一个体和第二个体的DNA。
9.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,设计用于检测所述SNP位点组合的引物、探针或基因芯片,使用所述引物、探针或基因芯片对所述第一个体和第二个体的DNA进行检测,获取所述第一个体和第二个体的SNP位点组合
10.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述SNP位点组合的基因型联合似然函数的计算方式包括如下步骤:
...【技术特征摘要】
1.用于推测人亲缘关系等级的snp位点组合,其特征在于,包括9000个snp位点,所述9000个snp位点的信息具体如下:
2.用于检测权利要求1所述snp位点组合的引物、探针或基因芯片。
3.权利要求1所述的snp位点组合在如下任一方面中的应用:
4.权利要求2所述的引物、探针或基因芯片在如下任一方面中的应用:
5.一种推测亲缘关系等级的方法,其特征在于,根据权利要求1所述的snp位点组合进行亲缘关系等级的推测。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,包括如下步骤:
7.根据权利要...
【专利技术属性】
技术研发人员:李彩霞,赵雯婷,刘京,赵兴春,姚伊人,
申请(专利权)人:公安部鉴定中心,
类型:发明
国别省市:
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