【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息学，尤其涉及一种基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法及系统。
技术介绍
1、基因组变异分析是生物信息学领域常用的分析技术。基因组变异的类型主要包括单核苷酸多态性(snp)、短的插入缺失(indel)、短串联重复(str)以及多种大片段的结构变异(sv)等等。基因组变异可以用来分析人群祖源及演化、疾病性状关联、辅助诊断治疗等等。
2、同一条染色单体上多个变异位点基因型的组合称为单倍型。对于人类和大多数物种，每个个体的常染色体为二倍体，基因组同一个变异位点有两个等位基因，同一区域也存在两个单倍型。对于常染色体，由于重组现象的存在，邻近的变异之间存在连锁不平衡现象(ld)，即变异之间存在一定的相关性，且相关性随变异位点之间距离的增加而减弱。因此，基因组局部单倍型的分布并非各个变异位点的随机组合，而是存在特定的组成结构。
3、通常直接检测到的是单个变异位点的二倍体基因型，要想从单个位点的基因型得到一定范围内的两个单倍体的基因型，需要借助一些其它信息和算法的辅助，包括测序序列的拼接、基于人群大样本...
【技术保护点】
1.一种基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据预设聚类规则，对单倍型数据进行聚类分析，得到聚类结果，具体为：
3.根据权利要求2所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据单倍型数据中每个单倍型之间的差异距离，对单倍型数据进行聚类分析，得到聚类结果，包括：
4.根据权利要求3所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据单倍型之间存在差异的变异位点，得到单倍型之间的差异距离值，具
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【技术特征摘要】
1.一种基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，包括：
2.根据权利要求1所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据预设聚类规则，对单倍型数据进行聚类分析，得到聚类结果，具体为：
3.根据权利要求2所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据单倍型数据中每个单倍型之间的差异距离，对单倍型数据进行聚类分析，得到聚类结果，包括：
4.根据权利要求3所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据单倍型之间存在差异的变异位点，得到单倍型之间的差异距离值，具体为：
5.根据权利要求3所述的基于聚类的常染色体局部单倍型变异分组方法，其特征在于，所述根据单倍型之间存在差异的变异位点，得到单倍型之间的差异距离值，具体为：
6.根据权利要求...
【专利技术属性】
技术研发人员：张鹏，陈润生，何顺民，郝頔，王晓娜，宋廷瑞，
申请(专利权)人：北京睿博解码生物科技有限公司，
类型：发明
国别省市：
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