【技术实现步骤摘要】
本专利技术属于生物医学领域，具体涉及一种用于预测结肠癌患者预后的生物标志物及其应用。
技术介绍
1、结肠癌是全世界最常见的恶性肿瘤之一，结肠癌患者由于发病隐匿，治疗不及时，导致预后较差。目前，免疫疗法可以改善绝大多数癌症患者的预后，但是对于结肠癌患者来说，只有错配修复缺陷和微卫星不稳定性(dmmr-msi-h)的患者对免疫治疗较为敏感。目前临床上msi是唯一被获批用于筛查结肠癌免疫治疗疗效的生物标志物，但仍有着局限性。
2、据统计，癌症相关血栓(cat)的形成，是接受系统门诊治疗癌症患者非癌症死亡的首要原因，而有研究报道cat的形成与肿瘤免疫抑制性的微环境密切相关。将抗凝药物与免疫检查点抑制剂联合后，已被发现可以改善免疫检查点抑制剂的疗效，这也说明了凝血与免疫抑制的相关性。
3、目前传统的肿瘤tnm分期存在一定的局限性，对患者结局的预测比较困难，也不能进行个性化治疗。有报道提出利用基因表达数据对肿瘤患者进行预后评估。但是，大部分的报道涉及的基因要么过少而不准确，要么过多导致操作困难，而且很少将预后和个性化治疗联系起来。
4、近年来，肿瘤的免疫治疗发展迅速，两种程序性细胞死亡1(pd-1)阻断抗体(pembrolizumab和nivolumab)获得美国食品和药物管理局(fda)批准，用于治疗错配修复缺陷和微卫星不稳定性(dmmr-msi-h)的转移型结肠癌患者。但遗憾的是，只有少数患者从这种治疗中受益。为了更精准的找到适合免疫治疗的患者，2017年，一款免疫微环境基因表达谱标志物-肿瘤发炎指数
技术实现思路
1、针对现有技术的不足，本专利技术提供一种用于预测结肠癌患者预后的生物标志物及其应用，构建的风险模型预测能力稳定，而且基因数目较少，基因检测方法简单，容易实施。
2、本专利技术是通过以下技术方案实现的：
3、一种用于预测结肠癌患者预后的生物标志物，所述生物标志物为凝血相关基因的组合，包括plcb1、rasgrp2、plcg2、serpina5、f2rl2、dusp14、mmp10和timp1。
4、检测上述生物标志物的试剂在制备用于预测结肠癌患者预后的产品中的应用。
5、优选地，所述试剂包括引物、探针或抗体。
6、一种用于预测结肠癌患者预后的风险模型，所述模型以上述生物标志物的表达水平作为输入变量，所述模型采用以下方程计算风险得分：
7、风险值＝(0.447229484560575×plcb1基因表达水平)+(0.362128614897294×rasgrp2基因表达水平)+(0.0457263309301581×plcg2基因表达水平)+(0.350092455079463×serpina5基因表达水平)+(-0.443300975035417×f2rl2基因表达水平)+(0.283241161078688×dusp14基因表达水平)+(-0.167780688007362×mmp10基因表达水平)+(0.225325634783633×timp1基因表达水平)。
8、上述的风险模型在制备预测结肠癌患者预后的产品中的应用，特征基因表达量的检测样本为肿瘤组织。
9、优选地，所述产品为试剂盒或芯片。
10、一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，所述处理器执行以下步骤：
11、步骤1)获取待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据；
12、步骤2)将待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据输入上述的风险模型中，计算待测结肠癌患者的风险评分；
13、步骤3)根据所述风险评分预测结肠癌患者的总体生存率。
14、一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行以下步骤：
15、步骤1)获取待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据；
16、步骤2)将待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据输入上述的风险模型中，计算待测结肠癌患者的风险评分；
17、步骤3)根据所述风险评分预测结肠癌患者的总体生存率。
18、一种计算机程序产品，包括计算机程序，所述计算机程序被处理器执行以下步骤：
19、步骤1)获取待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据；
20、步骤2)将待测结肠癌患者凝血相关基因的表达数据输入上述的风险模型中，计算待测结肠癌患者的风险评分；
21、步骤3)根据所述风险评分预测结肠癌患者的总体生存率。
22、本专利技术的有益效果如下：
23、本专利技术的生物标志物及构建的风险模型可以对患者的预后和免疫治疗情况均进行预测，预测能力稳定，而且基因数目较少，基因检测方法简单，容易实施。本专利技术能更好地指导临床对结肠癌预后较差的患者设计更有针对性的治疗方案，同时可以用于指导免疫检查点抑制剂的应用，实现精准医疗。
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1.一种用于预测结肠癌患者预后的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为凝血相关基因的组合，包括PLCB1、RASGRP2、PLCG2、SERPINA5、F2RL2、DUSP14、MMP10和TIMP1。
2.检测权利要求1所述生物标志物的试剂在制备用于预测结肠癌患者预后的产品中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括引物、探针或抗体。
4.一种用于预测结肠癌患者预后的风险模型，其特征在于，所述模型以权利要求1所述生物标志物的表达水平作为输入变量，所述模型采用以下方程计算风险得分：
5.权利要求4所述的风险模型在制备预测结肠癌患者预后的产品中的应用，其特征在于，特征基因表达量的检测样本为肿瘤组织。
6.根据权利要求5所述的应用，其特征在于，所述产品为试剂盒或芯片。
7.一种计算机设备，包括存储器和处理器，所述存储器存储有计算机程序，其特征在于，所述处理器执行以下步骤：
8.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行以下步骤：
...【技术特征摘要】
1.一种用于预测结肠癌患者预后的生物标志物，其特征在于，所述生物标志物为凝血相关基因的组合，包括plcb1、rasgrp2、plcg2、serpina5、f2rl2、dusp14、mmp10和timp1。
2.检测权利要求1所述生物标志物的试剂在制备用于预测结肠癌患者预后的产品中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述试剂包括引物、探针或抗体。
4.一种用于预测结肠癌患者预后的风险模型，其特征在于，所述模型以权利要求1所述生物标志物的表达水平作为输入变量，所述模型采用以下方程计算风险得分...
【专利技术属性】
技术研发人员：王书奎，潘玉琴，高睿，孙慧玲，许桃，徐牧，
申请(专利权)人：南京市第一医院，
类型：发明
国别省市：
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