【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子生物技术和分子标记，尤其涉及一种山羊amhr2基因作为产羔数关联分子标记的应用。
技术介绍
1、东宝黑头羊是地方品种改良的肉用山羊，其肉质鲜美，膻味轻，但年产肉量并不高。提高羊肉年产量最直接的方法是增加产羔个数，故研究如何通过选育来提高山羊产羔性能，对于提升山羊生产繁殖效益具有十分重要的意义。
2、在分子育种中，分子标记辅助选择(molecularmarker-assisted selection，mas)借助与重要经济性状相关联的分子标记来综合评估畜禽的生产潜能，尤其对于低遗传力性状和难以测量的性状具有更大优势，能有效加快畜禽重要经济性状的改良。分子标记是能够直接反映生物个体或种群间基因组间差异的dna片段，因其存在共显性、高多态性的优势且来源丰富、表现稳定，从基因层面上解释可遗传变异所带来的育种潜力成为热点。
3、单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，snp)属于其中的一种，指个体间基因组中同一位置单个核苷酸发生变异而导致的dna序列改变，后续可影响基因表达量、转录活性及剪接修饰等。故而，借助snp对山羊重要经济性状的选择进展进行辅助选择，将有利于我国山羊产业的可持续发展。pcr-rflp是一种可对多态性位点进行基因分型的技术，其原理是扩增不同个体同一dna序列时，由于碱基突变引起限制性内切酶识别位点发生变化，存在多态性的dna序列在内切酶作用后可产生不同的dna序列片段，经电泳可将大小不同的条带分开，从而可完成各基因型的鉴定。
4
5、到目前为止，并未记载有amhr2基因的相关调控区存在与山羊产羔性状相关的snp分子标记。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于筛选出一种与山羊产羔数关联的分子标记，利用该分子标记在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用。
2、本专利技术的技术方案如下：
3、本专利技术提供了一种山羊snp分子标记在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用，所述snp分子标记位于山羊amhr2基因外显子8中，其所在核苷酸序列如下所示(seq idno:1)：
4、aagaaggtcctgccccttcagcctggcttctcccacaggccagtataaaccaggtatcgcccaccgagatctgagcagccagaatgtgctcattcgggacgatgggtcatgcgccattggagatctgggcctcgccttggtgctccctggcctcgcccagcccccaacctgggcccctagtcaaccccnaggcccggctgccatcatggaggtcagtactctggaggagggtgagacccaggttggtggtggtggtgctgatgacgaagcagcgacagtgcagcagcaccgatagtgtatggggtgctgctgaggctagtccggggtttgcatggactagtgttgcggtgagggttgccatggagatgatccctgccgtccaggctggcacccagcggtacatggcaccggagctcttggacaagactctggaccttcaggactggggcacagccctgcggcgagctgacgtctactctctggctctgctcttgtgggagattatgagtcgctgccgagatttgcgacctggtgaggc。
5、该序列中的n是c或t，t突变的出现导致了ava-i酶切位点发生变化。
6、本专利技术对山羊的品种不做限定，可选的为东宝黑头羊、麻城黑山羊、波尔山羊、宜昌白山羊和马头山羊等山羊品种。
7、本专利技术还提供了用于检测上述snp分子标记的引物对，其特征在于：所述引物对的核酸序列如seq id no：2和seq id no：3所示。
8、本专利技术还提供了一种试剂盒，其特征在于，包括上述的引物对。
9、本专利技术的上述引物对或试剂盒能够用于在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用。
10、本专利技术提供了一种检测山羊产羔数性状的方法，检测山羊的上述seq id no:1序列中，n标记的单核苷酸是c还是t。
11、优选的，用上述引物对或试剂盒进行检测。
12、作为一种可实施的方式，包括以下步骤：提取山羊的基因组dna，用权利要求3所述引物对或权利要求4所述的试剂盒对山羊基因组dna进行pcr扩增，对扩增所得片段进行avai酶切分型，琼脂糖凝胶电泳检测，若观察到186bp和352bp两条带，记为cc基因型；若观察到186bp、352bp和538bp三条带，记为ct基因型；若只观察到538bp一条带，记为tt基因型。
13、本专利技术提供了一种与山羊产羔数关联的分子标记辅助选择方法，包括以下步骤：提取山羊的基因组dna，根据山羊amhr2基因基因组序列设计引物，用所述引物对山羊基因组dna进行pcr扩增，对扩增所得片段进行ava i酶切分型，得到存在ava i-rflp多态性的核苷酸序列；该多态性dna序列如seq id no:1所示，其189bp处存在一个c/t的等位基因突变，以该多态位点作为分子标记与山羊产羔性状进行关联分析。
14、本专利技术提供了一种提高山羊产羔数的遗传育种方法，确定山羊核心群中种羊上述的snp分子标记，并根据山羊snp分子标记做出相应的选择：种羊的继代选育挑选snp标记中第189位碱基为tt型和/或tc型的个体，淘汰cc型个体，以逐代提高该位点基因t的频率，从而提高后代山羊的产羔数性能。
15、本专利技术的有益效果：
16、本发本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种山羊SNP分子标记在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用，其特征在于，所述SNP分子标记位于山羊AMHR2基因外显子8中，核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，该序列中的N是C或T，T突变的出现导致了Ava-I酶切位点发生变化。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述山羊为东宝黑头羊、麻城黑山羊、波尔山羊、宜昌白山羊或马头山羊。
3.一种用于检测权利要求1所述SNP分子标记的引物对，其特征在于：所述引物对的核酸序列如SEQ ID NO：2和SEQ ID NO：3所示。
4.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对。
5.权利要求3所述引物对或权利要求4所述的试剂盒在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用。
6.一种检测山羊产羔数性状的方法，其特征在于，检测山羊的SEQ ID NO:1所示序列中，N标记的单核苷酸是C还是T。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，用权利要求3所述引物对或权利要求4所述的试剂盒进行检测。
8.根据权利要求6或7所述的方法，其特征在于，包括
9.一种与山羊产羔数关联的分子标记辅助选择方法，其特征在于，包括以下步骤：提取山羊的基因组DNA，根据山羊AMHR2基因基因组序列设计引物，用所述引物对山羊基因组DNA进行PCR扩增，对扩增所得片段进行AvaI酶切分型，得到存在AvaI-RFLP多态性的核苷酸序列；该多态性DNA序列如SEQ ID NO:1所示，其189bp处存在一个C/T的等位基因突变，以该多态位点作为分子标记与山羊产羔性状进行关联分析。
10.一种提高山羊产羔数的遗传育种方法，其特征在于，确定山羊核心群中种羊的权利要求1中所述的SNP分子标记，并根据山羊SNP分子标记做出相应的选择：种羊的继代选育挑选SNP标记中第189位碱基为TT型和/或TC型的个体，淘汰CC型个体，以逐代提高该位点基因T的频率，从而提高后代山羊的产羔数性能。
...【技术特征摘要】
1.一种山羊snp分子标记在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用，其特征在于，所述snp分子标记位于山羊amhr2基因外显子8中，核苷酸序列如seq id no:1所示，该序列中的n是c或t，t突变的出现导致了ava-i酶切位点发生变化。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于，所述山羊为东宝黑头羊、麻城黑山羊、波尔山羊、宜昌白山羊或马头山羊。
3.一种用于检测权利要求1所述snp分子标记的引物对，其特征在于：所述引物对的核酸序列如seq id no：2和seq id no：3所示。
4.一种试剂盒，其特征在于，包括权利要求3所述的引物对。
5.权利要求3所述引物对或权利要求4所述的试剂盒在山羊产羔数性状检测或山羊育种中的应用。
6.一种检测山羊产羔数性状的方法，其特征在于，检测山羊的seq id no:1所示序列中，n标记的单核苷酸是c还是t。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，用权利要求3所述引物对或权利要求4所述的试剂盒进行检测。
8.根据权利要求6或7所述的方法，其特征在于，包括以下步骤：提取山羊的基因组dna...
【专利技术属性】
技术研发人员：熊琪，柴进，王玥，陶虎，张年，上官爱哨，张凤，
申请(专利权)人：湖北省农业科学院畜牧兽医研究所，
类型：发明
国别省市：
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。