【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及分子标记，尤其涉及一种与蓖麻果刺关联的snp标记及其应用。
技术介绍
1、蓖麻(ricinus communis l.)是一种重要的工业油料作物，原产于印度、地中海盆地东南部和非洲东部。印度、巴西、中国、俄罗斯、泰国和菲律宾是最重要的蓖麻种植国。蓖麻油富含一种特殊的羟基脂肪酸，因此被用作许多不同的工业产品的原料。蓖麻的果刺性状是主要的农艺性状之一。常见的蓖麻蒴果分为有刺型和无刺型。但是在实际的大田育种中，将蓖麻蒴果性状划分为有刺和无刺两种类型比较笼统。比如在有果刺的育种材料中还常见到少量果刺型、中等数量果刺型、密刺型。目前，对蓖麻果刺性状的遗传和分子机制仍不清晰，尚未见到基于谱图定位获得的与蓖麻果刺性状关联的标记和基因的研究。
技术实现思路
1、本专利技术的目的在于提供一种与蓖麻果刺关联的snp标记及其应用，基于已构建的高密度snp遗传图谱，通过性状表型值与分子标记连锁分析对蓖麻果刺性状进行qtl定位，并通过基因注释在qtl区间筛选与蓖麻果刺性状关联的snp分子标记，为蓖麻分子标记辅助育种提供理论依据。
2、为了实现上述专利技术目的，本专利技术提供以下技术方案：
3、本专利技术提供了一种与蓖麻果刺关联的snp分子标记，所述snp分子标记为：mk2189、mk5539、mk5692和mk5693中的一种或几种；
4、所述mk2189的scaffold位置为28470，物理位置为118469，参考基因组碱基型为c，检测样本参考碱基型为t
5、所述mk5539的scaffold位置为29010，物理位置为74050，参考基因组碱基型为t，检测样本参考碱基型为a，所在的基因为29010.t000006；
6、所述mk5692的scaffold位置为29491，物理位置为6385，参考基因组碱基型为c，检测样本参考碱基型为g，所在的基因为29491.t000001；
7、所述mk5693的scaffold位置为29491，物理位置为14928，参考基因组碱基型为g，检测样本参考碱基型为a，所在的基因为29491.t000004或29491.t000005。
8、本专利技术还提供了所述的与蓖麻果刺关联的snp分子标记在鉴定蓖麻果刺上的应用。
9、作为优选，所述蓖麻的品种为sl1和hch1。
10、本专利技术提供了一种与蓖麻果刺关联的snp标记及其应用。本专利技术提供的与蓖麻果刺关联的snp分子标记为：mk2189、mk5539、mk5692和mk5693中的一种或几种。本专利技术通过对一组多世代蓖麻遗传群体的果刺性状进行遗传规律分析，得出蓖麻果刺是由一对不完全显性基因控制的性状，有刺为显性，无刺为隐性。通过性状表型值与分子标记连锁分析对蓖麻果刺性状进行qtl定位，并通过基因注释在qtl区间筛选与蓖麻果刺性状关联的snp分子标记，为蓖麻分子标记辅助育种提供理论依据。
本文档来自技高网...【技术保护点】
1.一种与蓖麻果刺关联的SNP分子标记，其特征在于，所述SNP分子标记为：mk2189、mk5539、mk5692和mk5693中的一种或几种；
2.权利要求1所述的与蓖麻果刺关联的SNP分子标记在鉴定蓖麻果刺上的应用。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述蓖麻的品种为SL1和HCH1。
【技术特征摘要】
1.一种与蓖麻果刺关联的snp分子标记，其特征在于，所述snp分子标记为：mk2189、mk5539、mk5692和mk5693中的一种或几种；
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【专利技术属性】
技术研发人员：杨俊芳，王宏伟，曹越，王宙，张宏斌，王亚，赵宜婷，
申请(专利权)人：山西农业大学经济作物研究所，
类型：发明
国别省市：
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