针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒及应用制造技术

技术编号:40112530 阅读:35 留言:0更新日期:2024-01-23 19:24
本发明专利技术提供一种适用于蓝耳病毒1型和2型的全基因组捕获试剂盒及应用,包括:两组引物池,其中第一引物池内的引物含有引物序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.22所示的靶向引物;第二引物池内的引物含有引物序列如SEQ ID NO 23‑SEQ ID NO.41所示的靶向引物,能从血液、咽拭子、感染组织环境中提取的核酸样本中进行登革热病毒全基因组的反转录与富集扩增,可以用于检测与鉴定登革热病毒,也可为登革热病毒的进化分析、分子流行病学研究及科学防控提供了有力的技术手段。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术登革热病毒检测领域,特别涉及一种针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒及应用


技术介绍

1、登革热病毒(denv)是黄病毒科黄病毒属蚊媒病原体,该病毒主要在其载体埃及伊蚊和白纹伊蚊存在的热带地区的城市或半城市地区传播,估计每年感染3.9亿人,其中约1亿人表现出临床症状。登革热病毒(dengue virus)有四种主要的血清型,分别是den-1、den-2、den-3和den-4,这四种血清型是属于同一种病毒,但是在人体内表现为不同的免疫反应。人感染一种血清型的登革热病毒后,会产生对该血清型的免疫保护,但对其他血清型的登革热病毒可能没有足够的免疫力,多次感染不同血清型的登革热病毒可能增加患严重登革热的风险,因为交叉反应的免疫反应可能引发更严重的疾病。

2、从历史上看,denv的分子系统发育研究依赖于包膜(e)基因(~1.5kbp)的测序,该基因编码病毒的主要表面抗原,但是如果为了获取更好的系统发育分辨率就需要获得更长的序列,例如病毒的完整(~10.2kbp)编码区,目前的现有技术的实现方法无法很好地全面覆盖检测登革热病毒全基因组本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,两组引物池中的每一引物由如SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.41其中的靶向引物、UMI序列和barcdoe序列排列组成。

3.根据权利要求1所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,第一引物池中的SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.44所示的靶向引物中相邻序号的正向的靶向引物和反向的靶向引物依次序两两组成一个引物对,第二引物池中的SEQ ID NO.45-SEQID NO...

【技术特征摘要】

1.一种针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,包括:

2.根据权利要求1所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,两组引物池中的每一引物由如seq id no.1-seq id no.41其中的靶向引物、umi序列和barcdoe序列排列组成。

3.根据权利要求1所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,第一引物池中的seq id no.1-seq id no.44所示的靶向引物中相邻序号的正向的靶向引物和反向的靶向引物依次序两两组成一个引物对,第二引物池中的seq id no.45-seqid no.89所示的靶向引物中相邻序号的正向的靶向引物和反向的靶向引物依次序组成一个引物对。

4.根据权利要求1所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,两组引物池内的引物分别对登革热病毒进行多重pcr扩增,且两组引物池的多重pcr扩增条件相同。

5.根据权利要求4所述的针对4种血清型登革热病毒的全基因组捕获试剂盒,其特征在于,多重pcr扩增条件如下表所示:

6.一种针对4种血清型登...

【专利技术属性】
技术研发人员:倪敏君毛凌峰马思杰胡群王敏吴斯豪龙再浩刘永磊
申请(专利权)人:杭州柏熠科技有限公司
类型:发明
国别省市:

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