一种泛癌诊断模型构建方法及miRNA对标记物技术

本发明专利技术涉及肿瘤生物标记物技术领域，尤其是一种泛癌诊断模型构建方法及miRNA对标记物，其中模型构建方法包括以下步骤：1)利用公共数据库Gene Expression Omnibus，收集10组基于血清样本的miRNA表达谱；2)在同一例样本miRNA表达谱中进行筛选并组成miRNA对；3)将原始数据随机分为训练集、验证集、内部测试集与外部测试集；在训练集中筛选具有分类价值的miRNA对，保留了31个特征系数不为0的miRNA对用于模型构建，选择基于RandomForest算法构建的最优模型，确定模型的最优参数；并评估模型对于肿瘤诊断的潜在价值与诊断效能。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及肿瘤生物标记物，具体领域为一种泛癌诊断模型构建方法及mirna对标记物。

技术介绍

1、在全球范围内恶性肿瘤的高发病率与致死率造成了极大的疾病负担。目前对于癌症的一大共识是针对肿瘤的早诊早筛是降低其疾病负担的有效手段，这是由于理论上来说，如果发现的足够及时，所有的恶性肿瘤都是可以完全治愈的。然而由于种种原因，目前并没有一种诊断手段或诊断模型可以从泛癌层面进行准确判断。近年来，基于液体活检的微小rna(mirna)应用于肿瘤的诊断与治疗这一研究方向得到了广泛的关注。

2、mirna是一种由高等真核细胞转录过程中产生，在肿瘤发生发展中起到重要作用的一类非编码rna。但是由于mirna表达值对于区分癌症与正常组织的截断值并不明确，且mirna表达值在不同平台测量存在技术误差，因此这一手段目前在临床工作中并未得到大量应用。

技术实现思路

1、本专利技术的目的在于提供一种泛癌诊断模型构建方法及mirna对标记物。本专利技术建立了机器学习模型，并创新性的采用了mirna对，即两个mirna相对表本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(1)中正常对照包括健康志愿者血清样本及患有良性病变患者血清样本。

3.根据权利要求2所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(2)中，条件1为：纳入miRNA对相对表达值为1的比例在癌症患者中≥82％与miRNA对相对表达值为0的比例在非癌对照组中≥82％；

4.根据权利要求3所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(3)中，31个miRNA对分别为，miR-5739与miR-8073，miR-1228-...

【技术特征摘要】

1.一种泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(1)中正常对照包括健康志愿者血清样本及患有良性病变患者血清样本。

3.根据权利要求2所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(2)中，条件1为：纳入mirna对相对表达值为1的比例在癌症患者中≥82％与mirna对相对表达值为0的比例在非癌对照组中≥82％；

4.根据权利要求3所述的泛癌诊断模型的构建方法，其特征在于：所述步骤(3)中，31个mirna对分别为，mir-5739与mir-8073，mir-1228-3p与mir-4783-3p，mir-1203与mir-4771，mir-6877-5p与mir-6889-5p，mir-1228-5p与mir-3656，mir-4736与mir-575，mir-6763-5p与mir-8073，mir-373-5p与mir-887-3p，mir-8071与mir-8073，mir-135a-3p与mir-373-5p，mir-320b与mir-4478，mir-3184-5p与mir-373-5p，mir-4697-5p与mir-6800-5p，mir-320b与mir-6862-3p，mir-1203与mir-17-3p，mir-320a与mir-4792，mir-1587与mir-17-3p，mir-1225-5p与mir-4783-3p，mir-17-3p与mir-6795-3p，mir-320b与mir-6511b-3p，mir-6880-5p与mir-8073，mir-135a-3p与mir-320a，mir-1203与mir-4740-5p，mir-1228-5p与mir-1469，mir-125a-3p与mir-885-3p，mir-4648与mir-6748-5p，mir-135a-3p与mi...

【专利技术属性】
技术研发人员：赫捷，孙楠，张超奇，吴芃，李东宇，
申请(专利权)人：中国医学科学院肿瘤医院，
类型：发明
国别省市：