一种m6A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置及设备制造方法及图纸

本发明专利技术提供了一种m<supgt;6</supgt;A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置及设备，还公开了m<supgt;6</supgt;A单位点CRISPR筛选体系建立及其应用，提供了一种用于m<supgt;6</supgt;A单细胞CRISPR筛选的gRNA构象、一种构建单细胞水平m<supgt;6</supgt;A单位点CRISPR筛选系统的方法、一种构建转录组水平m<supgt;6</supgt;A单位点CRISPR筛选系统的方法，通过本发明专利技术的方法构建的CRISPR筛选系统能够对结直肠癌肝转移中甲基化显著升高的m<supgt;6</supgt;A位点进行大规模的高通量筛选，进而找寻对结直肠癌肝转移起关键作用的m<supgt;6</supgt;A位点，为肿瘤预防、精准诊断和精准治疗提供全新视角。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及智能医疗领域，更具体地，涉及一种从m6a角度分析结直肠癌肝转移数据的处理方法、装置、设备、介质和程序产品。

技术介绍

1、肝转移(liver metastasis,lm)是结直肠癌(colorectal carcinoma,crc)最常见的远处转移部位，也是此类患者死亡的最主要原因。开展结直肠癌肝转移(colorectalliver metastasis，crlm)的相关研究，发掘与鉴定尚未报道的与转移密切相关的基因并阐明其调控的分子网络和作用机制，对于发现新型肝转移生物标志物、促进分子诊断研究意义重大。

2、rna修饰是一种转录后水平的调控方式，目前已鉴定到超过170多种rna修饰，广泛存在于各类rna，如mrna、trna、rrna、sncrna和incrna。最常见的rna转录后修饰方式有n6-甲基腺苷(n6-methyladenosine，简称m6a，即rna碱基第6个氮原子上的甲基化)和5-甲基胞苷(5-methylcytosine，简称m5c，即胞苷碱基的第5位上有一个rna甲基化等)。m6a甲基化水平受m6a调控蛋白本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种m6A影响结直肠癌肝转移数据的处理方法，其特征在于，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的结直肠癌肝转移数据的处理方法，其特征在于，所述利用算法一分别计算打靶所述潜在关键基因集中每个基因m6A位点的gRNA序列，得到所述潜在关键基因集中每个基因所有可能的gRNA序列及信息，包括：根据所述潜在关键基因集中的基因名称确定所述潜在关键基因对应的所有转录本信息；确定所有转录本可能的所有引物序列信息；将所述引物序列信息和所述基因名称相关联，得到相关联后的文件；利用函数处理所述相关联后的文件，得到包含所有转录本的可能引物序列信息，所述所有转录本的可能引物序列信息为所述所有可能的...

【技术特征摘要】

1.一种m6a影响结直肠癌肝转移数据的处理方法，其特征在于，所述方法包括：

2.根据权利要求1所述的结直肠癌肝转移数据的处理方法，其特征在于，所述利用算法一分别计算打靶所述潜在关键基因集中每个基因m6a位点的grna序列，得到所述潜在关键基因集中每个基因所有可能的grna序列及信息，包括：根据所述潜在关键基因集中的基因名称确定所述潜在关键基因对应的所有转录本信息；确定所有转录本可能的所有引物序列信息；将所述引物序列信息和所述基因名称相关联，得到相关联后的文件；利用函数处理所述相关联后的文件，得到包含所有转录本的可能引物序列信息，所述所有转录本的可能引物序列信息为所述所有可能的grna序列及信息；

3.一种m6a影响结直肠癌肝转移数据的处理装置，其特征在于，所述装置包括：

4.一种计算机设备，其特征在于，所述设备包括：存储器和处理器；所述存储器用于存储程...

【专利技术属性】
技术研发人员：陈雪娜，安三奇，胡慧丽，杜小慧，刘博琛，
申请(专利权)人：山东大学，
类型：发明
国别省市：