基于多级质谱技术鉴定糖链混合物的方法技术

技术编号:40074015 阅读:25 留言:0更新日期:2024-01-17 00:41
本公开提供了一种基于多级质谱技术鉴定糖链混合物的方法,该方法包括以下步骤:根据糖链混合物的一级实验谱,确定与一级实验谱中母离子峰对应的多个候选糖链分支结构;根据多个候选糖链分支结构,通过排列组合方法生成多种候选糖链组合;对每一种候选糖链组合内所有候选糖链分支结构的二级以上理论谱进行加和,得到每一种候选糖链组合的二级以上理论谱;根据每一种候选糖链组合的二级以上理论谱和糖链混合物的二级以上实验谱的相似度,确定糖链混合物中最可能存在的目标糖链组合。

【技术实现步骤摘要】

本公开涉及生物信息分析的,具体地,本公开涉及一种基于多级质谱技术鉴定糖链混合物的方法


技术介绍

0、技术背景

1、糖基化修饰广泛存在于自然界,是蛋白质翻译后修饰中较为重要的一种,大部分的功能蛋白以及多种血浆蛋白质、酶、激素、抗体等都具有糖基化修饰,超过半数的蛋白质在翻译后修饰过程中出现糖基化现象。糖蛋白及其糖基化修饰的研究收到广泛关注,特别是蛋白功能和细胞生理领域。研究表明,蛋白质糖基化修饰与多种疾病的发生发展密切相关,例如癌症、肝病、肾病、炎症、感染、过敏和自身免疫病等,许多疾病诊断标志物及治疗的靶标都是糖蛋白,例如前列腺癌中的前列腺特异性抗原(psa)、乳腺癌中的促生长蛋白(her2/neu)、卵巢癌中的肿瘤抗原(ca125),以及肝癌中的甲胎蛋白(afp)等。美国食品药品监督管理局(fda)已批准并用于临床诊断监控的二十几种蛋白质肿瘤标记物绝大部分都有糖基化修饰。作为系统生物学与转化医学交叉学科的前沿,近年来糖蛋白及其糖基化修饰的研究在临床医学方面具有较高的实际应用潜力。

2、糖蛋白上的糖链多为寡糖(<30个单糖),根本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种基于多级质谱技术鉴定糖链混合物的方法,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述糖链混合物的一级实验谱,确定与所述一级实验谱中母离子峰对应的多个候选糖链分支结构包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中,根据所述每一种候选糖链组合的二级以上理论谱和所述糖链混合物的二级以上实验谱的相似度,确定所述糖链混合物中最可能存在的目标糖链组合包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述每一种候选糖链组合的相似度通过以下公式计算:

5.根据权利要求1所述的方法,还包括:

6.根据权利要求1或5所述的方法,其中...

【技术特征摘要】

1.一种基于多级质谱技术鉴定糖链混合物的方法,包括以下步骤:

2.根据权利要求1所述的方法,其中,所述根据所述糖链混合物的一级实验谱,确定与所述一级实验谱中母离子峰对应的多个候选糖链分支结构包括:

3.根据权利要求1所述的方法,其中,根据所述每一种候选糖链组合的二级以上理论谱和所述糖链混合物的二级以上实验谱的相似度,确定所述糖链混合物中最可能存在的目标糖链组合包括:

4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述每一种候选糖链组合的相似度通过以下公式计算:

5.根据权利要求1所述的方法,还包括:

6.根据权利要求1或5所述的方法,其中,所述糖链混合物的二级以上实验谱中每一级实验谱是...

【专利技术属性】
技术研发人员:黄纯翠孙世伟侯梅洁王辉赵克力卜东波李岩
申请(专利权)人:中国科学院生物物理研究所
类型:发明
国别省市:

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1