【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及农业生物，特别是涉及一种水稻早苗期耐冷主效qtlqctes12dwr候选基因loc_os12g18729。
技术介绍
1、亚洲栽培稻(oryza sativa l.)是世界约半数人口的主要粮食作物，其产量影响全球粮食安全。亚洲栽培稻起源于热带和亚热带地区，是喜温作物，其适宜生长温度为25-35℃，对低温胁迫敏感。低温严重影响水稻地理分布、生长发育、产量和品质，也影响播种时节。此外，水稻种植北限向高海拔、高纬度地区分别迁移了39.15m和24.93km，导致其遭遇低温冷害的几率逐渐增加。籼稻和粳稻分别在18℃和15℃以下就会发生低温冷害。低温冷害在水稻任一生育时期都可能发生，最终导致产量和品质下降，而苗期是对冷害敏感性较高的生育阶段之一。如环境温度低于15℃时，苗期水稻的生理代谢会受到影响。尤其是长江中下游双季稻区，“倒春寒”冷害和冷浸田的水土低温造成水稻僵苗、烂苗及死苗。由于劳力成本上升，因此南方稻区的直播稻倍受稻农青睐，不推自广。但“倒春寒”造成直播早稻烂种、烂芽、死苗，进而导致出苗不齐、成苗率低、发育延缓以及杂草危害(刘次桃等，2018)，严重影响直播早稻安全生产。因此，提高水稻苗期耐冷性，对于减少水稻苗期冷害损失、助推早稻移栽向直播(节约成本、减少白色污染)变革，实现水稻绿色低碳、高质高效生产，具有重要的理论和实践意义。
2、水稻耐冷性是多基因控制的数量性状。基于表型鉴定的传统育种方法不能明确耐冷性的遗传结构，难以对其进行准确选择，且选择效率低，进展缓慢。qtl(quantitativetrait
技术实现思路
1、为了解决上述问题，本专利技术提供了一种水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr候选基因loc_os12g18729，可用于水稻早苗期耐冷品种的鉴定及分子育种。
2、为了实现上述目的，本专利技术提供如下技术方案：
3、本专利技术提供了一种水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr基因，位于水稻第12号染色体上rm5939-rm27947区间内，其区间大小为195kb，物理距离为10,066,394～10,266,442bp，鉴定到其候选基因loc_os12g18729。
4、优选的，
5、1)所述引物对ctes12中上游引物的核苷酸序列为序列表中seq id no.1所示的核苷酸序列，所述引物对ctes12中下游引物的核苷酸序列为序列表中seq id no.2所示的核苷酸序列；
6、2)在高严谨条件下可与序列表中seq id no.1或seq id no.2限定的dna序列杂交的核苷酸序列；
7、3)与1)或2)限定的dna序列具有90％以上同源性，且能扩增出水稻早苗期耐冷相关基因的序列；
8、ctes12-f：5'-ttccttgcttgaactcgagc-3'(seq id no.1)
9、ctes12-r：5'-catctgtgttgctcatgagg-3'(seq id no.2)。
10、本专利技术还提供了上述技术方案所述的水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr基因在早苗期耐冷水稻品种鉴定或育种中的应用。
11、本专利技术还提供了一种鉴定早苗期耐冷水稻品种的方法，包括以下步骤：
12、1)提取待测水稻的基因组dna；
13、2)以步骤1)得到的基因组dna为模板，经上述技术方案中所述的引物对ctes12进行pcr扩增，得到扩增产物；
14、3)将所述步骤2)得到的扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，当得到230bp的条带时，所述待测水稻为早苗期耐冷水稻品种。
15、优选的，所述步骤2)pcr扩增的体系为：2×tolo fasttaqpremix 5.0μl，10pmol/μl的上述技术方案中的上下游引物各1μl，300～500ng/μl的水稻基因组dna 1μl，加灭菌后的超纯水至10μl。
16、优选的，所述步骤2)pcr扩增的程本文档来自技高网...
【技术保护点】
1.一种水稻早苗期耐冷主效QTL qCTES12DWR基因，其特征在于，位于水稻第12号染色体上RM5939-RM27947区间内，其区间大小为195kb，物理距离为10,066,394～10,266,442bp，鉴定到其候选基因Loc_Os12g18729。
2.根据权利要求1所述的水稻早苗期耐冷主效QTL qCTES12DWR，其候选基因为LOC_Os12g18729，其特征在于，
3.权利要求1或2所述的水稻早苗期耐冷主效QTL qCTES12DWR基因在早苗期耐冷水稻品种鉴定或育种中的应用。
4.一种鉴定早苗期耐冷水稻品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤2)PCR扩增的体系为：2×ToloFastTaq Premix 5.0μL，10pmol/μL的权利要求2中的上下游引物各1μL，300～500ng/μL的水稻基因组DNA 1μL，加灭菌后的超纯水至10μL。
6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤2)PCR扩增的程序为：95℃预变性5min；9
7.一种鉴定早苗期耐冷水稻品种的试剂盒，其特征在于，包括权利要求2中所述的引物对CTES12。
...【技术特征摘要】
1.一种水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr基因，其特征在于，位于水稻第12号染色体上rm5939-rm27947区间内，其区间大小为195kb，物理距离为10,066,394～10,266,442bp，鉴定到其候选基因loc_os12g18729。
2.根据权利要求1所述的水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr，其候选基因为loc_os12g18729，其特征在于，
3.权利要求1或2所述的水稻早苗期耐冷主效qtl qctes12dwr基因在早苗期耐冷水稻品种鉴定或育种中的应用。
4.一种鉴定早苗期耐冷水稻品种的方法，其特征在于，包括以下步骤：<...
【专利技术属性】
技术研发人员：胡标林，周诗琪，李霞，吴婷，王世林，
申请(专利权)人：江西省农业科学院水稻研究所，
类型：发明
国别省市：
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