System.ArgumentOutOfRangeException: 索引和长度必须引用该字符串内的位置。 参数名: length 在 System.String.Substring(Int32 startIndex, Int32 length) 在 zhuanliShow.Bind() 多价寡核苷酸试剂及其使用方法技术_技高网

多价寡核苷酸试剂及其使用方法技术

技术编号:40023689 阅读:5 留言:0更新日期:2024-01-16 17:09
本文提供了多价寡核苷酸试剂及其制备方法,所述多价寡核苷酸试剂包含独立地选自单链反义寡核苷酸(ASO,例如gapmer、mixmer和空间位阻型ASO)和双链体(双链)RNA(dsRNA,例如siRNA和saRNA)的两个或更多个功能性寡核苷酸单元。本文还提供了包含多价寡核苷酸试剂的产品,以及使用多价寡核苷酸试剂或产品治疗疾病(例如脊髓性肌萎缩症(SMA)和癌症)的方法。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】

本公开涉及包含两个或更多个功能性寡核苷酸的多价寡核苷酸试剂,所述功能性寡核苷酸可以选自单链反义寡核苷酸(aso,例如gapmer和mixmer)和双链体(双链)rna(dsrna,例如sirna和sarna)。在一些方面中,多价寡核苷酸试剂中的功能性寡核苷酸相同或不同,具有不同的靶标或相同的靶标,和/或直接相连或通过接头相连。在一些方面,多价寡核苷酸试剂是多靶向性寡核苷酸试剂和/或具有改进的活性。本公开还涉及包含多价寡核苷酸试剂的产品(例如组合物和药物)以及使用多价寡核苷酸试剂或产品治疗疾病的方法。序列表本申请包含以计算机可读格式电子提交的序列表,且通过引用其全文方式将其纳入本文。1.
技术介绍
寡核苷酸是目前正在研发的一类新兴治疗剂,用于通过多种不同的作用机制(moa)治疗各种疾病。寡核苷酸治疗剂的主要类别包括单链反义寡核苷酸(aso)和双链体(双链)rna(dsrna)。“gapmer”形式的单链aso可用于通过rna酶h水解降解互补mrna来抑制基因表达。特征性“gapmer”aso具有rna酶h活性所需的中心dna区域和两个核糖核苷酸翼以增加靶标结合亲和力。称为“mixmer”的另一类aso具有空间位阻剂的作用,其通常完全由核糖核苷酸类似物构成并结合细胞核中的前体mrna(pre-mrna)以改变剪接。可以将双链rna分为两类,包括小干扰rna(sirna)和小激活rna(sarna);两者都需要阿尔古(argonaute,ago)蛋白以发挥作用。小干扰rna结合细胞胞质中的靶mrna,并通过称为rna干扰(rnai)的基因沉默转录后机制来下调基因表达。小激活rna具有反向功能,并通过称为rnaa(rna激活)的基因激活转录机制靶向细胞核中的调控序列(即基因启动子)来上调基因表达。许多单基因疾病是由导致基因表达水平和/或翻译的蛋白质活性不足的基因功能丧失所引起的。“mixmer”aso已成功治疗一些此类疾病,它们可通过纠正异常剪接错误而被改善。美国食品和药物管理局(fda)已批准了几种aso药物,包括名为(诺西那生(nusinersen))的外显子包含aso,用于治疗脊髓性肌萎缩症(sma),以及商品名为amondys 45(卡西门生(casimersen))的外显子排除aso,用于治疗杜氏肌营养不良症(dmd)。不幸的是,药物功效受到患者细胞中表达的目标转录本的物理量的限制。因此,并非所有患者对治疗的反应都相同。已在sma模型中测试了表观遗传修饰剂(例如hdac抑制剂),作为通过非特异性促进全局基因转录来进一步增加基因剂量的手段,以便为spinraza提供更大的目标转录本库[pagliarini,2020#2082]。然而,转录组的异常激活伴随着其自身的不利影响,并抵消了单基因疾病所需的靶向性寡核苷酸疗法的基因特异性精确度。专利技术人先前的工作展示了一种替代方法,该方法联合spinraza aso使用sarna来特异性激活靶基因转录。使用sarna处理选择性地增强了靶基因smn2的转录输出,而spinraza改变了smn2前体mrna剪接,所产生的全长smn2转录本(smn2fl)及其同源蛋白的水平超过仅施用其中任一处理时的情形。rna双链体(例如sarna)通常比aso质量更大且结构刚性更大,这完全不同地影响了它们本身的生物物理特性[crooke,2017#23;shen,2018#40]。因此,相较于单链寡核苷酸,dsrna具有其独特的生物分布和组织扩散模式。为了使aso和sarna联合治疗对单基因靶标产生协同作用,需要在相同的预期靶组织/细胞中体内富集两种药物分子。可以将两种药物形式引导至预期靶组织并提供相似分布特性的技术将增强这类联合治疗的治疗功效。因此,需要改进基于寡核苷酸的疗法来应对这些挑战。2.
技术实现思路
靶向基因调控序列(包括启动子)的双链rna(dsrna)已显示通过称为rna激活(rnaa)的机制以序列特异性方式上调靶基因转录(li,l.c.等,小dsrna在人细胞中诱导转录激活(small dsrnas induce transcriptional activation in human cells).pnas(2006))。专利技术人已在先前的工作中证明,通过与aso剪接调节剂联合治疗,可以进一步提高特定剪接变体的基因量,其超过单独进行任一处理所能达到的水平。然而,双链体rna(例如sarna)和单链aso具有不同的生物物理特性和独特的组织生物分布、扩散和细胞摄取模式。通常,aso根据给药途径扩散到整个器官组织。无需佐剂递送载剂、运载体系统或靶向偶联物,即可容易地测量细胞摄取和aso活性。另一方面,双链体rna(例如sarna、sirna和mirna)不易渗透到实体组织中,也不易穿过细胞膜。体内活性通常需要递送载剂、靶向偶联物和/或新型化学物质。为了使sarna和aso联合治疗在体内具有联合治疗作用,两种药物形式都需要进入相同的组织和/或有类似的生物分布要求。为了克服组织分布特性的固有差异,专利技术人开发了一种新型化学构建体,其在单分子内使sarna与aso剪接调节剂(例如spinraza)的共价连接。不同药物形式之间具有相同的生物物理特性,从而在不同的组织内提供统一的生物分布和广泛的活性。该化学策略经进一步扩展,并用不同的寡核苷酸药物组合进行测试,包括sarna-sarna、sarna-sirna、sarna-sarna-aso、aso-aso等。综上,这些新的构建体包含一类多效性寡核苷酸,本文中称之为多价寡核苷酸(mvo)。本公开的实施方式部分基于这样令人惊讶的发现:两个或更多个功能性寡核苷酸在共价连接时可以上调和/或下调一种或多种感兴趣的基因的表达,例如,以用于治疗与一种或多种感兴趣的基因相关的疾病或病症。在一些方面,本文提供多价寡核苷酸(mvo)试剂,其包含共价连接的两个或更多个功能性寡核苷酸,其中两个或更多个功能性寡核苷酸独立地选自:a)双链rna(dsrna);b)反义寡核苷酸(aso)。在一些实施方式中,mvo试剂增加smn2基因或蛋白质的表达。在mvo试剂的一些实施方式中,通过调节smn2 mrna剪接或稳定性(smn2 mrna调节剂),一个或多个aso增加功能性smn蛋白的产生,和/或一个或多个dsrna增加smn2基因或蛋白质的表达。在一些实施方式中,mvo试剂增加cdkn1a/p21基因或蛋白质的表达和/或减少cd274/pdl-1的表达。在mvo试剂的一些实施方式中,一个或多个dsrna独立地选自:增加cdkn1a/p21基因或蛋白质表达的sarna;和降低cd274/pdl-1表达的sirna。在一些方面,本文提供了这样的产品,其包含多价寡核苷酸试剂。在一些实施方式中,产品选自还包含至少一种药学上可接受的运载体的药物组合物或试剂盒。在一些方面,本文提供了用于疾病治疗的方法,其包括向需要这类治疗的对象给予足够量的一种或多种本文公开的多价寡核苷酸试剂或产品。例如,方法用于治疗或延迟对象中smn缺陷相关病症或p21/pdl-1相关疾病的发作或进展。本文还提供一种或多种多价寡核苷酸试剂或本文公开的产品在制备用于疾病治疗的产品中的用途。本文还提供一本文档来自技高网
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【技术保护点】

1.一种包含共价连接的两个或更多个功能性寡核苷酸的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸独立地选自:

2.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂中包含的功能性寡核苷酸的数量为2-X,其中X为3-10的整数。

3.如权利要求2所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中包含的dsRNA的数量为0-X,并且其余功能性寡核苷酸为一种或多种ASO。

4.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中

5.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸独立地调节一个或多个基因的表达,调节一种或多种蛋白质的表达(例如通过结合mRNA序列),或调节非编码调节核酸序列。

6.如权利要求5所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述非编码调节核酸序列是启动子序列、增强子、沉默子和/或转录因子。

7.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各dsRNA包含至少10个连续核苷酸的正义链和至少10个连续核苷酸的反义链。

8.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各dsRNA包含长度为10-60个核苷酸的正义链和/或各dsRNA包含长度为10-60个核苷酸的反义链。

9.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各ASO具有长度为至少5个连续核苷酸的核苷酸序列。

10.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各ASO具有长度为5-30个核苷酸的核苷酸序列。

11.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸的总长度为12-200个核苷酸。

12.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸中任意两个相邻的功能性寡核苷酸通过或不通过连接组件共价连接。

13.如权利要求12所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述连接组件选自以下接头或其衍生物:

14.如权利要求12所述的多价寡核苷酸试剂,其中,两个相邻的功能性寡核苷酸通过以下方式共价连接:

15.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个功能性寡核苷酸包含至少一个化学修饰的核苷酸。

16.如权利要求17所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述至少一个化学修饰的核苷酸的化学修饰独立地选自下组:

17.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中的各个ASO以3'到5'方向或以5'到3'方向共价连接相邻的靶向性寡核苷酸。

18.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中的各个dsRNA在其正义链或反义链的3’端或者在其正义链或反义链的5'端共价连接相邻的ASO。

19.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,两个或更多个功能性寡核苷酸的序列相同或不同;和/或两个或更多个功能性寡核苷酸的功能相同或不同。

20.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂包含:

21.如权利要求20所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述第一dsRNA、第二dsRNA和第三dsRNA在存在时独立地选自siRNA和saRNA;和/或

22.如权利要求21所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂包含选自以下的功能性寡核苷酸:

23.如权利要求20-22中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中:

24.如权利要求20所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述ASO的5’端与连接组件偶联;或者所述ASO的3’端与连接组件偶联。

25.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其包含一个或多个其他靶向性寡核苷酸。

26.如权利要求25所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述一个或多个其他靶向性寡核苷酸独立地选自:双链RNA(dsRNA)和反义寡核苷酸(ASO)。

27.如权利要求26所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述其他双链RNA(dsRNA)选自小干扰RNA(siRNA)和小激活RNA(saRNA);和/或所述一个或多个靶向性寡核苷酸独立地选自gapmer和mixmer。

28.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个ASO靶向5'-UTR。

29.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个功能性寡核苷酸增加SMN2基因或蛋白质的表达。

30.如权利要求29所述的多价寡核苷酸试剂,其中,通过调节SMN2 mRNA剪接或稳...

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】

1.一种包含共价连接的两个或更多个功能性寡核苷酸的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸独立地选自:

2.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂中包含的功能性寡核苷酸的数量为2-x,其中x为3-10的整数。

3.如权利要求2所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中包含的dsrna的数量为0-x,并且其余功能性寡核苷酸为一种或多种aso。

4.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中

5.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸独立地调节一个或多个基因的表达,调节一种或多种蛋白质的表达(例如通过结合mrna序列),或调节非编码调节核酸序列。

6.如权利要求5所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述非编码调节核酸序列是启动子序列、增强子、沉默子和/或转录因子。

7.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各dsrna包含至少10个连续核苷酸的正义链和至少10个连续核苷酸的反义链。

8.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各dsrna包含长度为10-60个核苷酸的正义链和/或各dsrna包含长度为10-60个核苷酸的反义链。

9.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各aso具有长度为至少5个连续核苷酸的核苷酸序列。

10.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,各aso具有长度为5-30个核苷酸的核苷酸序列。

11.如权利要求1所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸的总长度为12-200个核苷酸。

12.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述两个或更多个功能性寡核苷酸中任意两个相邻的功能性寡核苷酸通过或不通过连接组件共价连接。

13.如权利要求12所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述连接组件选自以下接头或其衍生物:

14.如权利要求12所述的多价寡核苷酸试剂,其中,两个相邻的功能性寡核苷酸通过以下方式共价连接:

15.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个功能性寡核苷酸包含至少一个化学修饰的核苷酸。

16.如权利要求17所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述至少一个化学修饰的核苷酸的化学修饰独立地选自下组:

17.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中的各个aso以3'到5'方向或以5'到3'方向共价连接相邻的靶向性寡核苷酸。

18.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述试剂中的各个dsrna在其正义链或反义链的3’端或者在其正义链或反义链的5'端共价连接相邻的aso。

19.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,两个或更多个功能性寡核苷酸的序列相同或不同;和/或两个或更多个功能性寡核苷酸的功能相同或不同。

20.如权利要求1-10中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂包含:

21.如权利要求20所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述第一dsrna、第二dsrna和第三dsrna在存在时独立地选自sirna和sarna;和/或

22.如权利要求21所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂包含选自以下的功能性寡核苷酸:

23.如权利要求20-22中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中:

24.如权利要求20所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述aso的5’端与连接组件偶联;或者所述aso的3’端与连接组件偶联。

25.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其包含一个或多个其他靶向性寡核苷酸。

26.如权利要求25所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述一个或多个其他靶向性寡核苷酸独立地选自:双链rna(dsrna)和反义寡核苷酸(aso)。

27.如权利要求26所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述其他双链rna(dsrna)选自小干扰rna(sirna)和小激活rna(sarna);和/或所述一个或多个靶向性寡核苷酸独立地选自gapmer和mixmer。

28.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个aso靶向5'-utr。

29.如权利要求1-24中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个功能性寡核苷酸增加smn2基因或蛋白质的表达。

30.如权利要求29所述的多价寡核苷酸试剂,其中,通过调节smn2 mrna剪接或稳定性(smn2 mrna调节剂),所述一个或多个aso增加功能性smn蛋白的产生;和/或所述一个或多个dsrna增加smn2基因或蛋白质的表达。

31.如权利要求29所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述一个或多个dsrna包括sarna,其正义链的核苷酸序列与选自以下的核苷酸序列至少90%相同:

32.如权利要求29项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述一个或多个dsrna包含sarna,其正义链和反义链的核苷酸序列对与选自以下的核苷酸序列对至少90%相同:

33.如权利要求29项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述dsrna包括sirna,其正义链的核苷酸序列与ds06-332i(seq id no:3)或sisod1-388-esc(seq id no:138)的核苷酸序列至少90%相同;和/或

34.如权利要求29项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述dsrna包括sirna,其正义链和反义链的核苷酸序列对与选自以下的核苷酸序列对至少90%相同:

35.如权利要求29所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述aso的核苷酸序列与aso10-27(seq id no:11)或5'utr aso(seq id no:142)的核苷酸序列至少90%相同。

36.如权利要求29-35中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂的核苷酸序列与选自以下的核苷酸序列至少90%相同:

37.如权利要求29-35中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂的核苷酸序列与选自以下的核苷酸序列至少90%相同:

38.如权利要求29-35中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,所述多价寡核苷酸试剂选自表7-20任一所示的那些或与其具有至少90%序列同一性,并且其中那些多价寡核苷酸试剂的连接组件和/或连接键和/或方向是可变的。

39.如权利要求1-38中任一项所述的多价寡核苷酸试剂,其中,一个或多个功能性寡核苷酸增加cdkn1a/p21基因或蛋白质的表达和/或减少cd...

【专利技术属性】
技术研发人员:李龙承姜武林
申请(专利权)人:中美瑞康核酸技术南通研究院有限公司
类型:发明
国别省市:

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