基于RNA-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法技术

本发明专利技术涉及蛋白质合成技术领域，基于RNA‑seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，包括设计三型胶原蛋白的氨基酸序列相对应的DNA序列，采用不同的内切酶对DNA模板不同插入点引入编码三型胶原蛋白DNA序列片段，获得不同插入点编辑重组后的编码基因启动子，基于RNA‑seq数据分析自动分析生成基于上述不同插入点编辑重组后的编码基因启动子基因表达结果并评估，基于评估结果，将含有对应氨基酸序列的三型胶原蛋白的启动子克隆到表达载体，并利用基因枪将上一步骤包覆后的微粒射入完全成熟种子的胚的芽端，对上一步骤射入了包覆后的微粒的芽端注入受体植入进行培养从而获得三型胶原蛋白，本发明专利技术提出的方法合成获取的三型胶原蛋白具有较低的毒性。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及蛋白质合成，具体为基于rna-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法。

技术介绍

1、胶原蛋白在哺乳动物机体中含量十分丰富，它是细胞外基质中的一种纤维状蛋白，对动物和人体皮肤、血管、筋腱和软骨的形成都十分重要，并为这些结缔组织提供一定的结构和机械力学性质，另一方面，胶原蛋白具有良好的细胞粘附性能，与细胞结合对细胞的生长，分化及迁移有一定的积极作用。此外，对血小板凝聚等也具有一定的作用，鉴于胶原蛋白固有的生物相容性、生物降解性和吸收性以及促进细胞形成等诸多功能，在生物医用材料、组织工程、化妆品和食品等领域具有广泛的应用价值，在分子结构上，胶原蛋白是由平行线型链组成，每一线型链由三条扭曲左旋的聚肽链通过链间氢键紧密结合而形成一极强的右旋三重螺旋结构，而胶原肽链的一级结构多为gly-xaa-yaa的三联体，它富含甘氨酸和脯氨酸残基；另外，还含有较多的不由dna碱基密码子编码的羟脯氨酸，它是在蛋白质一级结构序列形成之后由特定的酶——脯氨酸-4-羟化酶(p4h)作用于序列中的脯氨酸形成的，羟脯氨酸羟基通过分子间氢键对稳定胶原螺旋结构、本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.基于RNA-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的基于RNA-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于：所述步骤S2获得不同插入点启动子的具体方法为，以成熟植物的基因组DNA为模板，以三型胶原蛋白表达基因序列的引物为扩增引物对模板进行PCR反应，从而得到三型胶原蛋白基因启动子。

3.根据权利要求2所述的基于RNA-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于：所述Ⅲ型胶原蛋白基因序列的引物使用稀有切割核酸内切酶的靶向基因组修饰引入，且稀有...

【技术特征摘要】

1.基于rna-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于，包括如下步骤：

2.根据权利要求1所述的基于rna-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于：所述步骤s2获得不同插入点启动子的具体方法为，以成熟植物的基因组dna为模板，以三型胶原蛋白表达基因序列的引物为扩增引物对模板进行pcr反应，从而得到三型胶原蛋白基因启动子。

3.根据权利要求2所述的基于rna-seq数据分析的植物基因编辑获取零毒素三型胶原蛋白的方法，其特征在于：所述ⅲ型胶原蛋白基因序列的引物使用稀有切割核酸内切酶的靶向基因组修饰引入，且稀有切割核酸内切酶是转录激活因子样效应物核酸酶。

4.根据权利要求3所述的基于rna-seq数据分析的...

【专利技术属性】
技术研发人员：牛向勇，
申请(专利权)人：肌茵美信使酶生命科技上海有限公司，
类型：发明
国别省市：