【技术实现步骤摘要】
本申请涉及生物信息，特别是涉及一种rna相似度分析图计算方法、装置、设备和介质。
技术介绍
1、核糖核酸(ribonucleic acid，rna)存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。rna由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸、核糖和碱基构成。rna的碱基主要有4种，即a(腺嘌呤)、g(鸟嘌呤)、c(胞嘧啶)、u(尿嘧啶)。
2、核糖核酸在生物各项活动中发挥着重要的作用。对核糖核酸的组成和结构的探索也是当前生物学家主要的研究方向之一。核糖核酸分子存在着许多的由互补碱基对形成的茎环结构，即为rna的二级结构。其中，二级结构可细分为3’片段，5’片段，发卡环，茎，内环，多连环片段等子结构。
3、基于在rna结构相似的情况下，大概率存在功能相似的规律，生物学家主要通过分析查找rna二级结构的相似性，从而发现与目标rna有相似功能的其他rna，从而为rna功能发现、病毒治疗等提供新的发现；通过对rna二级结构的相似度进行比对，可以发现相似度不同的其他种类rna，从而进行rn...
【技术保护点】
1.一种RNA相似度分析图计算方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述被查找RNA结构图与目标RNA结构图进行相似性分析，得到第一相似度包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述多个被查找RNA子图与所述子图多个目标RNA子图，得到第一相似度包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述确定所述被查找RNA结构图中基础组成结构的数量，并基于所述被查找RNA结构图中基础组成结构的数量与所述目标RNA结构图中基础组成结构的数量，得到第二相似度包括：
5...
【技术特征摘要】
1.一种rna相似度分析图计算方法，其特征在于，所述方法包括：
2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述对所述被查找rna结构图与目标rna结构图进行相似性分析，得到第一相似度包括：
3.根据权利要求2所述的方法，其特征在于，所述基于所述多个被查找rna子图与所述子图多个目标rna子图，得到第一相似度包括：
4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于，所述确定所述被查找rna结构图中基础组成结构的数量，并基于所述被查找rna结构图中基础组成结构的数量与所述目标rna结构图中基础组成结构的数量，得到第二相似度包括：
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，采用图匹配算法确定所述被查找rna结构图以及所述目标rna结构图中各...
【专利技术属性】
技术研发人员：许增辉，唐进，张宇，陈高祥，余婷，赵进，张吉，
申请(专利权)人：之江实验室，
类型：发明
国别省市：
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