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【技术实现步骤摘要】
本专利技术涉及生物信息分析,提供了一种基于公有云的生信分析系统、方法、电子设备及存储介质。
技术介绍
1、在生物化学技术的发展中产生出许多生物分子序列数据,在这个阶段数学统计方法和计算机技术都得到较快的发展,于是促使研究人员应用计算机技术解决生物学问题,特别是与生物分子序列相关的问题。生物信息学是一个结合生物学、计算机科学和统计学来分析和解释生物数据的领域。它在基因组学、蛋白质组学和其他生物学研究领域发挥着至关重要的作用。众所周知,下一代测序(ngs)技术是生物研究进步的关键领域之一,它彻底改变了基因组学领域。ngs允许对dna和rna进行快速且具有成本效益的测序,从而研究人员能够得到大量的基因组数据。
2、因此,对得到的这些数据进行数据处理以及数据分析以此得到研究人员所需的生物信息至关重要。近年来,生物信息学技术取得了重大进展,生物信息学中使用的计算算法和软件工具也取得了很大进步。这些工具有助于分析和解释ngs技术生成的大型数据集。它们有助于完成基因组组装、基因表达分析和蛋白质结构预测等任务。现有的生信分析技术和工具在环境配置和流程上较为复杂,对生物分析人员操作的门槛要求较高,大大影响了分析人员的分析效率。
技术实现思路
1、为了解决
技术介绍
中提到的至少一个技术问题,本专利技术的目的在于提供一种基于公有云的生信分析系统、方法、电子设备及存储介质,使用户可以自行操作调整参数以及调整动态绘图结果图片展示效果,来降低生物信息分析人为操作的门槛,提高分析效率。
2
3、用户操作管理模块:用于建立预设功能单元与用户之间的交互;
4、所述预设功能单元包括分析参数设置单元、结果展示单元和任务运行状况展示单元;
5、所述分析参数设置单元:用于接收用户上传的分析数据文件以及设置的分析参数;
6、所述结果展示单元:用于根据分析数据文件以及分析参数进行任务运行;若任务运行不成功,则反馈用户根据任务错误提示在所述分析参数设置单元中重新设置分析参数并开启新的分析任务;若运行成功,则将任务结果进行存储;
7、所述任务运行状况展示单元:用于对任务运行状态进行展示;
8、交互式图片工具的图片编辑模块:用于供用户对任务结果中图片的颜色集进行编辑调整,并得到目标图片展示结果。
9、进一步地,所述交互式图片工具的图片编辑模块包括:
10、全局设置单元:用于通过字体、排版以及图例设置的方式供用户对任务结果中图片进行编辑;
11、颜色设置单元:用于通过多种预设期刊配色方案供用户改变任务结果中图片的颜色集;
12、配置项设置单元:用于供用户对任务结果中图片的图形以及文字进行增加和删减。
13、进一步地,还包括:
14、任务模块:用于通过任务列表的方式展示用户创建的任务结果集,用户通过查看任务列表得到历史运行任务状况,并通过任务列表跳转查看分析结果展示以及下载结果任务集;
15、所述任务列表包含任务编号、工具类型、工具名称、提交时间、状态和备注信息。
16、进一步地,还包括:
17、云空间存储模块:用于存储用户上传的分析数据文件以及任务运行成功后存入任务结果集的文件。
18、进一步地,所述预设功能单元还包括:
19、历史任务结果集单元,用于存储运行成功后的任务结果,供用户在所述任务运行状况展示单元中对存储的任务结果进行下载。
20、一种基于公有云的生信分析方法,包括步骤:
21、s1:建立预设功能单元与用户之间的交互;
22、所述步骤s1包括:
23、s11:接收用户上传的分析数据文件以及设置的分析参数;
24、s12:根据分析数据文件以及分析参数进行任务运行,若任务运行不成功,则反馈用户根据任务错误提示在所述分析参数设置单元中重新设置分析参数并开启新的分析任务;若运行成功,则将任务结果进行存储;
25、s13:对任务运行状态进行展示;
26、s2:对任务结果中图片的颜色集进行编辑调整,得到目标图片展示结果。
27、进一步地,所述步骤s2包括:
28、s21:通过字体、排版以及图例的设置方式来供用户对任务结果中图片进行编辑;
29、s22:通过多种预设期刊配色方案供用户改变任务结果中图片的颜色集;
30、s23:对任务结果中图片的图形以及文字进行增加和删减。
31、进一步地,还包括步骤:
32、s3:通过任务列表的方式展示用户创建的任务结果集,用户通过查看任务列表得到历史运行任务状况,并通过任务列表跳转查看分析结果展示以及下载结果任务集。
33、进一步地,还包括步骤:
34、s4:将用户上传的分析数据文件以及任务运行成功后存入任务结果集的文件进行存储。
35、进一步地,所述步骤s1还包括:
36、s14:将运行成功后的任务结果进行存储,供用户在所述步骤s13中对存储的任务结果进行下载。
37、一种电子设备,所述电子设备包括:存储器:用于存储可执行指令;处理器:用于运行所述存储器存储的可执行指令时,实现上述方案中任一项所述的基于公有云的生信分析方法。
38、一种计算机可读存储介质,存储有可执行指令所述可执行指令被处理器执行时实现上述方案中任一项所述的基于公有云的生信分析方法。
39、与现有技术相比,本专利技术的有益效果是:
40、本专利技术基于公有云建立的线上生信分析和展示系统为用户提供了操作便利的生信分析工具,生物信息学分析系统为用户提供了操作界面,通过用户操作管理模块和交互式图片工具的图片编辑模块用户可以自行调整参数以及调整动态绘图结果图片展示效果。具体的,用户在功能操作界面,上传分析数据文件并设置对应分析参数;运行开启任务并查看任务运行状态,若运行不成功,则根据任务错误提示重新设置分析参数并开启新的分析任务;最后可查看任务的结果集,还可以对任务结果中图片的颜色集进行编辑调整,实现自定义图片编辑。从而有助于降低生物信息分析人为操作的门槛,极大地简化和精简生物信息学领域的研究过程,使生物信息学专业知识有限的研究人员更容易进行分析。
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1.一种基于公有云的生信分析系统,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,所述交互式图片工具的图片编辑模块包括:
3.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,还包括:
4.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,所述预设功能单元还包括:
5.一种基于公有云的生信分析方法,其特征在于,包括步骤:
6.根据权利要求5所述的基于公有云的生信分析方法,其特征在于,所述步骤S2包括:
7.根据权利要求5所述的基于公有云的生信分析方法,其特征在于,还包括步骤:
8.根据权利要求5所述的基于公有云的生信分析方法,其特征在于,所述步骤S1还包括:
9.一种电子设备,其特征在于,所述电子设备包括:
10.一种计算机可读存储介质,存储有可执行指令,其特征在于,所述可执行指令被处理器执行时实现权利要求5至8任一项所述的基于公有云的生信分析方法。
【技术特征摘要】
1.一种基于公有云的生信分析系统,其特征在于,包括:
2.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,所述交互式图片工具的图片编辑模块包括:
3.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,还包括:
4.根据权利要求1所述的基于公有云的生信分析系统,其特征在于,所述预设功能单元还包括:
5.一种基于公有云的生信分析方法,其特征在于,包括步骤:
6.根据权利要求5所述的基...
【专利技术属性】
技术研发人员:张智闵,钟胜基,束文圣,金雪,茹德龙,钟余晓,汪龙女,袁文广,李绍春,
申请(专利权)人:广东美格基因科技有限公司,
类型:发明
国别省市:
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