一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法及其应用技术

本发明专利技术属于生物技术领域，具体公开了一种奶山羊产奶相关性状的全基因组关联分析方法及其应用。在两个西农萨能奶山羊群体中随机选择330只母羊作为全基因组关联分析的实验对象，收集其相关的产奶量、乳成分、乳房表型等性状，在泌乳期间进行血样采集，提取基因组DNA，经过检测所提取到的基因组DNA完整性、纯度及浓度，最终合格样品有298只进行重测序，然后对西农萨能奶山羊生产相关性状的7项指标进行全基因组关联分析，筛选候选基因，为今后优质奶山羊新品种选育提供理论支撑。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术属于生物育种，具体公开了一种奶山羊产奶相关性状的全基因组关联分析方法及其应用。

技术介绍

1、奶产业发展是畜牧业发展中不可或缺的一环，其发展水平对于我国畜牧业和农业发展具有重要意义。山羊奶产业作为我国具有特色的奶产业之一，目前正处于稳步发展的过程，但同时也面临着一定的困境,比如育种缺乏，种羊退化等。奶山羊的产奶性能是衡量其经济价值的重要指标，主要包括产奶量、乳成分等性状。我国奶山羊生产性能与国际相比还存在较大差距，为了摆脱当前困境，提高奶山羊生产水平，就必须对现有品种进行遗传改良和选择。而乳用家畜品种遗传改良离不开相关关键基因的发掘。随着科学技术的发展，基因组相关技术在研究动植物数量性状方面的应用愈加广泛和有效，再进一步通过基因组选择等手段，显著提高其生产性能。全基因组关联分析(gwas)作为一种有效的手段在动植物育种工作甚至人类疾病研究中的应用越来越多，它可以将重测序方法和统计学原理相结合，在全基因组范围内寻找到与目标性状关联的候选区域和基因。目前，国内外关于奶山羊产奶性状的相关基因报道较少，且缺少利用大规模测序手段对奶山羊生产相关性状的研究方本文档来自技高网...

【技术保护点】

1.一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述奶山羊选自西农萨能奶山羊。

3.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述步骤1中奶山羊的头数为300-400头，优选为330头。

4.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述步骤4基因组DNA的提取及检测中，在Illumina测序系统测序时，要进行碱基测序质量分布分析、碱基类型分布检查及将高通量测序得到的原始图像数据文件进行过滤。<...

【技术特征摘要】

1.一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，包括以下步骤：

2.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述奶山羊选自西农萨能奶山羊。

3.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述步骤1中奶山羊的头数为300-400头，优选为330头。

4.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，所述步骤4基因组dna的提取及检测中，在illumina测序系统测序时，要进行碱基测序质量分布分析、碱基类型分布检查及将高通量测序得到的原始图像数据文件进行过滤。

5.根据权利要求1所述的一种奶山羊产奶性状全基因组关联分析方法，其特征在于，步骤5测序数据质控及与参考基因组比对统计中，将测序获得的最终的序列重新定位到参考基因组上，再进行后续分析；把能定位到参考基因组上的clean-reads占总clean-reads...

【专利技术属性】
技术研发人员：石恒波，张凯，冯弈方，刘建新，
申请(专利权)人：浙江大学，
类型：发明
国别省市：