鉴定坛紫菜新品系制造技术

本发明专利技术公开了鉴定坛紫菜新品系

【技术实现步骤摘要】
鉴定坛紫菜新品系SW
‑
81(浙南1号)的SNP标记组合及其特异性引物和应用


[0001]本专利技术涉及海洋藻类的生物
，尤其是涉及鉴定坛紫菜新品系
SW
‑
81
的
SNP
标记组合及其特异性引物和应用
。

技术介绍

[0002]坛紫菜
(Pyropia haitanensis)
是一种我国特有重要经济海藻，分布于浙江
、
福建和广东三省沿海，其产量约占全国紫菜总产量的
78
％，是一种广受欢迎的海洋食品，富含蛋白质
、
多糖
、
多酚和维生素等生物活性物质，营养价值高，且紫菜蛋白质氨基酸种类齐全
、
含量丰富，同时具有抗氧化
、
降血糖和增强免疫等功能
。
近年来由于气候变化加剧和传统养殖品系退化，坛紫菜连续发生病烂，导致养殖减产，养民收入减少
。
所以优良品种的选育和应用是保障坛紫菜产业健康发展的根本
。
坛紫菜选育新品系
SW
‑
81(
浙南1号
)
具有产量高
、
品质好
、
耐高温且壳孢子放散量大等优点，适于生产上大规模栽培，有望被培育成可推广的新品种
(
费勤娇等，
2021)。
所以对其进行准确鉴定对于新品系的管理和推广具有重要意义
。
>[0003]单核苷酸多态性
SNP(single nucleotide polymorphism)
是指在基因组水平上由单个碱基的变异所引起的
DNA
序列多态性，这种变异主要是由单个碱基的转换
、
颠换所致，其数量极多
、
多态性丰富
、
具二态性
、
易于检测和统计
、
可实现高通量自动化检测
(DurstewitzG et al,2010)。
当前，
SNP
已同
SSR(simple sequence repeat)
分子标记一起作为国际植物新品种权保护联盟
(UPOV)BMT
分子测试指南中构建
DNA
指纹数据库和国内
《
植物品种鉴定
DNA
指纹方法总则
》(NY/T 2594
‑
2016)
仅有的两种推荐标记方法
。SSR
分子标记因为存在标记数量有限
、
检测数据整合困难
、
操作耗时等问题存在一定的局限性，而
SNP
分子标记基于本身优势特点可以弥补这些缺陷
。
现有技术中尚缺少能够用于鉴定坛紫菜新品系
SW
‑
81
的
SNP
标记组合及具体鉴定方法
。

技术实现思路

[0004]针对现有技术存在的不足，本专利技术的目的提供用于坛紫菜新品系
SW
‑
81
鉴定的
SNP
标记及鉴定方法，以解决上述现有技术存在的问题，通过检测坛紫菜新品系
SW
‑
81
特有的
SNP
标记，实现了坛紫菜新品系
SW
‑
81
的准确鉴别
。
[0005]所述坛紫菜新品系
SW
‑
81(Neoporphyra haitanensis)
于
2022
年
12
月
27
日保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏地址：中国科学院微生物研究所，北京市朝阳区北辰西路1号院3号，保藏编号为
CGMCC NO.45381。
[0006]为实现上述目的，本专利技术提供了如下技术方案：
[0007]本专利技术提供一种用于鉴定坛紫菜新品系
SW
‑
81
的特异性
SNP
标记组合，所述
SNP
分子标记包括如下所示的
25
个
SNP
分子标记：
[0008][0009][0010]染色体
Contig.1431
核苷酸序列如
SEQ ID NO.45
所示；
[0011]染色体
Contig.2405
核苷酸序列如
SEQ ID NO.46
所示；
[0012]染色体
Contig.5474
核苷酸序列如
SEQ ID NO.47
所示；
[0013]染色体
Contig.504
核苷酸序列如
SEQ ID NO.48
所示；
[0014]染色体
Contig.1610
核苷酸序列如
SEQ ID NO.49
所示；
[0015]染色体
Contig.2672
核苷酸序列如
SEQ ID NO.50
所示；
[0016]染色体
Contig.9
核苷酸序列如
SEQ ID NO.51
所示；
[0017]染色体
Contig.240
核苷酸序列如
SEQ ID NO.52
所示；
[0018]染色体
Contig.17
核苷酸序列如
SEQ ID NO.53
所示；
[0019]染色体
Contig.2352
核苷酸序列如
SEQ ID NO.54
所示；
[0020]染色体
Contig.2034
核苷酸序列如
SEQ ID NO.55
所示；
[0021]染色体
Contig.4811
核苷酸序列如
SEQ ID NO.56
所示；
[0022]染色体
Contig.5055
核苷酸序列如
SEQ ID NO.57
所示；
[0023]染色体
Contig.6
核苷酸序列如
SEQ ID NO.58
所示；
[0024]染色体
Contig.393
核苷酸序列如
SEQ ID NO.59
所示；
[0025]染色体
Contig.29
核苷酸序列如
SEQ ID NO.60
所示；
[0026]染色体
Contig.1254
核苷酸序列如...

【技术保护点】

【技术特征摘要】
1.
一种用于鉴定坛紫菜新品系
SW
‑
81
的特异性
SNP
标记组合，其特征在于，所述
SNP
分子标记组合包括如下所示的
25
个
SNP
分子标记：
染色体
Contig.1431
核苷酸序列如
SEQ ID NO.45
所示；染色体
Contig.2405
核苷酸序列如
SEQ ID NO.46
所示；染色体
Contig.5474
核苷酸序列如
SEQ ID NO.47
所示；染色体
Contig.504
核苷酸序列如
SEQ ID NO.48
所示；染色体
Contig.1610
核苷酸序列如
SEQ ID NO.49
所示；染色体
Contig.2672
核苷酸序列如
SEQ ID NO.50
所示；染色体
Contig.9
核苷酸序列如
SEQ ID NO.51
所示；染色体
Contig.240
核苷酸序列如
SEQ ID NO.52
所示；染色体
Contig.17
核苷酸序列如
SEQ ID NO.53
所示；染色体
Contig.2352
核苷酸序列如
SEQ ID NO.54
所示；染色体
Contig.2034
核苷酸序列如
SEQ ID NO.55
所示；染色体
Contig.4811
核苷酸序列如
SEQ ID NO.56
所示；染色体
Contig.5055
核苷酸序列如
SEQ ID NO.57
所示；染色体
Contig.6
核苷酸序列如
SEQ ID NO.58
所示；染色体
Contig.393
核苷酸序列如
SEQ ID NO.59
所示；染色体
Contig.29
核苷酸序列如
SEQ ID N...

【专利技术属性】
技术研发人员：刘颖，张鹏，王铁杆，薛峰，任鹏，陈继浓，蔡景波，吴晓雯，
申请(专利权)人：浙江省海洋水产养殖研究所，
类型：发明
国别省市：